More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1993 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  100 
 
 
344 aa  687    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  50.88 
 
 
349 aa  340  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  51.17 
 
 
349 aa  340  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2487  ferric transporter ATP-binding subunit  51.61 
 
 
353 aa  339  4e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.362569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  50.15 
 
 
348 aa  330  3e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  50.15 
 
 
348 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  49.85 
 
 
348 aa  327  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  50.87 
 
 
353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  53.02 
 
 
353 aa  324  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  50.29 
 
 
353 aa  322  9.000000000000001e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0627  ferric transporter ATP-binding subunit  52.61 
 
 
351 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  52.34 
 
 
353 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  51.48 
 
 
337 aa  317  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  50.14 
 
 
353 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  52.7 
 
 
353 aa  315  7e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  47.08 
 
 
349 aa  308  5.9999999999999995e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1099  ABC transporter related  49.27 
 
 
349 aa  306  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.18 
 
 
370 aa  305  9.000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  47.5 
 
 
384 aa  301  8.000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3117  ABC transporter-related protein  47.73 
 
 
353 aa  301  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  48.31 
 
 
350 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  45.74 
 
 
356 aa  300  3e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.54 
 
 
372 aa  296  4e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46 
 
 
359 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0011  ABC transporter related  51.19 
 
 
359 aa  294  1e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  51.3 
 
 
358 aa  293  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4319  ABC transporter-related protein  48.85 
 
 
364 aa  291  8e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.34288 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.81 
 
 
354 aa  291  2e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6577  ABC transporter related  49.2 
 
 
359 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.446279 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.54 
 
 
352 aa  289  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  49.84 
 
 
356 aa  290  4e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  46.01 
 
 
386 aa  288  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  48.73 
 
 
357 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  46.24 
 
 
358 aa  287  2e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  48.54 
 
 
362 aa  285  5e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  48.09 
 
 
357 aa  285  8e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.84 
 
 
345 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.43 
 
 
365 aa  281  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0916  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.41 
 
 
387 aa  281  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3863  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.96 
 
 
359 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  46.33 
 
 
353 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.75 
 
 
382 aa  280  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.94 
 
 
352 aa  280  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000146357  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  45.61 
 
 
353 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  42.37 
 
 
367 aa  280  4e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  48.5 
 
 
342 aa  279  4e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  46.39 
 
 
367 aa  279  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  47.27 
 
 
347 aa  279  5e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  39.71 
 
 
350 aa  278  1e-73  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  46.34 
 
 
353 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  44.61 
 
 
346 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2912  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.13 
 
 
377 aa  277  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  44.61 
 
 
346 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.72 
 
 
354 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  44.61 
 
 
346 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.87 
 
 
353 aa  276  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1109  ABC transporter related  46.33 
 
 
323 aa  276  5e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.79033  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  47.66 
 
 
344 aa  276  5e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.51 
 
 
377 aa  275  6e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.16 
 
 
357 aa  275  6e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  47.6 
 
 
360 aa  275  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  47.65 
 
 
348 aa  275  7e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1114  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.85 
 
 
376 aa  275  7e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.188638  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.27 
 
 
360 aa  275  7e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  48.51 
 
 
349 aa  275  8e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  44.13 
 
 
356 aa  275  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0889  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.52 
 
 
348 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000209161  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.17 
 
 
379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3890  ABC transporter-related protein  44.83 
 
 
354 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3852  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.85 
 
 
358 aa  275  1.0000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  46.79 
 
 
342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.13 
 
 
356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2478  thiamine transport system ATP-binding protein  45.89 
 
 
351 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  45.29 
 
 
353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.45 
 
 
380 aa  273  3e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3778  ABC transporter related  46.35 
 
 
356 aa  273  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.37317  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  45.27 
 
 
366 aa  273  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.67 
 
 
383 aa  273  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2400  ABC putrescine transporter, ATPase subunit  48.9 
 
 
334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1170  ABC transporter related  50.51 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257531  normal  0.0522399 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  41.82 
 
 
343 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.34 
 
 
349 aa  272  5.000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 
359 aa  272  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.98 
 
 
384 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  42.06 
 
 
348 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.27 
 
 
353 aa  271  1e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1568  ABC transporter related  46 
 
 
323 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2651  ABC transporter related  48.54 
 
 
348 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220335  normal  0.549326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2456  ABC transporter related  46.44 
 
 
350 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2417  ABC transporter related  46.44 
 
 
350 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.830263  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  45 
 
 
353 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.1 
 
 
423 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  45.75 
 
 
364 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  47.24 
 
 
364 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2462  ABC transporter related  46.44 
 
 
350 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  44.57 
 
 
353 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1465  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  49.51 
 
 
352 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476678  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  43.53 
 
 
381 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  45.19 
 
 
342 aa  270  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.62 
 
 
372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>