More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3778 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3778  ABC transporter related  100 
 
 
356 aa  707    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.37317  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2621  ABC transporter-related protein  85.27 
 
 
353 aa  609  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.295311  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2417  ABC transporter related  68.66 
 
 
350 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.830263  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2462  ABC transporter related  68.66 
 
 
350 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2456  ABC transporter related  68.66 
 
 
350 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  55.62 
 
 
348 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0903  ABC transporter related  55.62 
 
 
348 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0892  ABC transporter related  55.62 
 
 
348 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3680  ABC transporter related  56.27 
 
 
364 aa  381  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  50.83 
 
 
371 aa  344  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  49.01 
 
 
352 aa  342  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  50.14 
 
 
355 aa  341  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3302  ABC transporter-related protein  51.99 
 
 
334 aa  338  5.9999999999999996e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  51.06 
 
 
375 aa  337  9.999999999999999e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  51.52 
 
 
358 aa  337  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  50 
 
 
354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  47.78 
 
 
376 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  50.14 
 
 
353 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  49.58 
 
 
354 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  50.97 
 
 
355 aa  335  9e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.41 
 
 
363 aa  334  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  47.25 
 
 
363 aa  334  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  48.62 
 
 
358 aa  333  4e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  50.41 
 
 
360 aa  332  4e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  48.74 
 
 
355 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 
357 aa  332  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 
357 aa  332  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  50.41 
 
 
360 aa  332  6e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  50.14 
 
 
357 aa  332  6e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  48.08 
 
 
362 aa  332  9e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.58 
 
 
357 aa  331  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  49.58 
 
 
351 aa  331  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  49.06 
 
 
370 aa  330  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  49.31 
 
 
360 aa  331  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  48.2 
 
 
365 aa  330  3e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0377  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.8 
 
 
361 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  49.19 
 
 
366 aa  330  3e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  50.14 
 
 
360 aa  330  3e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3572  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.75 
 
 
364 aa  329  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  50.95 
 
 
364 aa  329  4e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  48.88 
 
 
354 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  50 
 
 
365 aa  329  4e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0326  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.08 
 
 
361 aa  329  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2078  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.16 
 
 
349 aa  329  5.0000000000000004e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2640  ABC transporter related  50.28 
 
 
349 aa  329  5.0000000000000004e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268682  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.87 
 
 
351 aa  328  7e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2709  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.52 
 
 
361 aa  328  7e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0398  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.52 
 
 
361 aa  328  7e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3495  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.8 
 
 
361 aa  328  8e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  49.86 
 
 
354 aa  328  8e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3706  ABC transporter related  48.48 
 
 
364 aa  328  8e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  49.86 
 
 
363 aa  328  9e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  45.9 
 
 
370 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  48.74 
 
 
356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0317  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.52 
 
 
361 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  47.04 
 
 
381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  47.9 
 
 
355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  47.65 
 
 
402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4019  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.2 
 
 
364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  50.41 
 
 
368 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  47.91 
 
 
357 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3018  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.1 
 
 
360 aa  327  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908239  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  46.49 
 
 
368 aa  326  3e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.05 
 
 
351 aa  327  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  47.91 
 
 
373 aa  327  3e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  46.48 
 
 
352 aa  327  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  48.92 
 
 
380 aa  326  3e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  48.63 
 
 
366 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  49.86 
 
 
351 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0301  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  52.08 
 
 
361 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  48.81 
 
 
374 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.87 
 
 
363 aa  326  4.0000000000000003e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  50.84 
 
 
357 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  49.31 
 
 
360 aa  326  4.0000000000000003e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  47.88 
 
 
371 aa  326  5e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3722  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.39 
 
 
360 aa  325  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  50.55 
 
 
362 aa  325  6e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3752  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.39 
 
 
360 aa  325  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2630  ABC transporter related  47.93 
 
 
372 aa  325  9e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  48.47 
 
 
355 aa  325  9e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  48.74 
 
 
353 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  47.91 
 
 
357 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  48.04 
 
 
356 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.88 
 
 
358 aa  324  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4657  ABC transporter related  50.68 
 
 
363 aa  324  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.400776  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0558  ABC transporter related  52.35 
 
 
360 aa  324  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477415  normal  0.90177 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4220  ABC transporter related  50.95 
 
 
363 aa  324  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.886813 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.88 
 
 
356 aa  323  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4721  ABC transporter related  48.02 
 
 
353 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  45.11 
 
 
367 aa  323  2e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00607  sugar ABC transporter ATP-binding protein  49.03 
 
 
365 aa  323  3e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2741  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.39 
 
 
360 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  50.14 
 
 
353 aa  323  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  48.38 
 
 
365 aa  323  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3212  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.39 
 
 
360 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.504672  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  48.74 
 
 
353 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1763  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.39 
 
 
360 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2791  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.39 
 
 
360 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  48.02 
 
 
353 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  46.76 
 
 
370 aa  323  4e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>