More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0517 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  88.73 
 
 		 359 aa  656    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  97.75 
 
 		 356 aa  709    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  100 
 
 		 356 aa  721    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  61.19 
 
 		 353 aa  449  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  61.19 
 
 		 353 aa  450  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  60.91 
 
 		 353 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  59.77 
 
 		 353 aa  431  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  60.06 
 
 		 366 aa  430  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  59.66 
 
 		 370 aa  427  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  59.21 
 
 		 353 aa  424  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  59.49 
 
 		 353 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  58.29 
 
 		 372 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  58.07 
 
 		 352 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  58.4 
 
 		 344 aa  401  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  58.36 
 
 		 352 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  57.51 
 
 		 352 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  57.22 
 
 		 352 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  55.52 
 
 		 353 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  47.61 
 
 		 372 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  47.77 
 
 		 358 aa  308  8e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  47.32 
 
 		 372 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  51.61 
 
 		 350 aa  305  5.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  46.7 
 
 		 363 aa  305  9.000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4878  ABC transporter related  47.15 
 
 		 387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.53709 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.22 
 
 		 384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  48.07 
 
 		 368 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  53.71 
 
 		 361 aa  301  9e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  46.33 
 
 		 353 aa  300  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1862  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.06 
 
 		 371 aa  300  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  49.38 
 
 		 349 aa  299  5e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3852  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.05 
 
 		 358 aa  298  9e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0758  ABC transporter related  48.49 
 
 		 365 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2147  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.46 
 
 		 371 aa  297  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  45.89 
 
 		 360 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  52.46 
 
 		 379 aa  296  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.71 
 
 		 366 aa  296  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  46.4 
 
 		 336 aa  296  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  46.65 
 
 		 329 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  46.11 
 
 		 336 aa  295  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.74 
 
 		 372 aa  294  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.69 
 
 		 373 aa  294  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.9 
 
 		 388 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  45.17 
 
 		 352 aa  293  4e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  46.8 
 
 		 329 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.9 
 
 		 388 aa  292  5e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  47.66 
 
 		 364 aa  292  5e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.9 
 
 		 388 aa  292  5e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  47.7 
 
 		 366 aa  292  6e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.22 
 
 		 372 aa  291  1e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  47.21 
 
 		 367 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  44.82 
 
 		 356 aa  291  1e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.92 
 
 		 423 aa  291  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.68 
 
 		 356 aa  290  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  49.84 
 
 		 359 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  45.69 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  47.66 
 
 		 329 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  44.48 
 
 		 363 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.13 
 
 		 354 aa  291  2e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  44.48 
 
 		 363 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  50.79 
 
 		 352 aa  290  4e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  45.61 
 
 		 365 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.87 
 
 		 373 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.45 
 
 		 381 aa  289  6e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  45.25 
 
 		 342 aa  288  8e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  47.19 
 
 		 362 aa  288  8e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  44.97 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17640  polyamine transport protein PotA  49.2 
 
 		 363 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.68 
 
 		 380 aa  288  1e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.68 
 
 		 369 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.55 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  48.87 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0810  ABC transporter, ATP-binding protein  48.77 
 
 		 370 aa  287  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5873  ABC transporter related  51.64 
 
 		 376 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  44.32 
 
 		 360 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01124  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.22 
 
 		 378 aa  286  4e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.22 
 
 		 378 aa  286  4e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1304  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.22 
 
 		 378 aa  286  4e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1246  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.22 
 
 		 378 aa  286  4e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01132  hypothetical protein  51.22 
 
 		 378 aa  286  4e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.815293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2477  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.22 
 
 		 378 aa  286  4e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0899476  normal  0.634641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  44.57 
 
 		 348 aa  286  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2840  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.01 
 
 		 372 aa  286  5e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.24 
 
 		 363 aa  286  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  44.08 
 
 		 359 aa  286  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2745  ABC transporter ATP-binding protein  47.43 
 
 		 367 aa  286  5e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.870827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.73 
 
 		 372 aa  286  5.999999999999999e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1039  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.24 
 
 		 377 aa  286  5.999999999999999e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251214  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5731  ABC transporter-related protein  47.01 
 
 		 343 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  44.07 
 
 		 363 aa  285  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  42.5 
 
 		 386 aa  285  7e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  44.89 
 
 		 329 aa  285  8e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0412984 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2521  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.87 
 
 		 378 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0234665  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2000  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  50.87 
 
 		 378 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.767612 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0820  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (putrescine)  45.82 
 
 		 382 aa  284  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768559  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1722  ABC transporter ATP-binding protein  46.63 
 
 		 329 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.109279 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0627  ferric transporter ATP-binding subunit  43.99 
 
 		 351 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0838  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  52.94 
 
 		 370 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1567  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  50.87 
 
 		 378 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000366035 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.68 
 
 		 360 aa  284  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  45.16 
 
 		 330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>