More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2478 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2478  thiamine transport system ATP-binding protein  100 
 
 		 351 aa  719    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  46.47 
 
 		 329 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  42.21 
 
 		 358 aa  280  3e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  42.05 
 
 		 364 aa  278  9e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0011  ABC transporter related  46.43 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  46.75 
 
 		 356 aa  275  8e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  45.89 
 
 		 344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  42.44 
 
 		 348 aa  272  7e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.12 
 
 		 372 aa  270  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  41.71 
 
 		 386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2487  ferric transporter ATP-binding subunit  42.77 
 
 		 353 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.362569  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.62 
 
 		 370 aa  268  7e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  45.17 
 
 		 342 aa  269  7e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.94 
 
 		 354 aa  268  1e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.82 
 
 		 353 aa  267  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  41.91 
 
 		 399 aa  267  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  54.2 
 
 		 363 aa  267  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.08 
 
 		 370 aa  267  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4913  ABC transporter related  41.93 
 
 		 353 aa  267  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.801745 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1788  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 		 370 aa  266  2.9999999999999995e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0627  ferric transporter ATP-binding subunit  44.62 
 
 		 351 aa  266  4e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  43.48 
 
 		 356 aa  266  4e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0183  ABC transporter related  45.86 
 
 		 365 aa  266  5e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  54.43 
 
 		 353 aa  266  5.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  50.4 
 
 		 348 aa  265  8e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  44.17 
 
 		 372 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  44.24 
 
 		 376 aa  264  2e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  41.28 
 
 		 348 aa  263  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  45.37 
 
 		 353 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  44.95 
 
 		 372 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  42.81 
 
 		 357 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  46.04 
 
 		 353 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  40.47 
 
 		 336 aa  263  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  43.07 
 
 		 357 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  42.19 
 
 		 349 aa  263  4e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  46.45 
 
 		 356 aa  263  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  41.88 
 
 		 349 aa  263  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  42.24 
 
 		 355 aa  263  4e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  41.95 
 
 		 355 aa  262  6e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.45 
 
 		 356 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  46.53 
 
 		 348 aa  262  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  42.21 
 
 		 352 aa  261  8.999999999999999e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  48.61 
 
 		 370 aa  261  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  44.41 
 
 		 342 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1109  ABC transporter related  43.77 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.79033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6870  ABC transporter related  40.57 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.84 
 
 		 345 aa  260  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  43.84 
 
 		 357 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  42.2 
 
 		 341 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  44.65 
 
 		 356 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.9 
 
 		 352 aa  259  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  40.76 
 
 		 336 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  51.68 
 
 		 366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  42.04 
 
 		 353 aa  259  5.0000000000000005e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4396  ABC transporter related protein  50.2 
 
 		 385 aa  259  5.0000000000000005e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.510739  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4799  ABC transporter related  41.64 
 
 		 363 aa  259  6e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.79 
 
 		 329 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1229  ABC transporter related  46.48 
 
 		 370 aa  259  6e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000135939  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  40.53 
 
 		 374 aa  259  7e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  42.3 
 
 		 369 aa  259  7e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2751  ABC transporter related protein  41.62 
 
 		 383 aa  258  7e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.450304  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0285  ABC transporter related  41.06 
 
 		 334 aa  258  8e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0897858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  45.37 
 
 		 353 aa  258  9e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  42.49 
 
 		 363 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6271  ABC transporter related  41.49 
 
 		 356 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0482396  normal  0.559983 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.48 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  43.38 
 
 		 350 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.16 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4660  ABC transporter related  44.24 
 
 		 347 aa  258  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4280  ABC transporter related  44.17 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  42.17 
 
 		 363 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  42.86 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1568  ABC transporter related  41.06 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  48.87 
 
 		 367 aa  257  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  44.48 
 
 		 367 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  43.34 
 
 		 353 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.55 
 
 		 372 aa  257  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.11 
 
 		 423 aa  257  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3690  sulphate transport system permease protein 1  40.06 
 
 		 355 aa  256  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5537  ABC transporter related  44.58 
 
 		 366 aa  257  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2540  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  43.6 
 
 		 364 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534677 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  47.46 
 
 		 343 aa  256  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  52.89 
 
 		 362 aa  256  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.34 
 
 		 373 aa  256  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5168  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.5 
 
 		 329 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2056  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.64 
 
 		 355 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.938805  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5873  ABC transporter related  47.42 
 
 		 376 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  40.9 
 
 		 365 aa  256  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4444  ABC transporter related  44.48 
 
 		 359 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.36 
 
 		 362 aa  256  5e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.36 
 
 		 373 aa  256  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  41.64 
 
 		 339 aa  256  6e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.79 
 
 		 353 aa  255  7e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  42.12 
 
 		 352 aa  255  7e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  41.5 
 
 		 329 aa  255  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6545  ABC transporter related  41.04 
 
 		 351 aa  255  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.423857 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5731  ABC transporter-related protein  41.25 
 
 		 343 aa  255  8e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  41.5 
 
 		 326 aa  255  9e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0077  ABC transporter related  49.08 
 
 		 347 aa  255  9e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0473465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1186  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.04 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>