More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4319 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4319  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 364 aa  730    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.34288 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  58.16 
 
 		 353 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  58.16 
 
 		 353 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  57.57 
 
 		 353 aa  364  1e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  60.56 
 
 		 353 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  55.52 
 
 		 350 aa  362  4e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  58.93 
 
 		 353 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  54.62 
 
 		 337 aa  350  3e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3117  ABC transporter-related protein  53.1 
 
 		 353 aa  346  3e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  56.6 
 
 		 353 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1099  ABC transporter related  54.71 
 
 		 349 aa  315  7e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  46.11 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  47.8 
 
 		 356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  45.59 
 
 		 366 aa  291  8e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  48.85 
 
 		 344 aa  291  8e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0758  ABC transporter related  46.9 
 
 		 365 aa  286  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  47.48 
 
 		 364 aa  285  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  44.86 
 
 		 360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2487  ferric transporter ATP-binding subunit  49.84 
 
 		 353 aa  282  6.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.362569  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  42.86 
 
 		 356 aa  281  9e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  44.57 
 
 		 360 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  44.57 
 
 		 360 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  48.52 
 
 		 348 aa  280  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  47.42 
 
 		 348 aa  278  8e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  49.15 
 
 		 358 aa  278  9e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  44.57 
 
 		 360 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  44.57 
 
 		 360 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3680  ABC transporter related  53.21 
 
 		 364 aa  278  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  48.72 
 
 		 348 aa  276  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  44.09 
 
 		 363 aa  276  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0627  ferric transporter ATP-binding subunit  48.23 
 
 		 351 aa  275  8e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  48.23 
 
 		 349 aa  275  9e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.13 
 
 		 363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  46.48 
 
 		 384 aa  273  3e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0225  ABC transporter related  47.57 
 
 		 349 aa  273  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.676299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.56 
 
 		 366 aa  273  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  48.47 
 
 		 347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  44.02 
 
 		 363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  47.59 
 
 		 349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  41.69 
 
 		 348 aa  272  6e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.66 
 
 		 423 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0011  ABC transporter related  42.98 
 
 		 359 aa  272  9e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  45.22 
 
 		 342 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2912  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.5 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  45.86 
 
 		 342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  48.59 
 
 		 353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  48.1 
 
 		 367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  44.8 
 
 		 341 aa  269  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  44.51 
 
 		 349 aa  268  1e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  40.3 
 
 		 367 aa  267  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4710  ABC transporter related  44.07 
 
 		 359 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0388309 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.29 
 
 		 388 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.29 
 
 		 388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.29 
 
 		 388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3852  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.28 
 
 		 358 aa  265  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  48.24 
 
 		 352 aa  265  1e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.42 
 
 		 373 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0655  ABC transporter related  49.5 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.22105 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.74 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  40.57 
 
 		 353 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  41.14 
 
 		 353 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6502  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.02 
 
 		 351 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2302  ABC transporter related  45.95 
 
 		 357 aa  263  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.996895  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1525  ABC transporter, ATP-binding protein  44.38 
 
 		 337 aa  263  4e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1581  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.45 
 
 		 352 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2218  ABC transporter related  44.38 
 
 		 337 aa  263  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.905412 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3205  ABC transporter related  44.35 
 
 		 339 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1620  ABC transporter, ATP-binding protein  44.06 
 
 		 337 aa  262  6e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  45.45 
 
 		 342 aa  262  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.89 
 
 		 362 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3228  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.53 
 
 		 377 aa  262  8.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.999114  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01398  predicted spermidine/putrescine transporter subunit  44.06 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2205  ABC transporter related protein  44.06 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0635476  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  42.5 
 
 		 377 aa  261  1e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  42.66 
 
 		 372 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01409  hypothetical protein  44.06 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1733  ABC transporter, ATP-binding protein  44.06 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000359777 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2056  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 		 355 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.938805  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.27 
 
 		 352 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1124  sulphate transport system permease protein 1  46.13 
 
 		 352 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  43.86 
 
 		 341 aa  260  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1604  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.13 
 
 		 352 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96838  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  40.23 
 
 		 373 aa  260  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0164  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.73 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.04 
 
 		 354 aa  260  3e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2046  ABC transporter, ATP-binding protein  44.06 
 
 		 337 aa  260  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000987436 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.41 
 
 		 359 aa  259  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.48 
 
 		 352 aa  259  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2456  ABC transporter related  48.99 
 
 		 350 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0376  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45 
 
 		 380 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000938132  hitchhiker  0.00113993 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2417  ABC transporter related  48.99 
 
 		 350 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.830263  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2462  ABC transporter related  48.99 
 
 		 350 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  47.32 
 
 		 372 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  43.27 
 
 		 356 aa  259  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2168  ABC transporter related  42.77 
 
 		 355 aa  259  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.184244  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1500  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.81 
 
 		 352 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823264  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  45.7 
 
 		 353 aa  259  6e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.39 
 
 		 370 aa  259  6e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4742  ABC sulfate transporter, ATPase subunit  45.48 
 
 		 352 aa  259  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0517835  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1633  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.39 
 
 		 353 aa  259  7e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>