More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2487 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2487  ferric transporter ATP-binding subunit  100 
 
 
353 aa  731    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.362569  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  83.57 
 
 
349 aa  612  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  83.29 
 
 
349 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  79.31 
 
 
348 aa  582  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  78.45 
 
 
348 aa  578  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  78.16 
 
 
348 aa  580  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0627  ferric transporter ATP-binding subunit  66.09 
 
 
351 aa  465  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  65.96 
 
 
349 aa  442  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  51.61 
 
 
344 aa  339  4e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1099  ABC transporter related  49.42 
 
 
349 aa  309  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  46.78 
 
 
337 aa  306  3e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  49.85 
 
 
353 aa  306  5.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  49.85 
 
 
353 aa  305  8.000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  46.87 
 
 
352 aa  301  8.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  44.57 
 
 
352 aa  300  3e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3117  ABC transporter-related protein  49.68 
 
 
353 aa  299  5e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.16 
 
 
353 aa  298  8e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.91 
 
 
370 aa  298  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  48.58 
 
 
353 aa  296  4e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  50.32 
 
 
353 aa  295  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  49.38 
 
 
353 aa  293  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.92 
 
 
372 aa  293  4e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.97 
 
 
359 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0897  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.48 
 
 
358 aa  289  5.0000000000000004e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 
353 aa  289  6e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  49.84 
 
 
353 aa  289  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  47.04 
 
 
353 aa  289  7e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.56 
 
 
372 aa  288  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.77 
 
 
352 aa  287  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.58 
 
 
359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1114  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.68 
 
 
376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.188638  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  45.37 
 
 
374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  44.14 
 
 
356 aa  283  4.0000000000000003e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  42.69 
 
 
346 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  42.69 
 
 
346 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  42.69 
 
 
346 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4319  ABC transporter-related protein  49.84 
 
 
364 aa  282  6.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.34288 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0011  ABC transporter related  47.15 
 
 
359 aa  282  8.000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  43.95 
 
 
364 aa  282  8.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0889  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.54 
 
 
348 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000209161  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 
353 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  46.03 
 
 
358 aa  280  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  47.72 
 
 
339 aa  280  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.08 
 
 
349 aa  280  3e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  44.64 
 
 
356 aa  279  4e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  55 
 
 
350 aa  279  5e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  47.4 
 
 
356 aa  279  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  42.77 
 
 
352 aa  279  6e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.66 
 
 
383 aa  278  8e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  44.19 
 
 
348 aa  278  8e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  45.42 
 
 
339 aa  278  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1170  ABC transporter related  48.64 
 
 
347 aa  278  1e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257531  normal  0.0522399 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.84 
 
 
345 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2514  ABC transporter related protein  44.29 
 
 
405 aa  278  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  48.07 
 
 
353 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.78 
 
 
354 aa  276  4e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  48.93 
 
 
353 aa  276  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.61 
 
 
363 aa  276  5e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  48.78 
 
 
386 aa  275  6e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.91 
 
 
356 aa  275  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.27 
 
 
368 aa  275  8e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1009  ABC transporter related  46.25 
 
 
347 aa  275  8e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.000145276 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  45.25 
 
 
342 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1646  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.65 
 
 
363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7682  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  41.18 
 
 
379 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.3686 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  43.15 
 
 
350 aa  273  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  47.72 
 
 
353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  52.21 
 
 
372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  39.77 
 
 
357 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.96 
 
 
359 aa  273  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.28 
 
 
373 aa  273  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3016  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.34 
 
 
384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  42.78 
 
 
366 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5505  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.33 
 
 
362 aa  272  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0976565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  47.02 
 
 
342 aa  272  7e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.56 
 
 
373 aa  272  7e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.05 
 
 
408 aa  272  7e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.48 
 
 
377 aa  272  8.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.5 
 
 
352 aa  271  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000146357  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.22 
 
 
352 aa  271  1e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  41.86 
 
 
353 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6346  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  40.06 
 
 
384 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.06 
 
 
384 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888136  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2997  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.06 
 
 
384 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412177  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.73 
 
 
354 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2813  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  39.94 
 
 
384 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  43.73 
 
 
368 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.55 
 
 
380 aa  271  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  41.19 
 
 
376 aa  271  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  39.07 
 
 
329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  43.03 
 
 
332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  42.25 
 
 
357 aa  269  4e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  43.26 
 
 
360 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  43.89 
 
 
367 aa  269  5e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  45.11 
 
 
344 aa  269  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2478  thiamine transport system ATP-binding protein  42.77 
 
 
351 aa  269  5.9999999999999995e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2912  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.15 
 
 
377 aa  268  7e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  42.49 
 
 
353 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1587  ABC transporter related  44.89 
 
 
366 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0838  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.25 
 
 
370 aa  268  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>