More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2695 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  100 
 
 
374 aa  735    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  58.95 
 
 
352 aa  385  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  54.64 
 
 
352 aa  379  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0462  ABC transporter related protein  57.65 
 
 
363 aa  368  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0150291  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2514  ABC transporter related protein  54.09 
 
 
405 aa  370  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
363 aa  312  4.999999999999999e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  49.71 
 
 
384 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.17 
 
 
382 aa  311  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2912  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  50.3 
 
 
377 aa  300  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.1 
 
 
423 aa  300  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1788  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.86 
 
 
370 aa  298  8e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.3 
 
 
382 aa  297  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  47.87 
 
 
386 aa  296  5e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2840  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.25 
 
 
372 aa  295  8e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.45 
 
 
370 aa  294  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.52 
 
 
388 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.52 
 
 
388 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.8 
 
 
388 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  48.94 
 
 
344 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.23 
 
 
373 aa  291  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07860  putative ATP-binding component of ABC transporter  47.08 
 
 
369 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131341 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  43.21 
 
 
376 aa  290  4e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  46.85 
 
 
352 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0445  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.4 
 
 
374 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0411  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  46.4 
 
 
374 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  46.85 
 
 
352 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.72 
 
 
372 aa  288  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  51.36 
 
 
387 aa  288  1e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.78 
 
 
372 aa  287  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1366  putative putrescine transport ATP-binding protein  44.55 
 
 
373 aa  287  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0442  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.11 
 
 
374 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.826065  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  50.63 
 
 
341 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  46.85 
 
 
352 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0838  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.05 
 
 
370 aa  286  4e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4791  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.11 
 
 
374 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.5 
 
 
359 aa  286  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7799  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.24 
 
 
384 aa  285  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.47 
 
 
372 aa  285  7e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17640  polyamine transport protein PotA  47.4 
 
 
363 aa  285  8e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.29 
 
 
352 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  47.83 
 
 
377 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.37 
 
 
380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2487  ferric transporter ATP-binding subunit  45.37 
 
 
353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.362569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  50.66 
 
 
381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0747  ABC transporter ATP-binding protein  45.03 
 
 
369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  50 
 
 
368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4042  ABC transporter related  50.78 
 
 
360 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643948  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  44.79 
 
 
353 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  44.85 
 
 
353 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6039  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.2 
 
 
395 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  hitchhiker  0.00935557 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.08 
 
 
366 aa  282  7.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  46.56 
 
 
356 aa  282  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  44.93 
 
 
369 aa  281  9e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0164  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.68 
 
 
379 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5898  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.94 
 
 
371 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.81 
 
 
356 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.86 
 
 
354 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.12 
 
 
399 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.93 
 
 
355 aa  281  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3927  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.4 
 
 
381 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.61 
 
 
373 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.9 
 
 
402 aa  281  2e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2941  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.53 
 
 
388 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4615  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.15 
 
 
374 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0376  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.85 
 
 
380 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000938132  hitchhiker  0.00113993 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0289  ABC transporter ATP-binding protein  46.77 
 
 
370 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3469  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  45.22 
 
 
393 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.647978 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2987  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.03 
 
 
366 aa  280  4e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238574  normal  0.74415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0023  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.41 
 
 
447 aa  279  5e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0562  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 
374 aa  279  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4003  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.69 
 
 
365 aa  279  6e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.15 
 
 
365 aa  279  6e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.12 
 
 
356 aa  279  7e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  46.25 
 
 
359 aa  278  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  45.85 
 
 
359 aa  278  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
353 aa  278  8e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5125  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.45 
 
 
374 aa  278  8e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0754257  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.37 
 
 
378 aa  278  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  41.14 
 
 
365 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  46.06 
 
 
364 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  47.53 
 
 
359 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.89 
 
 
383 aa  277  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.04 
 
 
380 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0661243  hitchhiker  0.000000930284 
 
 
-
 
NC_004310  BR1611  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.44 
 
 
381 aa  277  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.66 
 
 
355 aa  276  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.29 
 
 
374 aa  276  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.67 
 
 
380 aa  277  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1497  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.89 
 
 
383 aa  276  4e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  46.65 
 
 
356 aa  276  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.87 
 
 
353 aa  276  5e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3852  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.35 
 
 
358 aa  276  5e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.74 
 
 
353 aa  276  5e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  48.7 
 
 
389 aa  276  5e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  44.54 
 
 
363 aa  275  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  45.87 
 
 
361 aa  276  6e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1531  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.17 
 
 
353 aa  275  8e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  43.92 
 
 
348 aa  275  8e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.67 
 
 
353 aa  275  8e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.28 
 
 
372 aa  275  9e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  42.63 
 
 
367 aa  275  9e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>