More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5505 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5505  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  100 
 
 
362 aa  732    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0976565 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  49.31 
 
 
384 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1222  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.58 
 
 
363 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.43 
 
 
372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1641  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  56.49 
 
 
372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.82 
 
 
353 aa  303  4.0000000000000003e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.34 
 
 
370 aa  302  7.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0424  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.52 
 
 
368 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  48.48 
 
 
353 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.76 
 
 
373 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2815  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.19 
 
 
381 aa  295  6e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1117  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.72 
 
 
367 aa  295  9e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.417968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2840  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.98 
 
 
372 aa  295  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.48 
 
 
355 aa  294  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  50.47 
 
 
347 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.71 
 
 
399 aa  293  4e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  45.48 
 
 
364 aa  293  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  48.29 
 
 
368 aa  292  5e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4770  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.25 
 
 
395 aa  291  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  45.43 
 
 
358 aa  291  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.54 
 
 
352 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.1 
 
 
352 aa  290  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000146357  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  53.26 
 
 
364 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1061  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.44 
 
 
366 aa  290  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.15 
 
 
359 aa  289  6e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.09 
 
 
360 aa  288  7e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.96 
 
 
382 aa  288  8e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  44.75 
 
 
384 aa  288  9e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.22 
 
 
382 aa  288  1e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.40128  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0593  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.36 
 
 
360 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2912  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  52.01 
 
 
377 aa  288  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2056  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  47.63 
 
 
355 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.938805  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1148  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.85 
 
 
364 aa  287  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.38 
 
 
383 aa  287  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 
356 aa  286  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  45.35 
 
 
356 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2805  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.26 
 
 
381 aa  286  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.94 
 
 
357 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  48.15 
 
 
359 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1143  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.85 
 
 
364 aa  286  5e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17640  polyamine transport protein PotA  47.84 
 
 
363 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  55.77 
 
 
352 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2168  ABC transporter related  47.32 
 
 
355 aa  285  8e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.184244  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.21 
 
 
382 aa  285  8e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.67 
 
 
373 aa  285  8e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  45.65 
 
 
381 aa  285  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  55.22 
 
 
363 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0872  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.66 
 
 
385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  46.07 
 
 
352 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3621  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.76 
 
 
340 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.247343 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  43.77 
 
 
359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  42.58 
 
 
352 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  50.35 
 
 
372 aa  284  1.0000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.2 
 
 
365 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  46.07 
 
 
352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  41.96 
 
 
356 aa  283  2.0000000000000002e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  44.26 
 
 
356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.13 
 
 
423 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.14 
 
 
349 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  50.82 
 
 
344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  43.89 
 
 
359 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1234  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  44.85 
 
 
367 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0541634  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0662  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.97 
 
 
347 aa  282  5.000000000000001e-75  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  45.88 
 
 
356 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4133  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.93 
 
 
346 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  43.7 
 
 
348 aa  281  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0897  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.89 
 
 
358 aa  281  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  43.54 
 
 
352 aa  281  1e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  45.94 
 
 
337 aa  281  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  43.33 
 
 
357 aa  281  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0838  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.69 
 
 
370 aa  281  1e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  42.94 
 
 
367 aa  281  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2303  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.42 
 
 
381 aa  281  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  48.86 
 
 
367 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3927  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.95 
 
 
381 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1611  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.79 
 
 
381 aa  279  4e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.34 
 
 
372 aa  279  4e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.76 
 
 
380 aa  279  4e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 
363 aa  279  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0376  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.42 
 
 
380 aa  279  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000938132  hitchhiker  0.00113993 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  47.35 
 
 
366 aa  279  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.58 
 
 
388 aa  279  5e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.58 
 
 
388 aa  279  5e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.94 
 
 
374 aa  279  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.3 
 
 
388 aa  278  7e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.82 
 
 
348 aa  278  8e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000472739  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  55 
 
 
353 aa  278  8e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  46.39 
 
 
369 aa  278  9e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  43.25 
 
 
365 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.44 
 
 
367 aa  278  1e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.85 
 
 
373 aa  278  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
353 aa  277  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.02 
 
 
359 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  42.46 
 
 
356 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  43.58 
 
 
348 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1849  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.71 
 
 
381 aa  277  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 
343 aa  277  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3307  ABC transporter related  56.54 
 
 
350 aa  277  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0756989 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  42.94 
 
 
362 aa  277  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  47.15 
 
 
360 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>