More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0947 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  100 
 
 		 352 aa  699    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  95.16 
 
 		 352 aa  667    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  95.16 
 
 		 352 aa  666    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  63.82 
 
 		 353 aa  448  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  63.53 
 
 		 353 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  63.82 
 
 		 353 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  60.97 
 
 		 353 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  66.29 
 
 		 344 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  60.11 
 
 		 353 aa  428  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  61.25 
 
 		 353 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  58.57 
 
 		 352 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  59.21 
 
 		 359 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  58.36 
 
 		 356 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  59.38 
 
 		 370 aa  403  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  58.72 
 
 		 372 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  59.83 
 
 		 366 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  58.36 
 
 		 356 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.11 
 
 		 353 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  52.32 
 
 		 349 aa  314  9.999999999999999e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  51.27 
 
 		 363 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  47.73 
 
 		 359 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  47.74 
 
 		 363 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  46.59 
 
 		 359 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  46.59 
 
 		 356 aa  306  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4878  ABC transporter related  52.32 
 
 		 387 aa  306  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.53709 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  52.8 
 
 		 350 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  50.92 
 
 		 328 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  50.29 
 
 		 353 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  46.22 
 
 		 358 aa  302  7.000000000000001e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  54.04 
 
 		 364 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  46.61 
 
 		 356 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  49.7 
 
 		 331 aa  298  7e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  56.07 
 
 		 361 aa  296  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  46.44 
 
 		 356 aa  294  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  48.77 
 
 		 331 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  51.1 
 
 		 360 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000765  ABC transporter, ATP-binding protein  50.3 
 
 		 368 aa  293  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04880  ABC-type spermidine/putrescine transport system ATPase component  50.3 
 
 		 368 aa  293  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0750  ABC transporter related  48.93 
 
 		 330 aa  293  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  47.97 
 
 		 330 aa  292  5e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0730  ABC transporter related  47.26 
 
 		 330 aa  292  6e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0810  ABC transporter, ATP-binding protein  48.62 
 
 		 370 aa  292  6e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  48.5 
 
 		 329 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  49.37 
 
 		 360 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  45.07 
 
 		 348 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5873  ABC transporter related  52.15 
 
 		 376 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.6 
 
 		 355 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3852  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.2 
 
 		 358 aa  290  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  45.76 
 
 		 363 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  49.53 
 
 		 356 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  49.37 
 
 		 360 aa  289  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  45.76 
 
 		 363 aa  289  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  49.37 
 
 		 360 aa  289  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.07 
 
 		 363 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  48.06 
 
 		 352 aa  288  1e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  50 
 
 		 368 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0544  ABC transporter, ATP-binding protein  48.81 
 
 		 403 aa  288  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0891201  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  49.05 
 
 		 352 aa  287  2e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  46.22 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.5 
 
 		 329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  48.05 
 
 		 329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4379  ABC transporter related  44.79 
 
 		 355 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  46.85 
 
 		 374 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.96 
 
 		 360 aa  286  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.47 
 
 		 373 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5505  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  55.77 
 
 		 362 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0976565 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.38 
 
 		 355 aa  285  5.999999999999999e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.54 
 
 		 379 aa  285  8e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1114  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.03 
 
 		 376 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.188638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  48.73 
 
 		 360 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  48.73 
 
 		 360 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  46.3 
 
 		 364 aa  285  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.48 
 
 		 423 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  46.39 
 
 		 366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  41.48 
 
 		 362 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2745  ABC transporter ATP-binding protein  46.65 
 
 		 367 aa  283  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.870827  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.38 
 
 		 355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  44.96 
 
 		 363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.33 
 
 		 408 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2056  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.58 
 
 		 355 aa  282  7.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.938805  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  47.47 
 
 		 342 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  52.44 
 
 		 379 aa  281  9e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  44.77 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  47.06 
 
 		 357 aa  281  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  50.5 
 
 		 367 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  44.77 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5610  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.29 
 
 		 360 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.65 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  47.4 
 
 		 353 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0011  ABC transporter related  42.41 
 
 		 359 aa  280  3e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2168  ABC transporter related  44.28 
 
 		 355 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.184244  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  48.28 
 
 		 348 aa  279  5e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0758  ABC transporter related  49.52 
 
 		 365 aa  279  5e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  49.35 
 
 		 346 aa  279  6e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  49.35 
 
 		 346 aa  279  6e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  49.35 
 
 		 346 aa  279  6e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8306  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.46 
 
 		 347 aa  278  7e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.646948  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  48.93 
 
 		 329 aa  279  7e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  46.42 
 
 		 346 aa  278  7e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.42 
 
 		 354 aa  278  7e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>