More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0750 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0730  ABC transporter related  94.85 
 
 		 330 aa  634    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0750  ABC transporter related  100 
 
 		 330 aa  669    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  77.27 
 
 		 330 aa  520  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  70.69 
 
 		 331 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  69.18 
 
 		 331 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  70.91 
 
 		 329 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  68.88 
 
 		 329 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  69.39 
 
 		 329 aa  447  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  67.48 
 
 		 329 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  68.28 
 
 		 328 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  67.48 
 
 		 329 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1722  ABC transporter ATP-binding protein  71.3 
 
 		 329 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.109279 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  70.61 
 
 		 329 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  59.63 
 
 		 339 aa  391  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0755  ABC transporter, ATP-binding protein  58.48 
 
 		 329 aa  374  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.547928  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  57.54 
 
 		 339 aa  374  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1101  ABC transport system ATP-binding protein  54.41 
 
 		 333 aa  358  7e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0832  ABC transporter, ATP-binding protein  58.75 
 
 		 317 aa  340  2e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.43 
 
 		 353 aa  300  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  47.24 
 
 		 353 aa  298  9e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  47.24 
 
 		 353 aa  296  4e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  48.8 
 
 		 344 aa  295  7e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  45.87 
 
 		 353 aa  293  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.24 
 
 		 353 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.93 
 
 		 353 aa  293  3e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  48.93 
 
 		 352 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  46.63 
 
 		 353 aa  292  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  46.93 
 
 		 353 aa  291  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  48.16 
 
 		 352 aa  291  8e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  47.85 
 
 		 352 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  48.77 
 
 		 366 aa  288  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.73 
 
 		 352 aa  285  5.999999999999999e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  46.89 
 
 		 349 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.79 
 
 		 372 aa  284  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.93 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  46.57 
 
 		 342 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  46.04 
 
 		 356 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  48.45 
 
 		 333 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.65 
 
 		 370 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.75 
 
 		 356 aa  275  8e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  48.11 
 
 		 333 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  48.11 
 
 		 366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  47.77 
 
 		 333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  48.11 
 
 		 333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  47.77 
 
 		 333 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  50.18 
 
 		 372 aa  272  6e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1474  ABC transporter related protein  47.12 
 
 		 337 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00799241  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.53 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  45.22 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.95 
 
 		 362 aa  270  2e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4799  ABC transporter related  42.49 
 
 		 363 aa  269  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102455  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  47.42 
 
 		 333 aa  269  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  44.63 
 
 		 363 aa  269  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  45.91 
 
 		 342 aa  268  8e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.87 
 
 		 373 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  46.06 
 
 		 377 aa  266  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5470  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.23 
 
 		 364 aa  265  5.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.867721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2476  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.02 
 
 		 377 aa  264  1e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.615862  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.27 
 
 		 346 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00860  putrescine transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  42.74 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00866  hypothetical protein  42.74 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2787  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.74 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0958  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.74 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  47.12 
 
 		 348 aa  264  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0883  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.02 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.898473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1464  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  46.33 
 
 		 350 aa  264  2e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1011  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.02 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.512048 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2745  ABC transporter ATP-binding protein  55.83 
 
 		 367 aa  264  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.870827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2741  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.74 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.252768  normal  0.41994 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  51.46 
 
 		 349 aa  263  3e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0897  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.19 
 
 		 358 aa  263  4e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0927  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.46 
 
 		 377 aa  263  4e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.45 
 
 		 377 aa  262  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.45 
 
 		 377 aa  262  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.45 
 
 		 377 aa  262  6e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3616  ABC transporter related  42.09 
 
 		 356 aa  262  6.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 349 aa  262  6.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  47.1 
 
 		 356 aa  262  6.999999999999999e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1369  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.45 
 
 		 377 aa  262  6.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1007  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.24 
 
 		 327 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2147  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  50 
 
 		 371 aa  261  8.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2286  putrescine transporter ATP-binding subunit  45.6 
 
 		 377 aa  261  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  46.11 
 
 		 379 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  44.12 
 
 		 352 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0915  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.9 
 
 		 377 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1031  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.9 
 
 		 377 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1407  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.5 
 
 		 370 aa  260  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.890613  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  43.11 
 
 		 372 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1453  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.5 
 
 		 368 aa  260  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2366  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.52 
 
 		 367 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1201  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.24 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1157  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.58 
 
 		 372 aa  260  2e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.602801  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0951  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.9 
 
 		 377 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  46.98 
 
 		 336 aa  260  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4007  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.58 
 
 		 327 aa  260  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124331  hitchhiker  0.00000000114894 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  45.91 
 
 		 375 aa  259  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  43.11 
 
 		 372 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  43.77 
 
 		 356 aa  259  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  46.69 
 
 		 332 aa  259  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  46.4 
 
 		 348 aa  259  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>