More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0832 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0832  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
317 aa  632  1e-180  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0755  ABC transporter, ATP-binding protein  96.52 
 
 
329 aa  561  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.547928  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1101  ABC transport system ATP-binding protein  70.3 
 
 
333 aa  395  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  56.91 
 
 
331 aa  371  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0750  ABC transporter related  58.75 
 
 
330 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  60.61 
 
 
329 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  57.76 
 
 
328 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.53 
 
 
329 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  56.58 
 
 
331 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0730  ABC transporter related  58.09 
 
 
330 aa  365  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  58.19 
 
 
329 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  56.91 
 
 
329 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  57.57 
 
 
329 aa  362  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  58.88 
 
 
329 aa  359  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  56.91 
 
 
330 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1722  ABC transporter ATP-binding protein  57.24 
 
 
329 aa  346  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.109279 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  53.9 
 
 
339 aa  333  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  54.69 
 
 
339 aa  333  3e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  48.11 
 
 
353 aa  296  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.19 
 
 
352 aa  294  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  47.19 
 
 
353 aa  293  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.88 
 
 
353 aa  291  7e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  46.23 
 
 
353 aa  291  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  46.23 
 
 
353 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.88 
 
 
353 aa  289  5.0000000000000004e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.48 
 
 
356 aa  286  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  46.71 
 
 
356 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.71 
 
 
359 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.69 
 
 
372 aa  281  9e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  47.28 
 
 
344 aa  280  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.77 
 
 
353 aa  280  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  44.21 
 
 
386 aa  278  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  42.63 
 
 
349 aa  277  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.68 
 
 
370 aa  275  5e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  50.56 
 
 
329 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  43.75 
 
 
366 aa  271  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1117  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.51 
 
 
367 aa  266  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.417968  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 
342 aa  265  8e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  44.85 
 
 
353 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  48.03 
 
 
333 aa  263  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  41.72 
 
 
358 aa  264  2e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  42.58 
 
 
352 aa  263  3e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  47.65 
 
 
333 aa  263  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  46.93 
 
 
333 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 
333 aa  262  6e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 
366 aa  262  6e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 
333 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1109  ABC transporter related  44.98 
 
 
323 aa  261  8e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.79033  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  42.63 
 
 
352 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  42.63 
 
 
352 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  42.72 
 
 
336 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1229  ABC transporter related  44.44 
 
 
370 aa  261  1e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000135939  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  48.59 
 
 
356 aa  261  1e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.57 
 
 
354 aa  261  1e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  43.04 
 
 
336 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4660  ABC transporter related  44.05 
 
 
347 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.93 
 
 
373 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1474  ABC transporter related protein  43.48 
 
 
337 aa  261  2e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00799241  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  45.65 
 
 
342 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.67 
 
 
355 aa  260  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  46.55 
 
 
333 aa  259  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  42.81 
 
 
363 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.6 
 
 
384 aa  258  7e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  39.32 
 
 
362 aa  258  9e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0011  ABC transporter related  43.57 
 
 
359 aa  258  1e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  41.09 
 
 
399 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  42.95 
 
 
352 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  46.28 
 
 
367 aa  257  2e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  45.67 
 
 
353 aa  257  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.75 
 
 
372 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  45.14 
 
 
343 aa  256  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  43.48 
 
 
350 aa  255  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  47.1 
 
 
354 aa  256  5e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4799  ABC transporter related  40.73 
 
 
363 aa  255  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102455  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  44.52 
 
 
360 aa  255  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6870  ABC transporter related  41.36 
 
 
391 aa  255  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  42.81 
 
 
363 aa  255  8e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  40.38 
 
 
366 aa  255  8e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0424  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.29 
 
 
368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  50.67 
 
 
347 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1284  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  44.51 
 
 
426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.67 
 
 
362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3424  ABC transporter related  45.69 
 
 
328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3205  ABC transporter related  41.99 
 
 
339 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  43.28 
 
 
344 aa  253  3e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1292  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  49.43 
 
 
367 aa  253  4.0000000000000004e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1568  ABC transporter related  43.84 
 
 
323 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1039  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.56 
 
 
377 aa  252  5.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251214  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1111  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.96 
 
 
384 aa  252  6e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4155  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.56 
 
 
359 aa  251  9.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.486675  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1874  ABC transporter, ATPase subunit  43.22 
 
 
366 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209056  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  53.52 
 
 
355 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  41.34 
 
 
342 aa  251  9.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1304  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.54 
 
 
378 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  53.05 
 
 
355 aa  251  1e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1246  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.54 
 
 
378 aa  251  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01132  hypothetical protein  51.54 
 
 
378 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.815293  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.11 
 
 
426 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  48.41 
 
 
353 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51.54 
 
 
378 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>