More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0981 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  100 
 
 
353 aa  692    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  55.37 
 
 
361 aa  345  8e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  55.52 
 
 
349 aa  338  9.999999999999999e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.75 
 
 
372 aa  323  3e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.02 
 
 
352 aa  322  4e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  54.44 
 
 
360 aa  321  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.73 
 
 
370 aa  319  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  51.11 
 
 
353 aa  319  6e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.84 
 
 
353 aa  317  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  50 
 
 
346 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  50 
 
 
346 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  50 
 
 
346 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.44 
 
 
353 aa  315  5e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  50.8 
 
 
353 aa  315  7e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3337  ABC transporter related  51.73 
 
 
367 aa  315  9e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  50.48 
 
 
353 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  50.31 
 
 
353 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  49.58 
 
 
366 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.43 
 
 
359 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  49.69 
 
 
353 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  57.29 
 
 
344 aa  308  9e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  46.89 
 
 
356 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  50.29 
 
 
352 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.61 
 
 
356 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  50 
 
 
348 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  50.94 
 
 
352 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  50.31 
 
 
352 aa  297  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  47.79 
 
 
363 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  47.78 
 
 
363 aa  296  5e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0750  ABC transporter related  47.29 
 
 
330 aa  294  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  49.85 
 
 
347 aa  293  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  47.19 
 
 
362 aa  292  6e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5873  ABC transporter related  55.33 
 
 
376 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  41.88 
 
 
354 aa  290  3e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.3 
 
 
373 aa  289  6e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1234  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  44.72 
 
 
367 aa  288  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0541634  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.19 
 
 
402 aa  288  8e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  45.48 
 
 
331 aa  288  9e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01124  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.68 
 
 
378 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.26 
 
 
384 aa  288  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01132  hypothetical protein  47.68 
 
 
378 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.815293  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.68 
 
 
378 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1246  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.68 
 
 
378 aa  288  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457204  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1304  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.68 
 
 
378 aa  288  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2477  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.68 
 
 
378 aa  288  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0899476  normal  0.634641 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  41.47 
 
 
367 aa  287  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  53.72 
 
 
368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2521  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.37 
 
 
378 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0234665  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  46.59 
 
 
342 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1567  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.37 
 
 
378 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000366035 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.94 
 
 
372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  46.59 
 
 
342 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2000  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.37 
 
 
378 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.767612 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  43.34 
 
 
348 aa  286  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  53.29 
 
 
350 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  45.93 
 
 
347 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.79 
 
 
382 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  47.74 
 
 
358 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  40.35 
 
 
350 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  48.11 
 
 
331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  45.01 
 
 
328 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  48.34 
 
 
379 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.38 
 
 
372 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003481  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  42.86 
 
 
371 aa  282  6.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000145818  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  55.16 
 
 
362 aa  282  6.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  43.35 
 
 
329 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  57.26 
 
 
333 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2898  ABC transporter related  48.17 
 
 
366 aa  281  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00959734 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0730  ABC transporter related  45.87 
 
 
330 aa  281  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4476  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  50.79 
 
 
380 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.041416 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4610  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  50.79 
 
 
380 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.51549  normal  0.957495 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  41.85 
 
 
358 aa  280  2e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  57.69 
 
 
333 aa  281  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3205  ABC transporter related  46.31 
 
 
339 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1039  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.83 
 
 
377 aa  280  3e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251214  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1327  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.44 
 
 
378 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  0.141247 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1343  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.44 
 
 
378 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.416806 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2140  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.44 
 
 
378 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0391853 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1305  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.44 
 
 
378 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1958  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.44 
 
 
378 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  45.48 
 
 
356 aa  279  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.21 
 
 
349 aa  279  5e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.5 
 
 
362 aa  279  5e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  46.2 
 
 
329 aa  279  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1101  ABC transport system ATP-binding protein  43.61 
 
 
333 aa  279  6e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.03 
 
 
372 aa  278  7e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.14 
 
 
329 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4878  ABC transporter related  58.85 
 
 
387 aa  278  9e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.53709 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.57 
 
 
426 aa  278  9e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  47.76 
 
 
353 aa  278  9e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  43.63 
 
 
356 aa  278  1e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  44.73 
 
 
329 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4379  ABC transporter related  43.75 
 
 
355 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1862  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.68 
 
 
371 aa  277  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  45.15 
 
 
343 aa  277  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.45 
 
 
363 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1263  putrescine transport ATP-binding protein PotG  43.77 
 
 
381 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1504  ABC transporter related  50 
 
 
350 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.310407  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  55.74 
 
 
330 aa  277  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.25 
 
 
356 aa  276  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>