More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4610 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4476  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  100 
 
 		 380 aa  766    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.041416 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4610  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  100 
 
 		 380 aa  766    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.51549  normal  0.957495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5523  ABC transporter related  62.98 
 
 		 364 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5190  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  61.54 
 
 		 352 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.447906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5137  ABC transporter, ATP-binding protein  60.68 
 
 		 352 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0328  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  59.83 
 
 		 352 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.785101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5010  ABC transporter related  60.4 
 
 		 352 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5369  ABC transporter-like  59.83 
 
 		 358 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  51.52 
 
 		 363 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  51.83 
 
 		 363 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  57.74 
 
 		 350 aa  334  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  52.1 
 
 		 379 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  52.11 
 
 		 362 aa  323  4e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4878  ABC transporter related  49.59 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.53709 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5873  ABC transporter related  64.08 
 
 		 376 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  50.31 
 
 		 336 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  57.72 
 
 		 333 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  57.72 
 
 		 333 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  50 
 
 		 336 aa  301  9e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 		 333 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 		 333 aa  301  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  56.91 
 
 		 333 aa  300  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  57.32 
 
 		 366 aa  300  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0810  ABC transporter, ATP-binding protein  46.35 
 
 		 370 aa  296  3e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0544  ABC transporter, ATP-binding protein  48.75 
 
 		 403 aa  296  4e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0891201  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  50.79 
 
 		 353 aa  296  5e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  49.22 
 
 		 353 aa  295  7e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2898  ABC transporter related  51.86 
 
 		 366 aa  295  7e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00959734 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04880  ABC-type spermidine/putrescine transport system ATPase component  48.18 
 
 		 368 aa  295  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000765  ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 		 368 aa  295  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  57.5 
 
 		 333 aa  294  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  48.9 
 
 		 353 aa  293  3e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.22 
 
 		 353 aa  293  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  48.88 
 
 		 349 aa  293  5e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3337  ABC transporter related  53.12 
 
 		 367 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.92 
 
 		 359 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  51.63 
 
 		 358 aa  290  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.81 
 
 		 355 aa  288  8e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2745  ABC transporter ATP-binding protein  60.92 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.870827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  48.9 
 
 		 357 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  50.94 
 
 		 352 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.56 
 
 		 372 aa  286  5e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  48.9 
 
 		 357 aa  286  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 351 aa  286  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  47.69 
 
 		 356 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  49.51 
 
 		 356 aa  285  7e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  50.31 
 
 		 352 aa  285  8e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  50.31 
 
 		 352 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  45.28 
 
 		 365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.69 
 
 		 356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.13 
 
 		 370 aa  283  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.86 
 
 		 380 aa  282  6.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  48.14 
 
 		 361 aa  282  7.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.57 
 
 		 352 aa  282  9e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  47.39 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  52.05 
 
 		 339 aa  280  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  43.1 
 
 		 357 aa  280  3e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.94 
 
 		 354 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  47 
 
 		 366 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  47.35 
 
 		 366 aa  279  6e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  45.21 
 
 		 357 aa  279  6e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1633  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.52 
 
 		 353 aa  278  8e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0081  ABC transporter  45.58 
 
 		 326 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  58.9 
 
 		 360 aa  278  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  48.22 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  48.22 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  48.22 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  43.94 
 
 		 364 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.77 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1520  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.51 
 
 		 352 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  45.71 
 
 		 353 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0197  sulphate transport system permease protein 1  45.24 
 
 		 329 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6271  ABC transporter related  48.99 
 
 		 356 aa  276  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0482396  normal  0.559983 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  45.14 
 
 		 326 aa  275  6e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3516  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  55.87 
 
 		 329 aa  276  6e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1500  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.21 
 
 		 352 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823264  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  45.75 
 
 		 362 aa  275  7e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  50.35 
 
 		 352 aa  275  8e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2400  ABC putrescine transporter, ATPase subunit  50.32 
 
 		 334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  49.47 
 
 		 353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  48 
 
 		 347 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  50.72 
 
 		 353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  50.7 
 
 		 344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  46.02 
 
 		 346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  52.94 
 
 		 353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  46.03 
 
 		 353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  51.23 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  46.79 
 
 		 347 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  49.82 
 
 		 353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.82 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  46.47 
 
 		 353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  47.65 
 
 		 342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3161  ABC transporter related  55.47 
 
 		 329 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0305522 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.21 
 
 		 372 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2477  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  46.57 
 
 		 351 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1283  ABC transporter related  52.26 
 
 		 357 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0294  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.24 
 
 		 329 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.491051 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.89 
 
 		 345 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.43 
 
 		 370 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  47.71 
 
 		 329 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>