More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5523 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5523  ABC transporter related  100 
 
 		 364 aa  725    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4610  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  62.98 
 
 		 380 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.51549  normal  0.957495 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4476  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  62.98 
 
 		 380 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.041416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5190  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  60.62 
 
 		 352 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.447906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5137  ABC transporter, ATP-binding protein  59.77 
 
 		 352 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5010  ABC transporter related  59.77 
 
 		 352 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0328  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  60.06 
 
 		 352 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.785101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5369  ABC transporter-like  61.02 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  53.66 
 
 		 363 aa  323  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  50.7 
 
 		 363 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  55.23 
 
 		 350 aa  320  3e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  51.54 
 
 		 379 aa  320  3.9999999999999996e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4878  ABC transporter related  47.88 
 
 		 387 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.53709 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5873  ABC transporter related  50.85 
 
 		 376 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2898  ABC transporter related  52.21 
 
 		 366 aa  304  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00959734 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  65.24 
 
 		 362 aa  302  5.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0810  ABC transporter, ATP-binding protein  50.47 
 
 		 370 aa  299  5e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0544  ABC transporter, ATP-binding protein  48.07 
 
 		 403 aa  295  6e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0891201  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  53.49 
 
 		 357 aa  292  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  51.11 
 
 		 352 aa  291  8e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  50.48 
 
 		 336 aa  291  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  51.11 
 
 		 352 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  54.2 
 
 		 333 aa  290  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000765  ABC transporter, ATP-binding protein  49.09 
 
 		 368 aa  290  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04880  ABC-type spermidine/putrescine transport system ATPase component  49.09 
 
 		 368 aa  290  3e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  53.49 
 
 		 357 aa  289  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  53.78 
 
 		 333 aa  286  4e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  53.78 
 
 		 333 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  50.96 
 
 		 352 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  53.78 
 
 		 333 aa  286  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  54.2 
 
 		 333 aa  286  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  53.78 
 
 		 366 aa  286  5e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  50 
 
 		 358 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  50.16 
 
 		 336 aa  285  5.999999999999999e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3337  ABC transporter related  50.3 
 
 		 367 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2745  ABC transporter ATP-binding protein  44.48 
 
 		 367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.870827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.75 
 
 		 353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.04 
 
 		 363 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6271  ABC transporter related  46.8 
 
 		 356 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0482396  normal  0.559983 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  47.81 
 
 		 353 aa  280  3e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  52.94 
 
 		 333 aa  280  4e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  50.97 
 
 		 344 aa  280  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  47.5 
 
 		 353 aa  278  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  47.81 
 
 		 356 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  46.73 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  46.82 
 
 		 349 aa  277  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  45.82 
 
 		 362 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2002  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.69 
 
 		 341 aa  276  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.99 
 
 		 380 aa  275  6e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  48.46 
 
 		 352 aa  275  9e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.12 
 
 		 352 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  47.37 
 
 		 356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  44.09 
 
 		 386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  45.66 
 
 		 353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3984  ABC transporter related  45.3 
 
 		 354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.8 
 
 		 381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  46.11 
 
 		 363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48 
 
 		 372 aa  273  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  47.63 
 
 		 359 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  45.43 
 
 		 353 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  55.6 
 
 		 362 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  45.73 
 
 		 360 aa  272  7e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  45.73 
 
 		 360 aa  272  7e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  48.16 
 
 		 374 aa  271  9e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  45.54 
 
 		 366 aa  271  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 		 355 aa  271  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48750  polyamine ABC transporter ATP-binding subunit, PotG subunit  44.99 
 
 		 383 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0473431  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  46.22 
 
 		 346 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  46.22 
 
 		 346 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0376  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.61 
 
 		 380 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000938132  hitchhiker  0.00113993 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.02 
 
 		 359 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  46.22 
 
 		 346 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6716  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  52.86 
 
 		 356 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  46.31 
 
 		 356 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4710  ABC transporter related  46.54 
 
 		 359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0388309 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  45.69 
 
 		 353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  45.69 
 
 		 353 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  47.08 
 
 		 353 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2023  ABC transporter related  49.47 
 
 		 366 aa  269  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  46.3 
 
 		 359 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4565  ABC transporter related  46.26 
 
 		 361 aa  268  7e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.155575 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.85 
 
 		 355 aa  269  7e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.79 
 
 		 379 aa  269  7e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.31 
 
 		 356 aa  268  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.85 
 
 		 370 aa  268  8e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  45.81 
 
 		 337 aa  268  8.999999999999999e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  46.28 
 
 		 348 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4194  ABC transporter related  48.89 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.812216  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2019  putrescine ABC transport system, ATP-binding protein  44.73 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0633  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.73 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375714  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3541  ABC transporter related  45.12 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5376  ABC transporter related  45.12 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.65 
 
 		 345 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0725  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.73 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  44.94 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  46.15 
 
 		 353 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  46.44 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  45.12 
 
 		 360 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  49.33 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1009  ABC transporter related  49.12 
 
 		 347 aa  267  2e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000145276 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>