More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5190 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5137  ABC transporter, ATP-binding protein  97.73 
 
 		 352 aa  682    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0328  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  92.9 
 
 		 352 aa  652    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.785101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5010  ABC transporter related  97.16 
 
 		 352 aa  677    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5190  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  100 
 
 		 352 aa  722    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.447906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5369  ABC transporter-like  86.82 
 
 		 358 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4476  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  61.54 
 
 		 380 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.041416 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4610  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  61.54 
 
 		 380 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.51549  normal  0.957495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5523  ABC transporter related  60.62 
 
 		 364 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  50.43 
 
 		 363 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  50.57 
 
 		 363 aa  339  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  52.12 
 
 		 350 aa  339  4e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  49.31 
 
 		 379 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5873  ABC transporter related  48.6 
 
 		 376 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4878  ABC transporter related  48.08 
 
 		 387 aa  309  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.53709 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2898  ABC transporter related  49.32 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00959734 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0544  ABC transporter, ATP-binding protein  54.07 
 
 		 403 aa  302  6.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0891201  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  52.16 
 
 		 362 aa  302  7.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0810  ABC transporter, ATP-binding protein  51.44 
 
 		 370 aa  295  7e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  55.06 
 
 		 333 aa  295  7e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  55.06 
 
 		 333 aa  295  9e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  55.06 
 
 		 333 aa  295  9e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  55.06 
 
 		 333 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  55.06 
 
 		 366 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  55.06 
 
 		 333 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000765  ABC transporter, ATP-binding protein  54.05 
 
 		 368 aa  293  4e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04880  ABC-type spermidine/putrescine transport system ATPase component  54.05 
 
 		 368 aa  293  4e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  55.06 
 
 		 333 aa  286  4e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  44.73 
 
 		 346 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  44.73 
 
 		 346 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  44.73 
 
 		 346 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  45.13 
 
 		 352 aa  280  2e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  43.63 
 
 		 353 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.25 
 
 		 359 aa  280  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  47.91 
 
 		 352 aa  278  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  47.94 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  42.78 
 
 		 353 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2745  ABC transporter ATP-binding protein  49.84 
 
 		 367 aa  276  3e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.870827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  48.06 
 
 		 353 aa  276  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  42.61 
 
 		 357 aa  275  7e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  43.05 
 
 		 363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  46.46 
 
 		 352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  44.19 
 
 		 348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  46.95 
 
 		 352 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  46.95 
 
 		 352 aa  272  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.3 
 
 		 356 aa  272  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.03 
 
 		 360 aa  272  6e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  43.58 
 
 		 353 aa  272  7e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  47.83 
 
 		 358 aa  272  7e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6716  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  50.7 
 
 		 356 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.94 
 
 		 355 aa  272  8.000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  43.58 
 
 		 353 aa  271  1e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.68 
 
 		 351 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1864  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  45.43 
 
 		 351 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.94 
 
 		 370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  44.19 
 
 		 357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.54 
 
 		 356 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  46.01 
 
 		 353 aa  268  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1206  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  45.43 
 
 		 351 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0375351  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1850  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  45.43 
 
 		 351 aa  268  8e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2017  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  45.43 
 
 		 351 aa  268  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0809  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  45.43 
 
 		 351 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.488207  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  45.4 
 
 		 366 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1695  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  45.43 
 
 		 351 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0693572  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0351  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  45.43 
 
 		 351 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0503358  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  47.13 
 
 		 336 aa  268  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  47.45 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2477  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  45.14 
 
 		 351 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  44.44 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  44.07 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  43.67 
 
 		 349 aa  268  1e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  44.29 
 
 		 347 aa  267  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  53.19 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  46.48 
 
 		 353 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.94 
 
 		 353 aa  266  4e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  43.63 
 
 		 357 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.38 
 
 		 388 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.4 
 
 		 381 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.28 
 
 		 388 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1626  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.18 
 
 		 352 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220073  normal  0.514504 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.28 
 
 		 388 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.47 
 
 		 345 aa  266  5.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4710  ABC transporter related  44.26 
 
 		 359 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0388309 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  47.13 
 
 		 336 aa  265  7e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1500  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45 
 
 		 352 aa  265  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823264  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3337  ABC transporter related  50.53 
 
 		 367 aa  265  8.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1283  ABC transporter related  50 
 
 		 357 aa  265  8.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.02 
 
 		 423 aa  265  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  48.24 
 
 		 361 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.64 
 
 		 353 aa  264  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  47.04 
 
 		 360 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  42.74 
 
 		 353 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1581  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.38 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6271  ABC transporter related  42.49 
 
 		 356 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0482396  normal  0.559983 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  46.42 
 
 		 338 aa  264  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1034  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.12 
 
 		 359 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.330861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.29 
 
 		 352 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.47 
 
 		 373 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1520  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45 
 
 		 352 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.98 
 
 		 372 aa  263  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  45.81 
 
 		 347 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>