More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0328 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5137  ABC transporter, ATP-binding protein  91.48 
 
 		 352 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5190  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  92.9 
 
 		 352 aa  651    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.447906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0328  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  100 
 
 		 352 aa  723    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.785101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5010  ABC transporter related  91.19 
 
 		 352 aa  637    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5369  ABC transporter-like  84.77 
 
 		 358 aa  587  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4610  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  59.83 
 
 		 380 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.51549  normal  0.957495 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4476  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  59.83 
 
 		 380 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.041416 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5523  ABC transporter related  60.06 
 
 		 364 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  51.45 
 
 		 363 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  51.84 
 
 		 350 aa  335  5.999999999999999e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  49.86 
 
 		 363 aa  332  6e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  49.58 
 
 		 379 aa  322  5e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5873  ABC transporter related  48.86 
 
 		 376 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188546  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4878  ABC transporter related  49.03 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.53709 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  52.28 
 
 		 362 aa  308  9e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0810  ABC transporter, ATP-binding protein  51.12 
 
 		 370 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2898  ABC transporter related  48.07 
 
 		 366 aa  294  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00959734 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1215  ABC-transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1238  ABC transporter related  53.85 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.833297  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0544  ABC transporter, ATP-binding protein  50.64 
 
 		 403 aa  287  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0891201  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3969  ABC transporter, ATP-binding protein  54.25 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 		 333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04880  ABC-type spermidine/putrescine transport system ATPase component  52.6 
 
 		 368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000765  ABC transporter, ATP-binding protein  52.6 
 
 		 368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  53.85 
 
 		 366 aa  286  5e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  55.27 
 
 		 333 aa  279  5e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  44.41 
 
 		 352 aa  278  1e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.2 
 
 		 360 aa  278  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  42.49 
 
 		 353 aa  276  5e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2745  ABC transporter ATP-binding protein  49.21 
 
 		 367 aa  276  6e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.870827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.94 
 
 		 359 aa  275  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  47.56 
 
 		 358 aa  275  9e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  44.27 
 
 		 349 aa  274  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.72 
 
 		 355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  43.3 
 
 		 346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  43.3 
 
 		 346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  43.3 
 
 		 346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  42.05 
 
 		 357 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  46.95 
 
 		 352 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  48.38 
 
 		 353 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  46.88 
 
 		 360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.66 
 
 		 370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  46.98 
 
 		 356 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  47.06 
 
 		 336 aa  268  8e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  45.98 
 
 		 352 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  43.28 
 
 		 353 aa  268  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1864  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 351 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1993  ABC transporter related  45.98 
 
 		 352 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  46.04 
 
 		 352 aa  267  2e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  47.2 
 
 		 336 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2477  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  44.57 
 
 		 351 aa  266  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0809  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 351 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.488207  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1206  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 351 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0375351  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2017  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 351 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0351  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 351 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0503358  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1850  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 351 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515389  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1695  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 351 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0693572  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  45.51 
 
 		 348 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  41.64 
 
 		 353 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.69 
 
 		 352 aa  265  7e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.57 
 
 		 352 aa  265  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1930  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.97 
 
 		 380 aa  264  1e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00576419  hitchhiker  0.0000000435694 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.4 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  44.29 
 
 		 352 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1500  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.17 
 
 		 352 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823264  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.35 
 
 		 356 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3516  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  47.32 
 
 		 329 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  42.77 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  46.1 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  43.5 
 
 		 359 aa  263  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  43.06 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  42.9 
 
 		 353 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  45.48 
 
 		 366 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  43.26 
 
 		 353 aa  263  3e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6716  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  43.31 
 
 		 356 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  42.05 
 
 		 365 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1520  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.17 
 
 		 352 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6271  ABC transporter related  42.21 
 
 		 356 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0482396  normal  0.559983 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1283  ABC transporter related  49 
 
 		 357 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2941  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.54 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  42.78 
 
 		 357 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  44.13 
 
 		 347 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  44.25 
 
 		 347 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  43.26 
 
 		 353 aa  262  6e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4710  ABC transporter related  44.57 
 
 		 359 aa  262  6e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0388309 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1124  sulphate transport system permease protein 1  45.27 
 
 		 352 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1604  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.27 
 
 		 352 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96838  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  41.62 
 
 		 358 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  52.97 
 
 		 361 aa  262  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  40.84 
 
 		 356 aa  262  8.999999999999999e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.25 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4742  ABC sulfate transporter, ATPase subunit  45.27 
 
 		 352 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0517835  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  43.77 
 
 		 363 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0754  ABC transporter related  40.23 
 
 		 363 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.23256 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.53 
 
 		 408 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  42.32 
 
 		 386 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  47.97 
 
 		 381 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.53 
 
 		 351 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1581  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.99 
 
 		 352 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>