More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1278 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  100 
 
 		 366 aa  751    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  71.95 
 
 		 360 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  71.95 
 
 		 360 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  61.39 
 
 		 378 aa  444  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  54.83 
 
 		 390 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  53.22 
 
 		 368 aa  374  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  47.31 
 
 		 346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  46.84 
 
 		 355 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  43.71 
 
 		 377 aa  298  9e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  45.66 
 
 		 342 aa  298  9e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  45.63 
 
 		 369 aa  291  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  46.65 
 
 		 343 aa  291  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  43.98 
 
 		 369 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  45.35 
 
 		 346 aa  290  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  45.1 
 
 		 352 aa  289  5.0000000000000004e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  45.75 
 
 		 343 aa  289  5.0000000000000004e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  43.7 
 
 		 369 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17671  ABC transporter ATP-binding protein  45.92 
 
 		 352 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  45.97 
 
 		 343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0811  ATPase  44.65 
 
 		 352 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0326563  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  44.01 
 
 		 386 aa  285  5.999999999999999e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  43.42 
 
 		 369 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  48.79 
 
 		 352 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08641  ABC transporter ATP-binding protein  45.4 
 
 		 352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  46.49 
 
 		 368 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  42.94 
 
 		 389 aa  282  6.000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  43.58 
 
 		 365 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  50.94 
 
 		 360 aa  280  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  43.66 
 
 		 369 aa  280  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  45.62 
 
 		 358 aa  279  6e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  45.1 
 
 		 369 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  42.49 
 
 		 361 aa  278  9e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  43.35 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08671  ABC transporter ATP-binding protein  43.77 
 
 		 352 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  47.35 
 
 		 342 aa  277  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  43.02 
 
 		 378 aa  278  2e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  44.41 
 
 		 349 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  44.71 
 
 		 349 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  44.41 
 
 		 349 aa  278  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  44.12 
 
 		 349 aa  277  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  41.83 
 
 		 343 aa  276  4e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  45.09 
 
 		 363 aa  275  8e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  44.25 
 
 		 349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  43.61 
 
 		 361 aa  273  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  41.93 
 
 		 356 aa  273  3e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.54 
 
 		 353 aa  273  3e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.54 
 
 		 353 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  42.46 
 
 		 369 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  42.03 
 
 		 341 aa  272  6e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  44.55 
 
 		 342 aa  272  6e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  42.7 
 
 		 354 aa  272  9e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  43.34 
 
 		 353 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  41.83 
 
 		 353 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.98 
 
 		 354 aa  271  1e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  40.22 
 
 		 369 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  45.14 
 
 		 348 aa  271  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  42.54 
 
 		 358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  42.54 
 
 		 358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0211  ATPase  40.18 
 
 		 352 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  42.46 
 
 		 410 aa  270  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  42.7 
 
 		 356 aa  270  4e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  44.01 
 
 		 357 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  45.74 
 
 		 349 aa  269  7e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  44.62 
 
 		 341 aa  269  7e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08431  ABC transporter ATP-binding protein  41.07 
 
 		 352 aa  268  7e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519421 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  45.43 
 
 		 349 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.52 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  45.43 
 
 		 349 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  43.81 
 
 		 343 aa  267  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  43.41 
 
 		 386 aa  267  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.23 
 
 		 362 aa  267  2e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.71 
 
 		 354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  44.9 
 
 		 348 aa  266  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  44.95 
 
 		 363 aa  266  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  45.43 
 
 		 349 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.14 
 
 		 352 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.67 
 
 		 382 aa  266  5e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  40.57 
 
 		 353 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3142  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  52.34 
 
 		 361 aa  265  8e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  42.06 
 
 		 352 aa  265  8e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  44.92 
 
 		 348 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  42.53 
 
 		 348 aa  264  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.03 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.37 
 
 		 374 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  45.6 
 
 		 342 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1270  ABC transporter related  42.07 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07781  ABC transporter ATP-binding protein  42.09 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  42.46 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  44.21 
 
 		 342 aa  263  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2180  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.99 
 
 		 346 aa  263  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  41.57 
 
 		 358 aa  263  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2400  ABC putrescine transporter, ATPase subunit  45.16 
 
 		 334 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  45.03 
 
 		 364 aa  262  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.87 
 
 		 372 aa  262  6e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  40.68 
 
 		 349 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  40.68 
 
 		 349 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.27 
 
 		 370 aa  262  8e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  40.68 
 
 		 349 aa  262  8e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5851  ABC transporter ATP-binding protein  42.18 
 
 		 351 aa  262  8.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228594  normal  0.59498 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  43.57 
 
 		 349 aa  261  1e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>