More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3398 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  100 
 
 
341 aa  676    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2375  ABC transporter related protein  63.93 
 
 
347 aa  413  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  55.78 
 
 
370 aa  287  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  50.63 
 
 
374 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  45.78 
 
 
337 aa  283  4.0000000000000003e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  53.02 
 
 
353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.09 
 
 
384 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.85 
 
 
388 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.85 
 
 
388 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.85 
 
 
388 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.41 
 
 
359 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3878  ABC transporter related protein  52.33 
 
 
382 aa  281  1e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.88 
 
 
373 aa  279  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  40.99 
 
 
367 aa  278  7e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1474  ABC transporter related protein  47.38 
 
 
337 aa  278  7e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00799241  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  50 
 
 
362 aa  278  8e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  45.33 
 
 
353 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.2 
 
 
382 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  45.69 
 
 
352 aa  278  1e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.47 
 
 
423 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  43.99 
 
 
346 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  43.99 
 
 
346 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  43.99 
 
 
346 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  46.36 
 
 
342 aa  276  3e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.87 
 
 
362 aa  276  4e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1201  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.79 
 
 
327 aa  275  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  43.66 
 
 
343 aa  275  6e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  51.63 
 
 
353 aa  275  6e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  43.92 
 
 
361 aa  275  8e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.63 
 
 
352 aa  275  9e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1007  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.53 
 
 
327 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.84 
 
 
399 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  48.58 
 
 
355 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1881  polyamine transport protein PotG  44.79 
 
 
381 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.18 
 
 
372 aa  274  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1270  ABC transporter related  52.52 
 
 
361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  48.23 
 
 
355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5898  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.71 
 
 
371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  52.75 
 
 
379 aa  273  3e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  43.49 
 
 
348 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  46.65 
 
 
389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1415  ABC transporter related  53.38 
 
 
353 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  44.08 
 
 
347 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  45.79 
 
 
356 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  42.03 
 
 
366 aa  272  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  47.18 
 
 
350 aa  272  6e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1179  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 
331 aa  272  7e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00519424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1337  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 
327 aa  272  7e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.819184  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3852  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.7 
 
 
358 aa  272  7e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4007  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 
327 aa  272  7e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124331  hitchhiker  0.00000000114894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0023  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  55.79 
 
 
447 aa  272  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1398  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 
327 aa  271  9e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.240911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1375  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 
327 aa  271  9e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000557634 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1439  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 
327 aa  271  9e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000273581  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.95 
 
 
356 aa  271  9e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.48 
 
 
382 aa  271  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1199  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  43.85 
 
 
331 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00119118  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1297  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  43.85 
 
 
331 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2068  ABC transporter related  44.63 
 
 
364 aa  271  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.34 
 
 
383 aa  271  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.54 
 
 
354 aa  270  2e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1456  ABC transporter related  52.69 
 
 
353 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0461545 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  54.77 
 
 
363 aa  270  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  44.63 
 
 
356 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1504  ABC transporter related  51.43 
 
 
350 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.310407  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.33 
 
 
372 aa  271  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  45.01 
 
 
356 aa  270  2e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0077  ABC transporter related  46.13 
 
 
347 aa  270  2e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0473465  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  40.94 
 
 
348 aa  271  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2521  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.06 
 
 
378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0234665  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  41.23 
 
 
348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2000  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.06 
 
 
378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.767612 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1567  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.06 
 
 
378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000366035 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  44.71 
 
 
372 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  46.98 
 
 
353 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  44.34 
 
 
344 aa  269  4e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  43.97 
 
 
375 aa  270  4e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1465  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  46.2 
 
 
352 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476678  normal  0.124115 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01124  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.75 
 
 
378 aa  268  7e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1246  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.75 
 
 
378 aa  268  7e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457204  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01132  hypothetical protein  44.75 
 
 
378 aa  268  7e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.815293  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2477  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.75 
 
 
378 aa  268  7e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0899476  normal  0.634641 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1304  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.75 
 
 
378 aa  268  7e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.75 
 
 
378 aa  268  7e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  42.3 
 
 
371 aa  268  8e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  45.48 
 
 
387 aa  268  8.999999999999999e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1177  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.53 
 
 
331 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1009  ABC transporter related  48.22 
 
 
347 aa  268  1e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.000145276 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  50.81 
 
 
353 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  45 
 
 
372 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.95 
 
 
373 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4396  ABC transporter related protein  51.59 
 
 
385 aa  268  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.510739  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.46 
 
 
357 aa  268  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.54 
 
 
375 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  43.3 
 
 
378 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1205  ABC transporter related  55.06 
 
 
343 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226177  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.13 
 
 
354 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0750  ABC transporter related  55.06 
 
 
343 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1170  ABC transporter related  49.82 
 
 
347 aa  267  2e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257531  normal  0.0522399 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1231  ABC transporter related  55.06 
 
 
343 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>