More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1588 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  100 
 
 
386 aa  778    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  81.92 
 
 
354 aa  578  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  80.06 
 
 
358 aa  567  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  80.06 
 
 
358 aa  567  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  74.17 
 
 
365 aa  543  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  73.06 
 
 
410 aa  532  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  73.24 
 
 
361 aa  529  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1508  ABC transporter related  72.27 
 
 
376 aa  525  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1085  putative transport system ATP-binding protein  68.31 
 
 
389 aa  478  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.224743  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  65.17 
 
 
356 aa  468  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  57.51 
 
 
357 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  59.24 
 
 
359 aa  395  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  56.94 
 
 
369 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  56.36 
 
 
355 aa  377  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  57.1 
 
 
369 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  54.93 
 
 
347 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  55.92 
 
 
369 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  56.21 
 
 
369 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  56.21 
 
 
369 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  51.26 
 
 
361 aa  363  4e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  53.7 
 
 
369 aa  359  6e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  51.14 
 
 
353 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  57.01 
 
 
368 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  53.69 
 
 
357 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  53.02 
 
 
369 aa  348  7e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  51.51 
 
 
353 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  50.56 
 
 
375 aa  336  2.9999999999999997e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  50.14 
 
 
348 aa  335  1e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  52.16 
 
 
355 aa  332  8e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  51.98 
 
 
371 aa  330  2e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  47.88 
 
 
355 aa  326  5e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  49.29 
 
 
358 aa  325  8.000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0871  ABC transporter related  48.06 
 
 
405 aa  315  6e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.010866  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1608  ABC transporter ATP-binding protein  53.26 
 
 
360 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18600  ABC transporter ATP-binding protein  53.26 
 
 
360 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0152976 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1545  ABC iron transporter, ATPase subunit  47.43 
 
 
415 aa  303  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.316971 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1726  ABC transporter related  47.08 
 
 
372 aa  295  1e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.350865 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  61.76 
 
 
257 aa  294  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4316  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  65.61 
 
 
257 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480122  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  61.76 
 
 
257 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2858  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  61.51 
 
 
259 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0664638  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  62.18 
 
 
257 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  62.18 
 
 
257 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1091  ABC transporter related  61.76 
 
 
257 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1181  ABC transporter related  62.18 
 
 
257 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0132418  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  44.01 
 
 
366 aa  285  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  42 
 
 
343 aa  276  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  49.13 
 
 
346 aa  276  5e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  43.94 
 
 
390 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0462  iron ABC transporter ATP-binding protein  61.92 
 
 
256 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0690  iron ABC transporter ATP-binding protein  61.92 
 
 
256 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000704883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1509  putative ABC transport system, ATP-binding protein  61.92 
 
 
256 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.527664  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1180  iron ABC transporter ATP-binding protein  61.92 
 
 
256 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1380  iron ABC transporter ATP-binding protein  61.92 
 
 
256 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.815433  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1779  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  61.92 
 
 
256 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.243998  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  40.37 
 
 
378 aa  272  6e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1376  iron ABC transporter ATP-binding protein  61.51 
 
 
256 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132699  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  44.13 
 
 
346 aa  271  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  45.25 
 
 
360 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  45.25 
 
 
360 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  42.05 
 
 
349 aa  266  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  41.19 
 
 
360 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  42.29 
 
 
387 aa  264  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  44.72 
 
 
355 aa  263  6e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  46.15 
 
 
342 aa  261  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  44.26 
 
 
342 aa  261  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  42.45 
 
 
349 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  42.37 
 
 
349 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.29 
 
 
343 aa  259  5.0000000000000005e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  43.93 
 
 
377 aa  259  7e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  42.45 
 
 
349 aa  259  8e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  42.17 
 
 
349 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3701  ABC transporter related  59.45 
 
 
228 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  44.6 
 
 
368 aa  256  3e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  40.62 
 
 
343 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  42.95 
 
 
342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  43.22 
 
 
349 aa  253  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  40 
 
 
342 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  52.26 
 
 
349 aa  252  7e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  52.26 
 
 
349 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  44 
 
 
389 aa  251  1e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  46.82 
 
 
352 aa  251  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  40.57 
 
 
342 aa  250  3e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  52.26 
 
 
349 aa  250  4e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  44.15 
 
 
378 aa  248  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  40.17 
 
 
343 aa  248  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  40.5 
 
 
350 aa  247  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  43.28 
 
 
342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1062  ABC transporter related protein  44.54 
 
 
373 aa  243  5e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
352 aa  243  6e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  46.3 
 
 
350 aa  242  9e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.36 
 
 
341 aa  238  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  40 
 
 
343 aa  236  4e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00164  putative ABC-type transport system, ATPase component  42.14 
 
 
344 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2267  ABC transporter related  49.4 
 
 
363 aa  232  8.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  42.18 
 
 
352 aa  232  8.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  41.3 
 
 
363 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.23 
 
 
356 aa  230  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0542  ABC transporter related  42.09 
 
 
346 aa  230  4e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.999499  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  52.4 
 
 
360 aa  229  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>