More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0211 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_08431  ABC transporter ATP-binding protein  95.74 
 
 
352 aa  697    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519421 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0211  ATPase  100 
 
 
352 aa  726    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17671  ABC transporter ATP-binding protein  49.15 
 
 
352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09571  ABC transporter ATP-binding protein  51.29 
 
 
356 aa  352  5.9999999999999994e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0852854  hitchhiker  0.000225107 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0811  ATPase  47.71 
 
 
352 aa  328  6e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0326563  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08671  ABC transporter ATP-binding protein  49.54 
 
 
352 aa  326  5e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07781  ABC transporter ATP-binding protein  47.16 
 
 
352 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08641  ABC transporter ATP-binding protein  46.99 
 
 
352 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0878  ATPase  47.73 
 
 
372 aa  306  4.0000000000000004e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0670  ATPase  43.87 
 
 
356 aa  293  2e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.375513  normal  0.345411 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  42.9 
 
 
378 aa  285  8e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  43.85 
 
 
368 aa  280  4e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  40.18 
 
 
366 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  46.26 
 
 
360 aa  257  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  40.17 
 
 
390 aa  255  7e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  39.17 
 
 
369 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  42.04 
 
 
352 aa  253  3e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  41.88 
 
 
360 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  41.88 
 
 
360 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  40.59 
 
 
361 aa  247  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  51.23 
 
 
358 aa  246  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  48.82 
 
 
357 aa  246  6e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  47.49 
 
 
363 aa  242  7e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  52.91 
 
 
369 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  39.3 
 
 
342 aa  239  5e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  42.7 
 
 
342 aa  239  5e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  40.32 
 
 
375 aa  236  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  43.66 
 
 
369 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  49.57 
 
 
359 aa  236  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  43.66 
 
 
369 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  41.85 
 
 
347 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  48.36 
 
 
369 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  52.51 
 
 
368 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  49.18 
 
 
353 aa  235  9e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  48.36 
 
 
369 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  50.22 
 
 
369 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  48.77 
 
 
357 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  35.03 
 
 
365 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  44.79 
 
 
355 aa  230  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  37.66 
 
 
377 aa  230  3e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  36 
 
 
343 aa  229  7e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  47.26 
 
 
257 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  43.62 
 
 
373 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  38.78 
 
 
342 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  42.69 
 
 
386 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  36.69 
 
 
389 aa  227  3e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  36.69 
 
 
341 aa  226  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  36.05 
 
 
368 aa  225  9e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  44.11 
 
 
346 aa  224  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4316  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  46.84 
 
 
257 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480122  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  42.55 
 
 
355 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  40.13 
 
 
341 aa  224  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  37.05 
 
 
342 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1091  ABC transporter related  46.41 
 
 
257 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0550  ABC transporter related  38.16 
 
 
389 aa  223  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.698087  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  40.79 
 
 
350 aa  223  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  45.99 
 
 
257 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1181  ABC transporter related  46.84 
 
 
257 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0132418  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  46.41 
 
 
257 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  46.41 
 
 
257 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  40 
 
 
355 aa  222  9e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  44.26 
 
 
365 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  45.93 
 
 
410 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  36.68 
 
 
357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  41.91 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  38.7 
 
 
358 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  38.7 
 
 
358 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  34.64 
 
 
363 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.9 
 
 
349 aa  219  5e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  35.24 
 
 
342 aa  219  5e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.63 
 
 
352 aa  219  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  38.97 
 
 
343 aa  219  7e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.08 
 
 
353 aa  218  8.999999999999998e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  35.55 
 
 
349 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.76 
 
 
356 aa  218  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  35.54 
 
 
349 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  42.74 
 
 
348 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  42.29 
 
 
349 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  35.26 
 
 
349 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  40.75 
 
 
375 aa  218  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  42.69 
 
 
349 aa  217  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.19 
 
 
362 aa  218  2e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.38 
 
 
354 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2858  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.88 
 
 
259 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0664638  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  35.26 
 
 
349 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  45.49 
 
 
354 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  35.96 
 
 
378 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  41.08 
 
 
371 aa  216  7e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  40.16 
 
 
352 aa  215  8e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  40.81 
 
 
349 aa  215  8e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3956  ABC transporter related  41.22 
 
 
355 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.396032  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  42.29 
 
 
349 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  43.28 
 
 
374 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06260  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  44.49 
 
 
387 aa  214  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.623028  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.42 
 
 
367 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2514  ABC transporter related protein  44.74 
 
 
405 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18600  ABC transporter ATP-binding protein  52.97 
 
 
360 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0152976 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  35.78 
 
 
342 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  35.88 
 
 
343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  44.54 
 
 
361 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>