More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0767 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  100 
 
 		 357 aa  699    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0550  ABC transporter related  50.14 
 
 		 389 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.698087  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  48.57 
 
 		 373 aa  298  9e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  51.57 
 
 		 365 aa  293  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  51.29 
 
 		 363 aa  293  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0542  ABC transporter related  49.16 
 
 		 370 aa  288  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  47.09 
 
 		 387 aa  280  4e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  48.46 
 
 		 375 aa  268  7e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1163  ABC transporter related  47.4 
 
 		 372 aa  268  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0455034  normal  0.217765 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0178  ABC transporter related  50.14 
 
 		 346 aa  267  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360514 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  47.29 
 
 		 371 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1807  ABC transporter related  46.82 
 
 		 367 aa  265  5.999999999999999e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0324794  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  48.1 
 
 		 373 aa  265  8e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  44.67 
 
 		 375 aa  263  3e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  44.52 
 
 		 369 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0569  ABC transporter related  46.96 
 
 		 391 aa  260  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  45.51 
 
 		 368 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  39.14 
 
 		 350 aa  261  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  43.02 
 
 		 347 aa  259  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 		 341 aa  259  4e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2539  ABC transporter, ATPase subunit  46.97 
 
 		 378 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.256647  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0578  ABC transporter related  46.38 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1198  ABC transporter related  44.74 
 
 		 378 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0576508 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.21 
 
 		 367 aa  257  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.9 
 
 		 367 aa  256  5e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  43.32 
 
 		 369 aa  255  7e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  46.18 
 
 		 358 aa  255  7e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  38.86 
 
 		 343 aa  253  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  43.17 
 
 		 364 aa  252  6e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  40.74 
 
 		 369 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 		 353 aa  252  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  40.74 
 
 		 369 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  45.42 
 
 		 389 aa  251  9.000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  44.6 
 
 		 371 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  40 
 
 		 357 aa  251  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  40.17 
 
 		 369 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.44 
 
 		 349 aa  251  2e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  50.52 
 
 		 355 aa  250  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  47.64 
 
 		 357 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  46.71 
 
 		 378 aa  249  6e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  43.35 
 
 		 369 aa  248  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  43.38 
 
 		 369 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  45 
 
 		 377 aa  246  3e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1341  ABC transporter related  44.89 
 
 		 362 aa  246  4e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1208  ABC transporter related  45.37 
 
 		 364 aa  246  6e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  38.92 
 
 		 343 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  50 
 
 		 368 aa  244  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  47.9 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  48.51 
 
 		 346 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  51.44 
 
 		 342 aa  243  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  38.15 
 
 		 342 aa  243  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2375  ABC transporter related protein  41.25 
 
 		 347 aa  243  3.9999999999999997e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  45.72 
 
 		 361 aa  243  3.9999999999999997e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  39.02 
 
 		 342 aa  242  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  41.92 
 
 		 352 aa  242  7e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  41.24 
 
 		 359 aa  242  9e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  42.96 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  43.19 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  42.61 
 
 		 363 aa  241  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  39.87 
 
 		 343 aa  240  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  38.97 
 
 		 343 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  40.06 
 
 		 348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0811  ATPase  35.16 
 
 		 352 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0326563  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0845  ABC transporter, ATP-binding protein  41.22 
 
 		 340 aa  239  5e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6287  ABC transporter related  49.21 
 
 		 349 aa  239  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  37.43 
 
 		 346 aa  239  5.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.26 
 
 		 352 aa  239  6.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1181  ABC transporter related  53.25 
 
 		 257 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0132418  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  53.25 
 
 		 257 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  53.25 
 
 		 257 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  44.21 
 
 		 363 aa  238  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  43.29 
 
 		 352 aa  238  1e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  44.19 
 
 		 360 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0243  ABC transporter  38.46 
 
 		 340 aa  237  2e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4316  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  52.81 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480122  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  41.88 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07781  ABC transporter ATP-binding protein  36.1 
 
 		 352 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  39.23 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  41.88 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  42.72 
 
 		 342 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08641  ABC transporter ATP-binding protein  36.49 
 
 		 352 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  41.88 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08671  ABC transporter ATP-binding protein  36.89 
 
 		 352 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1415  ABC transporter related  43.87 
 
 		 353 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.15 
 
 		 373 aa  236  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  43.1 
 
 		 366 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  52.81 
 
 		 257 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  41.92 
 
 		 363 aa  236  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17671  ABC transporter ATP-binding protein  46.26 
 
 		 352 aa  235  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1091  ABC transporter related  52.38 
 
 		 257 aa  235  8e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  55.16 
 
 		 257 aa  235  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  41.29 
 
 		 349 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6577  ABC transporter related  44.37 
 
 		 359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446279 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  43.89 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  50.87 
 
 		 352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  41.29 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  45.7 
 
 		 355 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  41.29 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1646  ABC transporter related  49.24 
 
 		 352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.324172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  44.79 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>