More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1163 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1163  ABC transporter related  100 
 
 		 372 aa  747    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0455034  normal  0.217765 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1807  ABC transporter related  68.77 
 
 		 367 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0324794  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  54 
 
 		 373 aa  345  8.999999999999999e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  48.7 
 
 		 365 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  48.28 
 
 		 363 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  46.94 
 
 		 373 aa  288  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  44.67 
 
 		 364 aa  286  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1208  ABC transporter related  44.51 
 
 		 364 aa  281  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0550  ABC transporter related  43.89 
 
 		 389 aa  277  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.698087  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  43.22 
 
 		 371 aa  276  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  42.02 
 
 		 375 aa  275  9e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1341  ABC transporter related  42.74 
 
 		 362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.21 
 
 		 367 aa  270  4e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  40.93 
 
 		 367 aa  267  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  47.37 
 
 		 357 aa  265  7e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2539  ABC transporter, ATPase subunit  43.3 
 
 		 378 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.256647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1198  ABC transporter related  43.02 
 
 		 378 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0576508 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0542  ABC transporter related  42.98 
 
 		 370 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0578  ABC transporter related  45.94 
 
 		 352 aa  257  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0569  ABC transporter related  45.4 
 
 		 391 aa  256  6e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0178  ABC transporter related  45.91 
 
 		 346 aa  255  7e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360514 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  43.95 
 
 		 387 aa  253  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  45.98 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  43.41 
 
 		 355 aa  246  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  38.79 
 
 		 342 aa  243  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  41.1 
 
 		 375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  43.65 
 
 		 347 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  43.09 
 
 		 348 aa  237  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  43.18 
 
 		 353 aa  236  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0845  ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 		 340 aa  236  7e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  41.72 
 
 		 389 aa  236  7e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0243  ABC transporter  35.78 
 
 		 340 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  36.57 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  40.82 
 
 		 357 aa  233  3e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0965  ABC transporter related  45.97 
 
 		 343 aa  233  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.612494 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0811  ATPase  37.24 
 
 		 352 aa  233  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0326563  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  40.85 
 
 		 342 aa  232  7.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6773  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 		 363 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78331  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1587  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.69 
 
 		 376 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.167194 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.15 
 
 		 362 aa  231  2e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  44.84 
 
 		 371 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  42.81 
 
 		 352 aa  229  5e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  36.36 
 
 		 349 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  36.49 
 
 		 349 aa  229  7e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08641  ABC transporter ATP-binding protein  37.65 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  40.85 
 
 		 342 aa  228  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  43.33 
 
 		 368 aa  228  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07781  ABC transporter ATP-binding protein  37.85 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  36.21 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  41.1 
 
 		 343 aa  228  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  36.21 
 
 		 349 aa  228  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  36.29 
 
 		 349 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.3 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  36.36 
 
 		 349 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  41.23 
 
 		 343 aa  228  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  41.75 
 
 		 363 aa  228  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  38.48 
 
 		 342 aa  227  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  36.08 
 
 		 349 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2906  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.97 
 
 		 388 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  36.21 
 
 		 349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2375  ABC transporter related protein  42.47 
 
 		 347 aa  226  6e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3044  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.97 
 
 		 384 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  46.09 
 
 		 359 aa  224  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  36.99 
 
 		 361 aa  224  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4660  ABC transporter related  42.11 
 
 		 347 aa  225  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  39.53 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  40.73 
 
 		 377 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  37.75 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.97 
 
 		 377 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.97 
 
 		 377 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  34.9 
 
 		 367 aa  223  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.97 
 
 		 377 aa  223  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  40.07 
 
 		 342 aa  223  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  44.57 
 
 		 378 aa  223  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  40.79 
 
 		 378 aa  222  7e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  41.56 
 
 		 379 aa  222  8e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6287  ABC transporter related  44.88 
 
 		 349 aa  222  8e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1130  ABC transporter, ATP-binding protein  42.58 
 
 		 355 aa  222  9e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0111  ABC transporter, ATP-binding protein  42.58 
 
 		 355 aa  222  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0949  ABC transporter, ATP-binding protein  42.58 
 
 		 355 aa  222  9e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1504  ABC transporter, ATP-binding protein  42.58 
 
 		 355 aa  222  9e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0881972  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.24 
 
 		 384 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888136  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2997  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.24 
 
 		 384 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412177  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2991  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.87 
 
 		 384 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  41.25 
 
 		 358 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.44 
 
 		 380 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  42.28 
 
 		 346 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  41.81 
 
 		 328 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  42.25 
 
 		 343 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3016  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.24 
 
 		 384 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08671  ABC transporter ATP-binding protein  37.31 
 
 		 352 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09571  ABC transporter ATP-binding protein  41.13 
 
 		 356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0852854  hitchhiker  0.000225107 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.64 
 
 		 343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2274  ABC transporter, ATP-binding protein  42.26 
 
 		 355 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6346  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  41.24 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1034  ABC transporter, ATP-binding protein  42.26 
 
 		 355 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4663  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.15 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1674  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.68 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446059  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.6 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  45.98 
 
 		 355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>