More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6370 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  100 
 
 		 363 aa  693    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  86.98 
 
 		 365 aa  590  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0569  ABC transporter related  53.66 
 
 		 391 aa  328  8e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0578  ABC transporter related  56.47 
 
 		 352 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0542  ABC transporter related  54.67 
 
 		 370 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  51.33 
 
 		 373 aa  302  6.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6287  ABC transporter related  57.44 
 
 		 349 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1163  ABC transporter related  48.28 
 
 		 372 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0455034  normal  0.217765 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  48.28 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.28 
 
 		 367 aa  286  5.999999999999999e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  51.63 
 
 		 357 aa  285  9e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  47.71 
 
 		 364 aa  282  8.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  48.33 
 
 		 373 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1807  ABC transporter related  49.53 
 
 		 367 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0324794  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1341  ABC transporter related  42.98 
 
 		 362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0550  ABC transporter related  49.84 
 
 		 389 aa  272  8.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.698087  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  44.1 
 
 		 371 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  43.18 
 
 		 375 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2539  ABC transporter, ATPase subunit  44.63 
 
 		 378 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.256647  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0178  ABC transporter related  49.85 
 
 		 346 aa  266  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360514 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1198  ABC transporter related  44.63 
 
 		 378 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0576508 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1208  ABC transporter related  42.18 
 
 		 364 aa  265  7e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  50.93 
 
 		 342 aa  263  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  42.42 
 
 		 377 aa  250  3e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  41.71 
 
 		 389 aa  249  4e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  50 
 
 		 355 aa  249  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0811  ATPase  35.17 
 
 		 352 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0326563  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  44.3 
 
 		 387 aa  246  3e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  41.33 
 
 		 369 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  41.91 
 
 		 369 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  41.74 
 
 		 366 aa  246  6.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  46.84 
 
 		 346 aa  245  9e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  45.6 
 
 		 342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  41.33 
 
 		 369 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  43.49 
 
 		 342 aa  242  9e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  42.24 
 
 		 375 aa  241  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07781  ABC transporter ATP-binding protein  37.66 
 
 		 352 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  42.65 
 
 		 353 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  52.1 
 
 		 352 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  41.21 
 
 		 368 aa  239  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  42.14 
 
 		 357 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  43.15 
 
 		 352 aa  238  9e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  40.63 
 
 		 359 aa  238  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  44.67 
 
 		 363 aa  238  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  47.67 
 
 		 378 aa  238  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  41.54 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  46.11 
 
 		 368 aa  237  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08641  ABC transporter ATP-binding protein  34.88 
 
 		 352 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  39.77 
 
 		 369 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  41.67 
 
 		 361 aa  236  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08671  ABC transporter ATP-binding protein  35.4 
 
 		 352 aa  236  6e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  42.61 
 
 		 369 aa  235  9e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  43.93 
 
 		 346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  43.93 
 
 		 346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  43.49 
 
 		 356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  43.93 
 
 		 346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  41.33 
 
 		 347 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  45.62 
 
 		 379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  44.35 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  45.16 
 
 		 333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0243  ABC transporter  37.37 
 
 		 340 aa  233  3e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  41.33 
 
 		 369 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  42.23 
 
 		 353 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0845  ABC transporter, ATP-binding protein  39.86 
 
 		 340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  43.08 
 
 		 365 aa  233  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  50.2 
 
 		 390 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.86 
 
 		 355 aa  232  7.000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  45.43 
 
 		 349 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  45.43 
 
 		 349 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0965  ABC transporter related  47.47 
 
 		 343 aa  232  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.612494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  45.43 
 
 		 349 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  36.9 
 
 		 350 aa  231  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0902  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.43 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  41.3 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  44.17 
 
 		 363 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  39.82 
 
 		 357 aa  230  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.07 
 
 		 371 aa  230  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2856  ABC transporter related  45.08 
 
 		 359 aa  229  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.469512 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00458  ATP-binding component of putrescine transport system  40.44 
 
 		 419 aa  229  7e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0033874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1017  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.88 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0871  ABC transporter related  38.71 
 
 		 405 aa  228  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.010866  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  44.24 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  34.46 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  44.24 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  43.37 
 
 		 342 aa  227  2e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  40.12 
 
 		 349 aa  227  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  42.82 
 
 		 374 aa  226  4e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  44.21 
 
 		 354 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1062  ABC transporter related protein  46.08 
 
 		 373 aa  226  4e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.06 
 
 		 363 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17671  ABC transporter ATP-binding protein  42.63 
 
 		 352 aa  226  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2861  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.81 
 
 		 366 aa  226  6e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527786  normal  0.0270955 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  40.43 
 
 		 349 aa  226  6e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  48.21 
 
 		 345 aa  225  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  42.94 
 
 		 363 aa  225  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  42.6 
 
 		 378 aa  225  8e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  43.07 
 
 		 410 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  40.43 
 
 		 349 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.77 
 
 		 362 aa  225  1e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3091  ABC transporter-related protein  50.47 
 
 		 364 aa  225  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539266  normal  0.757537 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>