More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4110 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  94.77 
 
 		 345 aa  648    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  100 
 
 		 345 aa  682    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6134  ABC transporter  64.64 
 
 		 348 aa  434  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.210402  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2839  ABC transporter-like  56.48 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2536  ABC transporter-related protein  56.1 
 
 		 345 aa  355  8.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1461  ABC transporter related  55.17 
 
 		 349 aa  352  5e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1348  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  55.46 
 
 		 349 aa  352  5.9999999999999994e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2712  iron(III)-transport ATP-binding protein  55.17 
 
 		 349 aa  351  8e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.103863  normal  0.0760502 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2519  ABC transporter related  54.97 
 
 		 344 aa  349  4e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00672274  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2428  ABC transporter related  55.07 
 
 		 344 aa  339  5e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1357  ABC transporter related protein  51.73 
 
 		 346 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.157538  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2921  ABC transporter related  50.84 
 
 		 356 aa  336  5e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.912775  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0734  ABC transporter related  55.13 
 
 		 398 aa  335  5e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  56.88 
 
 		 396 aa  332  9e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5748  ABC transporter related  52.48 
 
 		 364 aa  329  4e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2856  ABC transporter related  53.06 
 
 		 359 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.469512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  49.42 
 
 		 349 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  49.42 
 
 		 349 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  49.42 
 
 		 349 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1590  ABC transporter related  52.43 
 
 		 384 aa  281  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408037  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  50.17 
 
 		 346 aa  272  5.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  53.21 
 
 		 350 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4826  ABC transporter related  45.56 
 
 		 352 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160742  normal  0.0580925 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  48.39 
 
 		 342 aa  267  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3648  ABC transporter related protein  48.99 
 
 		 357 aa  265  7e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.473782  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5338  ABC transporter related  46.44 
 
 		 351 aa  263  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.589237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  46.65 
 
 		 333 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  44.88 
 
 		 342 aa  259  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3948  ABC transporter, ATPase subunit  47.84 
 
 		 349 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202107  normal  0.0920868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7419  ABC transporter related  50.29 
 
 		 345 aa  256  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1837  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  46.42 
 
 		 352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332439 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  43.66 
 
 		 371 aa  245  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.37 
 
 		 349 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  43.48 
 
 		 352 aa  242  6e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06260  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  44.48 
 
 		 387 aa  242  7.999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.623028  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  43.89 
 
 		 366 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1017  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.31 
 
 		 388 aa  239  4e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1034  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.26 
 
 		 359 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.330861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  43.84 
 
 		 363 aa  238  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6092  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (polyamine)  41.93 
 
 		 358 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196126  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  45.58 
 
 		 355 aa  237  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  43.17 
 
 		 349 aa  236  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.51 
 
 		 387 aa  235  7e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.38 
 
 		 356 aa  235  8e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.42 
 
 		 355 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.44 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2641  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  39.38 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  44.12 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  42.56 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.12 
 
 		 371 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6541  ABC transporter related  41.39 
 
 		 359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131089 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0947  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.51 
 
 		 378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  42.27 
 
 		 387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1132  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.89 
 
 		 378 aa  233  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  39.74 
 
 		 349 aa  233  5e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  45.02 
 
 		 356 aa  232  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  47.69 
 
 		 352 aa  232  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 346 aa  232  7.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  42.56 
 
 		 336 aa  232  7.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1597  spermidine/putrescine import ATP-binding protein  46.25 
 
 		 355 aa  232  8.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0206589  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  40.76 
 
 		 342 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6246  ABC transporter related  40.72 
 
 		 359 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836052  normal  0.532087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.09 
 
 		 354 aa  231  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1095  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.88 
 
 		 378 aa  229  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.703893  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1208  ABC transporter related  41.9 
 
 		 364 aa  229  4e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  39.17 
 
 		 342 aa  229  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2020  ABC transporter related  44.51 
 
 		 353 aa  229  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194585  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3361  ABC transporter related  48.56 
 
 		 364 aa  229  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.322105  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  38.96 
 
 		 378 aa  229  7e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2917  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.96 
 
 		 378 aa  229  7e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0239568  normal  0.458628 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  42.48 
 
 		 356 aa  229  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2999  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.96 
 
 		 378 aa  229  7e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0253252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3096  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.96 
 
 		 378 aa  229  7e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0831246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0974  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.51 
 
 		 378 aa  229  7e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.41 
 
 		 366 aa  228  9e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  44.01 
 
 		 389 aa  228  9e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5592  ABC transporter related  40.5 
 
 		 358 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0353  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.63 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00527297  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  40.13 
 
 		 342 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  40 
 
 		 373 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  44.96 
 
 		 353 aa  227  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.63 
 
 		 367 aa  227  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.81 
 
 		 377 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  39.37 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  37.39 
 
 		 349 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.57 
 
 		 381 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  42.61 
 
 		 375 aa  227  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.3 
 
 		 370 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0015  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  42.12 
 
 		 365 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2539  ABC transporter, ATPase subunit  38.35 
 
 		 378 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.256647  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  37.39 
 
 		 349 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1864  ABC transporter related  42.36 
 
 		 361 aa  226  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2072  ABC transporter related protein  43.83 
 
 		 341 aa  226  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.3 
 
 		 367 aa  226  6e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  40.82 
 
 		 377 aa  226  6e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.05 
 
 		 368 aa  226  6e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  45.11 
 
 		 365 aa  225  7e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3737  ABC transporter related  44.93 
 
 		 349 aa  225  7e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  43.31 
 
 		 360 aa  225  7e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2861  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 		 366 aa  226  7e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527786  normal  0.0270955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>