More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5338 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5338  ABC transporter related  100 
 
 		 351 aa  686    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.589237 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1590  ABC transporter related  77.6 
 
 		 384 aa  557  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408037  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4826  ABC transporter related  54.86 
 
 		 352 aa  348  6e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160742  normal  0.0580925 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3648  ABC transporter related protein  57.76 
 
 		 357 aa  342  7e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.473782  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1837  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  54.86 
 
 		 352 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332439 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  50.86 
 
 		 396 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5748  ABC transporter related  49.86 
 
 		 364 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2020  ABC transporter related  56.13 
 
 		 353 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194585  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  53.43 
 
 		 350 aa  306  3e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2856  ABC transporter related  49.71 
 
 		 359 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.469512 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  51.42 
 
 		 346 aa  301  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  52.17 
 
 		 333 aa  299  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0734  ABC transporter related  48.36 
 
 		 398 aa  297  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2839  ABC transporter-like  45.48 
 
 		 350 aa  295  7e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3948  ABC transporter, ATPase subunit  50.71 
 
 		 349 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202107  normal  0.0920868 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  48.27 
 
 		 342 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  46.44 
 
 		 345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1461  ABC transporter related  44 
 
 		 349 aa  281  9e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2712  iron(III)-transport ATP-binding protein  44 
 
 		 349 aa  281  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.103863  normal  0.0760502 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1348  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 		 349 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  46.7 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  52.05 
 
 		 349 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  46.99 
 
 		 342 aa  279  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  51.74 
 
 		 349 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  51.74 
 
 		 349 aa  276  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2519  ABC transporter related  45.99 
 
 		 344 aa  271  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00672274  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6134  ABC transporter  45.38 
 
 		 348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.210402  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1357  ABC transporter related protein  41.79 
 
 		 346 aa  268  8.999999999999999e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.157538  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2921  ABC transporter related  42.94 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.912775  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  47.28 
 
 		 355 aa  266  5.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2428  ABC transporter related  44.61 
 
 		 344 aa  258  8e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3091  ABC transporter-related protein  48.29 
 
 		 364 aa  257  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539266  normal  0.757537 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2536  ABC transporter-related protein  41.43 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1666  ABC transporter related  47.7 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.022862  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  42.44 
 
 		 371 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7419  ABC transporter related  51.65 
 
 		 345 aa  252  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  43.2 
 
 		 373 aa  248  8e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  48.85 
 
 		 352 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3361  ABC transporter related  48.12 
 
 		 364 aa  247  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.322105  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  41.05 
 
 		 359 aa  245  6.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06260  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  45.35 
 
 		 387 aa  245  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.623028  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  42.98 
 
 		 352 aa  239  4e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 		 356 aa  239  5e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  39.77 
 
 		 366 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.12 
 
 		 367 aa  238  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.78 
 
 		 381 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1341  ABC transporter related  40.12 
 
 		 362 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  43.79 
 
 		 367 aa  235  7e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.45 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2539  ABC transporter, ATPase subunit  42.15 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.256647  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  43.13 
 
 		 355 aa  233  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1198  ABC transporter related  42.12 
 
 		 378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0576508 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  42.25 
 
 		 349 aa  233  5e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.06 
 
 		 355 aa  232  7.000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  42.21 
 
 		 378 aa  231  1e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2072  ABC transporter related protein  44.57 
 
 		 341 aa  231  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.04 
 
 		 352 aa  230  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  45.56 
 
 		 358 aa  229  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1234  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  41.83 
 
 		 367 aa  229  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0541634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  42.9 
 
 		 347 aa  229  6e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  43.98 
 
 		 353 aa  228  9e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  41.38 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  41.38 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.02 
 
 		 380 aa  227  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  44.83 
 
 		 363 aa  227  3e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  39.6 
 
 		 361 aa  226  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  41.81 
 
 		 378 aa  226  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  39.19 
 
 		 360 aa  226  4e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  40.9 
 
 		 377 aa  225  9e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  41.52 
 
 		 353 aa  225  9e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  41.16 
 
 		 387 aa  224  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4911  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.27 
 
 		 336 aa  225  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2195  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.98 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643313  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  42.4 
 
 		 348 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.86 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0353  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.16 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00527297  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  41.43 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  39.53 
 
 		 375 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  45.25 
 
 		 527 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  40.56 
 
 		 369 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4770  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.13 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1611  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 		 381 aa  223  3e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.25 
 
 		 373 aa  223  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  42.95 
 
 		 364 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  45.61 
 
 		 363 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1497  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.13 
 
 		 383 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  38.66 
 
 		 342 aa  223  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0542  ABC transporter related  44.44 
 
 		 370 aa  222  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  42.93 
 
 		 364 aa  222  9e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6974  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding component  42.48 
 
 		 345 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  41.55 
 
 		 357 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3431  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.79 
 
 		 371 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  42.49 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  42.49 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  44.83 
 
 		 365 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  38.33 
 
 		 342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  40.72 
 
 		 357 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6271  ABC transporter related  43.24 
 
 		 356 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0482396  normal  0.559983 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.44 
 
 		 368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.24 
 
 		 378 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>