More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2839 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2839  ABC transporter-like  100 
 
 		 350 aa  712    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2519  ABC transporter related  56.65 
 
 		 344 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00672274  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  56.48 
 
 		 345 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1461  ABC transporter related  54.11 
 
 		 349 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2536  ABC transporter-related protein  56.03 
 
 		 345 aa  362  5.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1348  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  54.11 
 
 		 349 aa  361  8e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  56.2 
 
 		 345 aa  362  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2712  iron(III)-transport ATP-binding protein  54.11 
 
 		 349 aa  361  9e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.103863  normal  0.0760502 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2428  ABC transporter related  55.46 
 
 		 344 aa  358  8e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6134  ABC transporter  55.46 
 
 		 348 aa  352  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.210402  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1357  ABC transporter related protein  54.05 
 
 		 346 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.157538  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2921  ABC transporter related  51.69 
 
 		 356 aa  351  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.912775  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  55.59 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5748  ABC transporter related  50.86 
 
 		 364 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2856  ABC transporter related  50.86 
 
 		 359 aa  325  9e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.469512 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0734  ABC transporter related  55.91 
 
 		 398 aa  321  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  48.42 
 
 		 349 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  48.42 
 
 		 349 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  48.42 
 
 		 349 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1590  ABC transporter related  43.78 
 
 		 384 aa  280  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408037  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5338  ABC transporter related  45.48 
 
 		 351 aa  279  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.589237 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3648  ABC transporter related protein  46.97 
 
 		 357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.473782  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  44.57 
 
 		 350 aa  271  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4826  ABC transporter related  43.34 
 
 		 352 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160742  normal  0.0580925 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3948  ABC transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 		 349 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202107  normal  0.0920868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  44.3 
 
 		 342 aa  253  4.0000000000000004e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  43.02 
 
 		 333 aa  252  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  44.73 
 
 		 346 aa  251  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1837  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  43.63 
 
 		 352 aa  249  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332439 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  42.86 
 
 		 342 aa  239  6.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  42.94 
 
 		 352 aa  237  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7419  ABC transporter related  45.69 
 
 		 345 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  42.48 
 
 		 355 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1666  ABC transporter related  43.27 
 
 		 374 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.022862  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  39.13 
 
 		 343 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  40.43 
 
 		 342 aa  230  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2002  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.51 
 
 		 341 aa  229  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06260  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  43.03 
 
 		 387 aa  229  5e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.623028  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.44 
 
 		 372 aa  229  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  41.16 
 
 		 375 aa  228  9e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.79 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3201  ABC transporter component  40.79 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.28 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  40.5 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 		 353 aa  227  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  37.57 
 
 		 366 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3361  ABC transporter related  45.17 
 
 		 364 aa  226  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.322105  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  40.34 
 
 		 378 aa  226  4e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3091  ABC transporter-related protein  42.44 
 
 		 364 aa  226  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539266  normal  0.757537 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2020  ABC transporter related  43.47 
 
 		 353 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194585  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  41.77 
 
 		 387 aa  226  6e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.12 
 
 		 400 aa  226  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  43.26 
 
 		 360 aa  226  6e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  46.9 
 
 		 343 aa  225  7e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.84 
 
 		 349 aa  225  9e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  46.51 
 
 		 343 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  42.3 
 
 		 377 aa  224  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.1 
 
 		 377 aa  225  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  40.54 
 
 		 349 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3890  ABC transporter-related protein  41.64 
 
 		 354 aa  225  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.59 
 
 		 341 aa  223  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  42.73 
 
 		 363 aa  223  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  42.39 
 
 		 375 aa  223  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  40.54 
 
 		 349 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  40.87 
 
 		 359 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  40.24 
 
 		 349 aa  223  6e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.88 
 
 		 373 aa  223  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17640  polyamine transport protein PotA  40.12 
 
 		 363 aa  222  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.02 
 
 		 354 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  39.56 
 
 		 342 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0915  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.88 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  46.05 
 
 		 352 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0951  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.88 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  41.28 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1031  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.88 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  38.33 
 
 		 373 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0983  putrescine transporter ATP-binding subunit  47.18 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.79 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  40.79 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.38 
 
 		 346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  38.23 
 
 		 353 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  43.53 
 
 		 363 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.76 
 
 		 372 aa  220  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1012  putrescine transporter ATP-binding subunit  43.54 
 
 		 377 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3044  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.44 
 
 		 384 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2906  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.44 
 
 		 388 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1341  ABC transporter related  39.71 
 
 		 362 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  41.56 
 
 		 353 aa  219  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  40.06 
 
 		 366 aa  219  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.28 
 
 		 384 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.888136  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3016  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.5 
 
 		 384 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2997  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.28 
 
 		 384 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412177  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.64 
 
 		 337 aa  219  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  39.59 
 
 		 336 aa  219  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  38.33 
 
 		 342 aa  219  6e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  40 
 
 		 389 aa  219  7e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.37 
 
 		 371 aa  219  7e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6066  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.44 
 
 		 381 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.96 
 
 		 355 aa  219  7e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>