More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4448 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  100 
 
 		 373 aa  743    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  54.08 
 
 		 371 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1341  ABC transporter related  54.26 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  52.41 
 
 		 375 aa  363  4e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2539  ABC transporter, ATPase subunit  53.87 
 
 		 378 aa  355  5e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.256647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1198  ABC transporter related  53.87 
 
 		 378 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0576508 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1208  ABC transporter related  49.86 
 
 		 364 aa  339  5e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0550  ABC transporter related  50.29 
 
 		 389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.698087  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1163  ABC transporter related  46.94 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0455034  normal  0.217765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  48.35 
 
 		 373 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  48.33 
 
 		 363 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1807  ABC transporter related  52.46 
 
 		 367 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0324794  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  48.02 
 
 		 365 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  43.14 
 
 		 364 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  46.13 
 
 		 342 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.93 
 
 		 367 aa  268  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 		 367 aa  267  2.9999999999999995e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  49.5 
 
 		 357 aa  262  6e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  43.26 
 
 		 377 aa  262  8.999999999999999e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  40.46 
 
 		 366 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  42.2 
 
 		 389 aa  255  7e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  43.42 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  43.02 
 
 		 368 aa  250  3e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  44.98 
 
 		 355 aa  248  9e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  42.54 
 
 		 387 aa  247  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  46.28 
 
 		 346 aa  248  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  44.22 
 
 		 342 aa  246  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2519  ABC transporter related  43.46 
 
 		 344 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00672274  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  42.24 
 
 		 355 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  40.56 
 
 		 375 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  42.77 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  42.46 
 
 		 378 aa  244  3e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  44.44 
 
 		 349 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  44.44 
 
 		 349 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  41.19 
 
 		 369 aa  242  6e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0178  ABC transporter related  43.64 
 
 		 346 aa  242  7e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360514 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  44.48 
 
 		 352 aa  242  7.999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  38.5 
 
 		 378 aa  241  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  44.13 
 
 		 349 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.52 
 
 		 380 aa  239  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4710  ABC transporter related  43.02 
 
 		 359 aa  239  8e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0388309 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  42.77 
 
 		 347 aa  238  9e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.53 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0243  ABC transporter  35.87 
 
 		 340 aa  237  2e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4194  ABC transporter related  43.06 
 
 		 361 aa  236  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.812216  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.97 
 
 		 400 aa  236  6e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  42.46 
 
 		 368 aa  236  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4565  ABC transporter related  42.77 
 
 		 361 aa  236  6e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.155575 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  38.87 
 
 		 357 aa  235  9e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  41.03 
 
 		 359 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  44.19 
 
 		 352 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.56 
 
 		 352 aa  235  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5190  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  44.25 
 
 		 352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.447906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.94 
 
 		 370 aa  233  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  40.29 
 
 		 377 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2861  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.85 
 
 		 366 aa  234  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527786  normal  0.0270955 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5748  ABC transporter related  39.36 
 
 		 364 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  40.23 
 
 		 353 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0845  ABC transporter, ATP-binding protein  35.19 
 
 		 340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.42 
 
 		 377 aa  233  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6773  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.58 
 
 		 363 aa  233  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78331  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  40.3 
 
 		 371 aa  232  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2856  ABC transporter related  40.41 
 
 		 359 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.469512 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2921  ABC transporter related  40.91 
 
 		 356 aa  232  8.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.912775  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7452  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.09 
 
 		 374 aa  232  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5137  ABC transporter, ATP-binding protein  44.25 
 
 		 352 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  47.49 
 
 		 381 aa  232  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  41.41 
 
 		 363 aa  232  9e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.77 
 
 		 355 aa  231  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.94 
 
 		 372 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21300  ABC transporter, ATP binding component  41.24 
 
 		 352 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.48 
 
 		 375 aa  231  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  41.85 
 
 		 358 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2286  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.95 
 
 		 377 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5338  ABC transporter related  42.69 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.589237 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0353  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.3 
 
 		 366 aa  230  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00527297  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5010  ABC transporter related  43.97 
 
 		 352 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  40.43 
 
 		 343 aa  229  5e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  46.64 
 
 		 363 aa  229  5e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0983  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.21 
 
 		 377 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  43.65 
 
 		 350 aa  229  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1369  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.51 
 
 		 377 aa  229  7e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0951  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.21 
 
 		 377 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1012  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.21 
 
 		 377 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1031  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.21 
 
 		 377 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0915  putrescine transporter ATP-binding subunit  39.21 
 
 		 377 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  43.65 
 
 		 371 aa  229  8e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3984  ABC transporter related  44.91 
 
 		 354 aa  229  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0820  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (putrescine)  40.37 
 
 		 382 aa  229  8e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768559  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3737  ABC transporter related  41.85 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  41.38 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0883  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.08 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.898473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1011  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.08 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.512048 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0578  ABC transporter related  44.73 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  45.1 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  41.38 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2741  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.08 
 
 		 377 aa  228  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.252768  normal  0.41994 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  39.94 
 
 		 369 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>