More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1801 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  100 
 
 		 375 aa  759    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1341  ABC transporter related  71.91 
 
 		 362 aa  529  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1208  ABC transporter related  69.41 
 
 		 364 aa  503  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  68.56 
 
 		 371 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2539  ABC transporter, ATPase subunit  68.18 
 
 		 378 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.256647  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1198  ABC transporter related  68.18 
 
 		 378 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0576508 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  52.41 
 
 		 373 aa  363  4e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0550  ABC transporter related  49.59 
 
 		 389 aa  332  8e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.698087  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1807  ABC transporter related  46.8 
 
 		 367 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0324794  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  46.06 
 
 		 365 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1163  ABC transporter related  42.02 
 
 		 372 aa  275  9e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0455034  normal  0.217765 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  43.18 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  48.7 
 
 		 373 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  48.59 
 
 		 357 aa  265  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.72 
 
 		 367 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  48.35 
 
 		 367 aa  258  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  42.64 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  40.11 
 
 		 364 aa  256  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0243  ABC transporter  37.78 
 
 		 340 aa  255  9e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  48.33 
 
 		 352 aa  252  8.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  43.52 
 
 		 349 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  43.52 
 
 		 349 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0845  ABC transporter, ATP-binding protein  36.93 
 
 		 340 aa  250  3e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  42.48 
 
 		 375 aa  248  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  43.21 
 
 		 349 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  39.18 
 
 		 357 aa  246  6e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  44.48 
 
 		 352 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  40.05 
 
 		 396 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  38.02 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2921  ABC transporter related  41.35 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.912775  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1959  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.95 
 
 		 377 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  39.05 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1693  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.95 
 
 		 400 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.08 
 
 		 377 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0965  ABC transporter related  47.7 
 
 		 343 aa  241  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.612494 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1369  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.32 
 
 		 377 aa  239  6.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1564  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.02 
 
 		 377 aa  239  8e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2519  ABC transporter related  41.77 
 
 		 344 aa  239  8e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00672274  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2729  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.02 
 
 		 377 aa  239  8e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2644  putrescine transporter ATP-binding subunit  38.02 
 
 		 377 aa  239  8e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  41.67 
 
 		 342 aa  238  9e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  38.9 
 
 		 359 aa  237  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  38.14 
 
 		 369 aa  237  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  45.1 
 
 		 347 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  48.66 
 
 		 363 aa  235  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00860  putrescine transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  37.73 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2787  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.73 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0542  ABC transporter related  41.36 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0915  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.31 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2741  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.73 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.252768  normal  0.41994 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1031  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.31 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0951  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.31 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1012  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.31 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00866  hypothetical protein  37.73 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0958  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.73 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1011  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.73 
 
 		 377 aa  233  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.512048 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0883  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.73 
 
 		 377 aa  233  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.898473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0178  ABC transporter related  46.13 
 
 		 346 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360514 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2476  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.79 
 
 		 377 aa  233  5e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.615862  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0927  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.47 
 
 		 377 aa  233  5e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0983  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.31 
 
 		 377 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.244699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1357  ABC transporter related protein  42.45 
 
 		 346 aa  233  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.157538  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2286  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.98 
 
 		 377 aa  232  6e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  46.32 
 
 		 371 aa  233  6e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  41.84 
 
 		 387 aa  232  9e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2428  ABC transporter related  44.04 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  43.82 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  41.88 
 
 		 360 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2385  putrescine transporter ATP-binding subunit  37.43 
 
 		 375 aa  231  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  40.32 
 
 		 366 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0569  ABC transporter related  43.4 
 
 		 391 aa  229  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  39.56 
 
 		 369 aa  229  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0939  ABC putrescine transporter, ATPase subunit PotG  35.46 
 
 		 387 aa  229  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301968  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  40.48 
 
 		 342 aa  229  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0578  ABC transporter related  43.4 
 
 		 352 aa  229  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1366  putative putrescine transport ATP-binding protein  35.98 
 
 		 373 aa  229  7e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2839  ABC transporter-like  41.16 
 
 		 350 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  43.66 
 
 		 358 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  40.83 
 
 		 350 aa  228  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  42.61 
 
 		 345 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4663  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.95 
 
 		 387 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  42.55 
 
 		 369 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  39.1 
 
 		 342 aa  226  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  42.17 
 
 		 363 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  39.45 
 
 		 348 aa  226  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1461  ABC transporter related  42.24 
 
 		 349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.19 
 
 		 387 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  39.63 
 
 		 333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2712  iron(III)-transport ATP-binding protein  42.24 
 
 		 349 aa  226  6e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.103863  normal  0.0760502 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1348  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 		 349 aa  226  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  41.27 
 
 		 363 aa  226  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3016  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.19 
 
 		 384 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  44.88 
 
 		 355 aa  224  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2856  ABC transporter related  42.75 
 
 		 359 aa  225  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.469512 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2991  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.5 
 
 		 384 aa  225  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  38.44 
 
 		 353 aa  224  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2906  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.46 
 
 		 388 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6066  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.44 
 
 		 381 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0633  putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.02 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375714  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  46.09 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>