More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0542 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0542  ABC transporter related  100 
 
 		 370 aa  702    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0569  ABC transporter related  78.11 
 
 		 391 aa  527  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0578  ABC transporter related  80.4 
 
 		 352 aa  512  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6287  ABC transporter related  67.84 
 
 		 349 aa  401  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  57.14 
 
 		 365 aa  330  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  54.67 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  53.01 
 
 		 373 aa  295  6e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  49.42 
 
 		 357 aa  285  8e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0550  ABC transporter related  45.07 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.698087  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.82 
 
 		 367 aa  266  5e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  45.53 
 
 		 367 aa  264  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1807  ABC transporter related  45.87 
 
 		 367 aa  262  8.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0324794  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  46.27 
 
 		 364 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  44.37 
 
 		 387 aa  259  4e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1163  ABC transporter related  42.98 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0455034  normal  0.217765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  45.93 
 
 		 342 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  48.05 
 
 		 352 aa  255  9e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  44.73 
 
 		 363 aa  247  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  44.2 
 
 		 371 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  44.22 
 
 		 375 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  47.42 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  45.16 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  45.16 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  44.05 
 
 		 349 aa  238  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  45.16 
 
 		 349 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  40 
 
 		 366 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  44.84 
 
 		 349 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2539  ABC transporter, ATPase subunit  44.2 
 
 		 378 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.256647  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  45.05 
 
 		 378 aa  236  6e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  48.4 
 
 		 342 aa  236  6e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  43.27 
 
 		 342 aa  235  7e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  44.01 
 
 		 349 aa  235  8e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1198  ABC transporter related  44.2 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0576508 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  41.36 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1341  ABC transporter related  41.69 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  44.34 
 
 		 349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  44.05 
 
 		 349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  42.76 
 
 		 377 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  44.34 
 
 		 349 aa  233  5e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  41.16 
 
 		 342 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  41.32 
 
 		 350 aa  232  8.000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  43.81 
 
 		 389 aa  231  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  40.06 
 
 		 357 aa  230  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  45.28 
 
 		 346 aa  230  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  42.23 
 
 		 328 aa  230  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  42.32 
 
 		 347 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  38.68 
 
 		 349 aa  228  9e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  43.71 
 
 		 361 aa  228  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  48.69 
 
 		 352 aa  227  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  40.06 
 
 		 330 aa  226  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  43.38 
 
 		 358 aa  226  7e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.67 
 
 		 370 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  45.45 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0845  ABC transporter, ATP-binding protein  36.69 
 
 		 340 aa  224  2e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  40.28 
 
 		 357 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17671  ABC transporter ATP-binding protein  43.63 
 
 		 352 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1181  ABC transporter related  53.19 
 
 		 257 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0132418  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  42.22 
 
 		 373 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  43.55 
 
 		 359 aa  223  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  41.67 
 
 		 349 aa  223  4.9999999999999996e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09571  ABC transporter ATP-binding protein  45.11 
 
 		 356 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0852854  hitchhiker  0.000225107 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  44.97 
 
 		 341 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1091  ABC transporter related  53.85 
 
 		 257 aa  222  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  52.77 
 
 		 257 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  52.77 
 
 		 257 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  55.45 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  42.15 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0178  ABC transporter related  43.02 
 
 		 346 aa  222  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.360514 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  38.72 
 
 		 378 aa  222  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  44.71 
 
 		 368 aa  220  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1208  ABC transporter related  44.03 
 
 		 364 aa  220  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  41.21 
 
 		 374 aa  220  3e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  40.11 
 
 		 343 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  41.62 
 
 		 354 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  39.49 
 
 		 369 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4316  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  51.91 
 
 		 257 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480122  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0750  ABC transporter related  40.43 
 
 		 330 aa  219  6e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3091  ABC transporter-related protein  48.36 
 
 		 364 aa  219  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539266  normal  0.757537 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  40.5 
 
 		 363 aa  219  7e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6134  ABC transporter  42.99 
 
 		 348 aa  219  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.210402  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  47.2 
 
 		 352 aa  219  7.999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2519  ABC transporter related  43.53 
 
 		 344 aa  219  8.999999999999998e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00672274  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  39.83 
 
 		 369 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  39.37 
 
 		 369 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3121  ABC transporter related  43.86 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  39.2 
 
 		 369 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.83 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  37.24 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2858  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.2 
 
 		 259 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0664638  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  36.95 
 
 		 343 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  44.55 
 
 		 350 aa  217  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  48.59 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  41.34 
 
 		 363 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  41.4 
 
 		 366 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0730  ABC transporter related  41.35 
 
 		 330 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  40.4 
 
 		 368 aa  216  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  42.14 
 
 		 344 aa  216  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  40 
 
 		 362 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  40.53 
 
 		 357 aa  216  7e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3361  ABC transporter related  47.23 
 
 		 364 aa  216  8e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.322105  normal  0.651915 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>