More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0846 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  100 
 
 		 342 aa  694    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  67.44 
 
 		 349 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  67.15 
 
 		 349 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  67.15 
 
 		 349 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  66.86 
 
 		 349 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  67.54 
 
 		 342 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  66.67 
 
 		 349 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  66.37 
 
 		 343 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  66.38 
 
 		 349 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  66.09 
 
 		 349 aa  462  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  65.12 
 
 		 349 aa  464  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  67.25 
 
 		 349 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  65.79 
 
 		 342 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  64.62 
 
 		 342 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  61.7 
 
 		 341 aa  424  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  48.08 
 
 		 343 aa  334  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  47.65 
 
 		 343 aa  330  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  47.94 
 
 		 343 aa  326  3e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  47.97 
 
 		 346 aa  322  8e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  50.83 
 
 		 350 aa  305  9.000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  45.85 
 
 		 349 aa  301  1e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  41.94 
 
 		 369 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  43.99 
 
 		 368 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  41.94 
 
 		 369 aa  282  7.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  43.27 
 
 		 369 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  42.23 
 
 		 369 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  43.07 
 
 		 369 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3126  ABC transporter related  41.89 
 
 		 361 aa  280  4e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1152  ABC transporter related protein  42.18 
 
 		 361 aa  277  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523882  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  42.23 
 
 		 369 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  41.09 
 
 		 357 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  41.03 
 
 		 369 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  47.18 
 
 		 342 aa  273  3e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  41.81 
 
 		 371 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  42.52 
 
 		 353 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  43.07 
 
 		 357 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  43.43 
 
 		 377 aa  269  4e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  39.59 
 
 		 358 aa  269  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  41.35 
 
 		 347 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  40.64 
 
 		 375 aa  267  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  45.96 
 
 		 360 aa  265  8e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  40.36 
 
 		 355 aa  264  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  41.67 
 
 		 389 aa  263  3e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  39.59 
 
 		 361 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  39.71 
 
 		 348 aa  259  6e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2833  ABC transporter related  43.52 
 
 		 354 aa  259  6e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.27535  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  39.03 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  41.62 
 
 		 366 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  40.73 
 
 		 356 aa  256  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  38.2 
 
 		 355 aa  255  9e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  39.83 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  39.77 
 
 		 387 aa  253  5.000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  40.74 
 
 		 353 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  40.43 
 
 		 353 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  40.57 
 
 		 386 aa  250  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  40.88 
 
 		 378 aa  249  4e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  39.26 
 
 		 365 aa  249  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  41.82 
 
 		 347 aa  249  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  40.75 
 
 		 346 aa  249  5e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  42.54 
 
 		 330 aa  249  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  42.86 
 
 		 355 aa  249  6e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  39.88 
 
 		 353 aa  249  6e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  40.69 
 
 		 354 aa  249  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  41.81 
 
 		 342 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  40.76 
 
 		 356 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18600  ABC transporter ATP-binding protein  42.82 
 
 		 360 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152976 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1608  ABC transporter ATP-binding protein  42.52 
 
 		 360 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.34 
 
 		 353 aa  246  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.94 
 
 		 354 aa  246  4e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0750  ABC transporter related  41.21 
 
 		 330 aa  245  8e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.41 
 
 		 352 aa  245  9e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0811  ATPase  39.68 
 
 		 352 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0326563  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  40.94 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  38.68 
 
 		 358 aa  243  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  37.77 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  38.68 
 
 		 358 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  43.92 
 
 		 368 aa  243  3.9999999999999997e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  38.79 
 
 		 360 aa  242  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  38.79 
 
 		 360 aa  242  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  41.01 
 
 		 329 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.69 
 
 		 367 aa  242  7e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  38.99 
 
 		 357 aa  242  7e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.5 
 
 		 353 aa  242  7.999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  40.58 
 
 		 329 aa  242  9e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  41.49 
 
 		 363 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  42.77 
 
 		 356 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  40.95 
 
 		 329 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  43.26 
 
 		 362 aa  241  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.5 
 
 		 353 aa  241  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  41.59 
 
 		 352 aa  240  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.91 
 
 		 363 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  41.69 
 
 		 367 aa  241  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  39.21 
 
 		 353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1524  ABC transporter, ATP-binding protein  39.51 
 
 		 326 aa  239  4e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.25 
 
 		 352 aa  239  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  39.41 
 
 		 337 aa  239  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.29 
 
 		 329 aa  239  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  38.11 
 
 		 410 aa  239  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  39.88 
 
 		 366 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  41.82 
 
 		 345 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>