More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2833 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2833  ABC transporter related  100 
 
 		 354 aa  731    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.27535  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1019  ABC transporter related  69.97 
 
 		 354 aa  522  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3126  ABC transporter related  55.2 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1152  ABC transporter related protein  55.2 
 
 		 361 aa  393  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523882  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  43.84 
 
 		 349 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  42.48 
 
 		 343 aa  275  7e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  45.59 
 
 		 343 aa  272  7e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  42.18 
 
 		 343 aa  272  8.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  44.12 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  43.15 
 
 		 342 aa  267  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  41.64 
 
 		 342 aa  267  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.65 
 
 		 343 aa  266  5e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  43.67 
 
 		 349 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  43.67 
 
 		 349 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  43.67 
 
 		 349 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  43.37 
 
 		 349 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  43.52 
 
 		 342 aa  259  6e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.41 
 
 		 349 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  42.65 
 
 		 349 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  41.71 
 
 		 349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  44.37 
 
 		 349 aa  253  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  42.69 
 
 		 341 aa  252  6e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  42.36 
 
 		 349 aa  252  7e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  39.3 
 
 		 342 aa  250  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  42.81 
 
 		 350 aa  233  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  38.08 
 
 		 369 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  37.61 
 
 		 358 aa  230  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  40.12 
 
 		 368 aa  228  9e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  38.72 
 
 		 369 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  39.88 
 
 		 355 aa  225  8e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  36.44 
 
 		 366 aa  225  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  36.1 
 
 		 369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  36.1 
 
 		 369 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  36.1 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  37.15 
 
 		 368 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  37.64 
 
 		 347 aa  220  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  36.44 
 
 		 369 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  35.53 
 
 		 369 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  38.64 
 
 		 377 aa  219  7e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  37.14 
 
 		 353 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  37.32 
 
 		 357 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  37.54 
 
 		 361 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  37.72 
 
 		 342 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  39.47 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  36 
 
 		 375 aa  210  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  38.87 
 
 		 336 aa  209  5e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  40.33 
 
 		 353 aa  208  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  38.92 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  37.54 
 
 		 371 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  37.97 
 
 		 348 aa  203  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  36.52 
 
 		 360 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  36.52 
 
 		 360 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  38.73 
 
 		 410 aa  203  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  36.88 
 
 		 387 aa  201  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0750  ABC transporter related  37.23 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  37.39 
 
 		 329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  36.55 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  34.22 
 
 		 390 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  37.09 
 
 		 329 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.62 
 
 		 362 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0730  ABC transporter related  37.23 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  32.94 
 
 		 342 aa  199  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  35.98 
 
 		 330 aa  199  7.999999999999999e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  36.87 
 
 		 363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1101  ABC transport system ATP-binding protein  33.92 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  36.44 
 
 		 359 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  38.87 
 
 		 369 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  37.25 
 
 		 343 aa  197  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  35.51 
 
 		 361 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  36.69 
 
 		 378 aa  196  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5862  ABC transporter related  36.16 
 
 		 365 aa  196  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.70856 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  36.91 
 
 		 355 aa  196  7e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  32.87 
 
 		 372 aa  196  7e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  34.93 
 
 		 363 aa  196  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  32.58 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  34.75 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  31.79 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  35.8 
 
 		 354 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  36.16 
 
 		 365 aa  194  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  37.31 
 
 		 352 aa  193  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  39.52 
 
 		 342 aa  193  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.35 
 
 		 354 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  39.62 
 
 		 352 aa  192  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1524  ABC transporter, ATP-binding protein  35.76 
 
 		 326 aa  193  5e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0111  ABC transporter, ATP-binding protein  40.59 
 
 		 355 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1130  ABC transporter, ATP-binding protein  40.59 
 
 		 355 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2274  ABC transporter, ATP-binding protein  40.59 
 
 		 355 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1504  ABC transporter, ATP-binding protein  40.59 
 
 		 355 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0881972  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0949  ABC transporter, ATP-binding protein  40.59 
 
 		 355 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.662087  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1034  ABC transporter, ATP-binding protein  40.59 
 
 		 355 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2091  ABC transporter related  40.5 
 
 		 359 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  35.75 
 
 		 389 aa  192  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0079  sulfate/thiosulfate transporter subunit  38.68 
 
 		 377 aa  191  1e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.58607  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2906  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.16 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  37.21 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4663  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.01 
 
 		 387 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2400  ABC putrescine transporter, ATPase subunit  38.41 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0939  ABC putrescine transporter, ATPase subunit PotG  35.81 
 
 		 387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301968  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3044  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.16 
 
 		 384 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3862  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 		 360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000929662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>