More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1019 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1019  ABC transporter related  100 
 
 
354 aa  729    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2833  ABC transporter related  69.97 
 
 
354 aa  522  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.27535  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3126  ABC transporter related  56.29 
 
 
361 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1152  ABC transporter related protein  55.46 
 
 
361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523882  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 
349 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  42.98 
 
 
342 aa  266  5e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  40.41 
 
 
343 aa  263  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.35 
 
 
346 aa  262  6e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  40.12 
 
 
343 aa  262  6.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  40.47 
 
 
342 aa  258  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 
343 aa  257  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  41.59 
 
 
343 aa  253  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 
349 aa  247  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  40.17 
 
 
349 aa  247  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  38.42 
 
 
342 aa  247  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  39.36 
 
 
349 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  40.23 
 
 
349 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  41.37 
 
 
349 aa  245  8e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  41.37 
 
 
349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  41.37 
 
 
349 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  39.94 
 
 
349 aa  243  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.91 
 
 
341 aa  242  6e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  41.04 
 
 
349 aa  242  7e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  39.13 
 
 
358 aa  239  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  38.05 
 
 
342 aa  236  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  42.33 
 
 
350 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  37.83 
 
 
355 aa  232  8.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  37.15 
 
 
369 aa  230  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 
369 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  36.09 
 
 
369 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  36.36 
 
 
369 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  37.25 
 
 
369 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  36.65 
 
 
353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  36.47 
 
 
369 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  36.99 
 
 
357 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  36.59 
 
 
368 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  36.26 
 
 
366 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  36.6 
 
 
347 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  37.5 
 
 
368 aa  210  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  37.98 
 
 
329 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  37.74 
 
 
355 aa  209  9e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  37.89 
 
 
371 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  36.45 
 
 
361 aa  208  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  34.56 
 
 
375 aa  207  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  39.35 
 
 
336 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.81 
 
 
329 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  36.8 
 
 
329 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0750  ABC transporter related  36.44 
 
 
330 aa  206  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  39.41 
 
 
336 aa  205  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  36.05 
 
 
329 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  38.46 
 
 
342 aa  203  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  36.39 
 
 
348 aa  203  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  33.24 
 
 
377 aa  203  4e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  36.09 
 
 
339 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  39.86 
 
 
357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0730  ABC transporter related  35.83 
 
 
330 aa  200  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1101  ABC transport system ATP-binding protein  33.82 
 
 
333 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  36.28 
 
 
339 aa  199  6e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.53 
 
 
353 aa  199  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  36.56 
 
 
329 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  35.26 
 
 
378 aa  199  7.999999999999999e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  33.05 
 
 
343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  39.06 
 
 
352 aa  197  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.4 
 
 
372 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  36.23 
 
 
353 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  36.23 
 
 
353 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1608  ABC transporter ATP-binding protein  36.03 
 
 
360 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  38.12 
 
 
346 aa  196  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  36.02 
 
 
331 aa  196  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  35.6 
 
 
330 aa  196  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18600  ABC transporter ATP-binding protein  36.03 
 
 
360 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0152976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  37.39 
 
 
329 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  34.18 
 
 
355 aa  195  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  35.2 
 
 
369 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1208  ABC transporter related  32.32 
 
 
364 aa  195  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  35.38 
 
 
331 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  37.92 
 
 
363 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0053  ABC transporter related  33.62 
 
 
309 aa  194  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.916211  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  33.6 
 
 
390 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  36.49 
 
 
359 aa  193  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  34.27 
 
 
375 aa  192  8e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  34.48 
 
 
373 aa  192  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4799  ABC transporter related  34.92 
 
 
363 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102455  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  36.15 
 
 
328 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  35.01 
 
 
360 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.41 
 
 
367 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  36.2 
 
 
342 aa  189  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.21 
 
 
370 aa  189  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0755  ABC transporter, ATP-binding protein  35.4 
 
 
329 aa  188  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.547928  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.12 
 
 
367 aa  188  1e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1474  ABC transporter related protein  33.62 
 
 
337 aa  188  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00799241  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  37.15 
 
 
360 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.54 
 
 
354 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0811  ATPase  34.86 
 
 
352 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0326563  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1642  ABC-type sugar transport system, ATPase component  31.88 
 
 
361 aa  187  2e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174606  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08671  ABC transporter ATP-binding protein  35.63 
 
 
352 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  36.08 
 
 
373 aa  187  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.04 
 
 
362 aa  187  3e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1904  ATP-binding component of putrescine transport system  36.81 
 
 
371 aa  186  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.188633  normal  0.381059 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  34.92 
 
 
353 aa  186  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>