More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0638 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  100 
 
 		 343 aa  698    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  70.18 
 
 		 342 aa  489  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  66.37 
 
 		 342 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  67.84 
 
 		 342 aa  461  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  66.96 
 
 		 342 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  66.76 
 
 		 349 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  66.47 
 
 		 349 aa  457  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  66.47 
 
 		 349 aa  455  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  66.76 
 
 		 349 aa  457  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  64.93 
 
 		 349 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  65.61 
 
 		 349 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  65.32 
 
 		 349 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  65.61 
 
 		 349 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  65.03 
 
 		 349 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  63.4 
 
 		 341 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  49.41 
 
 		 343 aa  334  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  47.94 
 
 		 343 aa  330  3e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  47.94 
 
 		 343 aa  325  6e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  50.15 
 
 		 349 aa  324  1e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 346 aa  324  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  47.84 
 
 		 350 aa  315  6e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  44.57 
 
 		 369 aa  289  6e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1152  ABC transporter related protein  44.84 
 
 		 361 aa  287  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523882  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3126  ABC transporter related  44.54 
 
 		 361 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  44.87 
 
 		 369 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  45.16 
 
 		 369 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  43.7 
 
 		 369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  45.09 
 
 		 369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  41.81 
 
 		 361 aa  280  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  42.23 
 
 		 347 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  44.88 
 
 		 369 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  41.52 
 
 		 375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  43.7 
 
 		 353 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2833  ABC transporter related  45.59 
 
 		 354 aa  272  7e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.27535  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  43.99 
 
 		 368 aa  271  9e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  42.35 
 
 		 357 aa  270  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  41.48 
 
 		 369 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  39.77 
 
 		 358 aa  267  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  42.2 
 
 		 371 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  42.57 
 
 		 342 aa  267  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  43.81 
 
 		 366 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  43.62 
 
 		 357 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  40.12 
 
 		 355 aa  261  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  44.48 
 
 		 342 aa  259  6e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  45.18 
 
 		 354 aa  258  9e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  43.95 
 
 		 358 aa  256  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18600  ABC transporter ATP-binding protein  45.16 
 
 		 360 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152976 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  44.85 
 
 		 358 aa  256  4e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1608  ABC transporter ATP-binding protein  45.38 
 
 		 360 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  42.03 
 
 		 346 aa  256  6e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  43.81 
 
 		 368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  40.39 
 
 		 378 aa  254  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  39.77 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  40.06 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1019  ABC transporter related  41.59 
 
 		 354 aa  253  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  40.11 
 
 		 361 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  44.48 
 
 		 355 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  47.31 
 
 		 355 aa  249  4e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  40.17 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  44.48 
 
 		 365 aa  246  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  38.29 
 
 		 377 aa  246  4e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  38.44 
 
 		 348 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  42.06 
 
 		 347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  37.88 
 
 		 353 aa  241  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  43.03 
 
 		 360 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  40.76 
 
 		 355 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  43.03 
 
 		 360 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  38.16 
 
 		 353 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.55 
 
 		 362 aa  241  1e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  42.21 
 
 		 353 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1014  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  52.02 
 
 		 372 aa  240  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.400679  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  39.26 
 
 		 390 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  36.49 
 
 		 339 aa  239  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  40.86 
 
 		 357 aa  239  4e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  38.04 
 
 		 389 aa  239  6.999999999999999e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  40.96 
 
 		 330 aa  239  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  38.57 
 
 		 329 aa  238  8e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.29 
 
 		 329 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.31 
 
 		 353 aa  237  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  39.55 
 
 		 360 aa  237  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0871  ABC transporter related  38.33 
 
 		 405 aa  237  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.010866  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  38.99 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1797  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.57 
 
 		 371 aa  238  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  39.35 
 
 		 336 aa  237  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  38.6 
 
 		 352 aa  237  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.69 
 
 		 356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  39.88 
 
 		 364 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  39.32 
 
 		 378 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  44.19 
 
 		 356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  44.9 
 
 		 352 aa  236  6e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.94 
 
 		 367 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  39.64 
 
 		 336 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  40.71 
 
 		 363 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.95 
 
 		 353 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.65 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  37.94 
 
 		 367 aa  233  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.03 
 
 		 353 aa  233  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3997  ABC transporter related  39.24 
 
 		 329 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0225535  normal  0.167206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1314  ABC transporter related  40.12 
 
 		 329 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.159195  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  47.92 
 
 		 257 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>