More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0795 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  100 
 
 		 352 aa  702    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  86.99 
 
 		 355 aa  606  9.999999999999999e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  56.94 
 
 		 342 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  57.86 
 
 		 342 aa  350  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  55.52 
 
 		 346 aa  341  1e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  48.58 
 
 		 378 aa  315  8e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  51.18 
 
 		 360 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  51.18 
 
 		 360 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  50.74 
 
 		 352 aa  309  4e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  47.41 
 
 		 366 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  45.01 
 
 		 360 aa  300  4e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  48.13 
 
 		 363 aa  298  9e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  46.34 
 
 		 396 aa  291  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  47.01 
 
 		 387 aa  290  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  48.34 
 
 		 377 aa  290  2e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  45.14 
 
 		 390 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  51.79 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  50.29 
 
 		 368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.3 
 
 		 354 aa  279  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  48.32 
 
 		 369 aa  279  6e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  49.29 
 
 		 350 aa  278  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  44.19 
 
 		 369 aa  277  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  44.29 
 
 		 357 aa  277  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  47.4 
 
 		 386 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0734  ABC transporter related  45.3 
 
 		 398 aa  277  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  45.85 
 
 		 359 aa  275  6e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  51.24 
 
 		 352 aa  275  7e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  50.15 
 
 		 360 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  54.2 
 
 		 389 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  45.19 
 
 		 353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  49.64 
 
 		 349 aa  272  7e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  46.13 
 
 		 369 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  49.64 
 
 		 349 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  49.29 
 
 		 349 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  49.29 
 
 		 349 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.38 
 
 		 353 aa  270  4e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  50.16 
 
 		 349 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  47.56 
 
 		 373 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4826  ABC transporter related  47.13 
 
 		 352 aa  268  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160742  normal  0.0580925 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  45.79 
 
 		 356 aa  268  8e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  50.16 
 
 		 349 aa  268  8e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  50.16 
 
 		 349 aa  268  8e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2400  ABC putrescine transporter, ATPase subunit  50.32 
 
 		 334 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0289  ABC transporter ATP-binding protein  45.68 
 
 		 370 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  40.95 
 
 		 343 aa  267  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  44.02 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  49.64 
 
 		 349 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  44.48 
 
 		 375 aa  266  4e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  47.4 
 
 		 354 aa  266  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  49.64 
 
 		 349 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  45.74 
 
 		 368 aa  266  5e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  49.64 
 
 		 349 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  47.62 
 
 		 349 aa  264  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  46.01 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  46.38 
 
 		 348 aa  264  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.09 
 
 		 368 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.45 
 
 		 353 aa  264  2e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  49.29 
 
 		 349 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  46.86 
 
 		 378 aa  263  3e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  49.83 
 
 		 352 aa  263  3e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.45 
 
 		 353 aa  263  4e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  49.01 
 
 		 347 aa  263  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2856  ABC transporter related  45.79 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.469512 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1590  ABC transporter related  44.39 
 
 		 384 aa  263  4e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408037  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  48.21 
 
 		 349 aa  262  6e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  46.39 
 
 		 347 aa  262  6e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  46.39 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  40.36 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  46.08 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  43.25 
 
 		 346 aa  261  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  44.64 
 
 		 348 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.78 
 
 		 356 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  46.67 
 
 		 348 aa  260  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2519  ABC transporter related  42.82 
 
 		 344 aa  259  4e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00672274  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  45.85 
 
 		 358 aa  259  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.91 
 
 		 362 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  51.85 
 
 		 373 aa  259  6e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  45.85 
 
 		 358 aa  259  6e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.96 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  40.29 
 
 		 342 aa  258  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  52.1 
 
 		 363 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  54.95 
 
 		 374 aa  258  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5748  ABC transporter related  45.09 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1062  ABC transporter related protein  48.57 
 
 		 373 aa  258  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  43.87 
 
 		 356 aa  258  2e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  45.59 
 
 		 369 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  46.9 
 
 		 349 aa  257  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  46.9 
 
 		 349 aa  256  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1666  ABC transporter related  45.53 
 
 		 374 aa  256  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.022862  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  46.08 
 
 		 369 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2195  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  48.9 
 
 		 339 aa  256  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643313  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6577  ABC transporter related  46.81 
 
 		 359 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446279 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04250  putative ATP-binding component of ABC transporter  45.71 
 
 		 349 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  46.04 
 
 		 357 aa  255  7e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  49.67 
 
 		 399 aa  255  7e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.08 
 
 		 384 aa  255  9e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  44.74 
 
 		 353 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  44.15 
 
 		 361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  45.98 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1837  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  47.99 
 
 		 352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>