More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2888 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  100 
 
 
360 aa  738    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  44.8 
 
 
355 aa  295  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  46.06 
 
 
342 aa  287  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  43.85 
 
 
378 aa  287  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  46.44 
 
 
369 aa  285  9e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  50.94 
 
 
366 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  51.33 
 
 
360 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  51.33 
 
 
360 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  41.69 
 
 
352 aa  279  5e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  42.94 
 
 
363 aa  278  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  46.75 
 
 
357 aa  278  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  49.65 
 
 
390 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  43.68 
 
 
387 aa  276  4e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  47.95 
 
 
352 aa  275  6e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  46.11 
 
 
359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  43.93 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  50.75 
 
 
368 aa  273  5.000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  43.43 
 
 
377 aa  271  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  43.18 
 
 
358 aa  271  2e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  42.05 
 
 
365 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  46.18 
 
 
342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  48.98 
 
 
346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  41.76 
 
 
410 aa  269  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  41.23 
 
 
361 aa  269  7e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  43.06 
 
 
356 aa  268  8.999999999999999e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  42.94 
 
 
355 aa  268  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  41.16 
 
 
349 aa  267  2e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.34 
 
 
362 aa  267  2e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.73 
 
 
373 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  45.96 
 
 
342 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0011  ABC transporter related  41.92 
 
 
359 aa  265  1e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  41.19 
 
 
386 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  43.04 
 
 
355 aa  265  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  40.72 
 
 
358 aa  263  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  40.72 
 
 
358 aa  263  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  40.69 
 
 
356 aa  262  6e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  45.05 
 
 
342 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  41.23 
 
 
343 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  42.82 
 
 
356 aa  261  2e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41 
 
 
363 aa  260  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  40.92 
 
 
343 aa  259  4e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08431  ABC transporter ATP-binding protein  46.98 
 
 
352 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  44.77 
 
 
364 aa  259  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  46.28 
 
 
375 aa  258  8e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  43.64 
 
 
389 aa  258  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3852  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.4 
 
 
358 aa  258  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  41.95 
 
 
358 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.61 
 
 
346 aa  257  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  42.18 
 
 
371 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  42.94 
 
 
361 aa  257  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.73 
 
 
368 aa  257  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  41.95 
 
 
354 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1222  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.66 
 
 
363 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0211  ATPase  46.26 
 
 
352 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 
354 aa  256  5e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1849  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.69 
 
 
381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.15 
 
 
356 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  42.69 
 
 
350 aa  253  3e-66  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.12 
 
 
382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.3 
 
 
373 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  48.29 
 
 
369 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  38.69 
 
 
372 aa  253  5.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.81 
 
 
372 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  45.22 
 
 
355 aa  252  7e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  44.55 
 
 
367 aa  252  7e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  41.16 
 
 
353 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1841  ABC transporter related  38.98 
 
 
361 aa  251  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  43.42 
 
 
373 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  42.64 
 
 
368 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  41.35 
 
 
349 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  42.38 
 
 
369 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.59 
 
 
352 aa  250  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  43.08 
 
 
347 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.5 
 
 
370 aa  249  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.63 
 
 
357 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3984  ABC transporter related  44.48 
 
 
354 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  43.79 
 
 
356 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  41.03 
 
 
349 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  42.38 
 
 
357 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  41.55 
 
 
348 aa  249  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  41.03 
 
 
349 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  40.26 
 
 
352 aa  249  6e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  42.86 
 
 
373 aa  248  8e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1284  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.48 
 
 
383 aa  248  8e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0341676  normal  0.481379 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  43.09 
 
 
371 aa  248  9e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  45.73 
 
 
356 aa  248  9e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1508  ABC transporter related  38.11 
 
 
376 aa  248  9e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  40.71 
 
 
349 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  40.88 
 
 
349 aa  248  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.44 
 
 
349 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  42.02 
 
 
352 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  44.19 
 
 
386 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  45.27 
 
 
344 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  42.12 
 
 
353 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2303  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.2 
 
 
381 aa  247  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3315  ABC transporter related  45.93 
 
 
342 aa  248  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0775191  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  41.05 
 
 
349 aa  247  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  48.29 
 
 
369 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  41.12 
 
 
342 aa  246  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  42.11 
 
 
353 aa  246  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>