More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0863 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  100 
 
 
342 aa  688    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  69.01 
 
 
342 aa  481  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  68.42 
 
 
342 aa  479  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  67.44 
 
 
349 aa  463  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  66.96 
 
 
343 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  66.38 
 
 
349 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  66.09 
 
 
349 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  66.67 
 
 
349 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  66.67 
 
 
349 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  65.8 
 
 
349 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  65.22 
 
 
349 aa  448  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  66.09 
 
 
349 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  65.22 
 
 
349 aa  448  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  64.62 
 
 
342 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  62.57 
 
 
341 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  49.85 
 
 
343 aa  339  5e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  51.1 
 
 
343 aa  330  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 
346 aa  330  2e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  49 
 
 
349 aa  327  1.0000000000000001e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  47.65 
 
 
343 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  46.69 
 
 
350 aa  312  5.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  42.4 
 
 
361 aa  287  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3126  ABC transporter related  42.69 
 
 
361 aa  287  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  44.15 
 
 
375 aa  286  4e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1152  ABC transporter related protein  42.69 
 
 
361 aa  286  4e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523882  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  44.44 
 
 
369 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  44.15 
 
 
369 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  44.18 
 
 
357 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  44.74 
 
 
369 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  43.86 
 
 
369 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  41.03 
 
 
369 aa  276  4e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  43.02 
 
 
353 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  42.82 
 
 
369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  42.23 
 
 
369 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  39.2 
 
 
357 aa  270  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2833  ABC transporter related  43.15 
 
 
354 aa  267  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.27535  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  40.7 
 
 
355 aa  267  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  45.48 
 
 
342 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1019  ABC transporter related  42.98 
 
 
354 aa  266  5e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  40.97 
 
 
358 aa  265  5.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  41.94 
 
 
368 aa  265  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  40.47 
 
 
347 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  42.51 
 
 
378 aa  263  3e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  44.21 
 
 
366 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  43.28 
 
 
342 aa  263  4e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
371 aa  259  4e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  41.45 
 
 
353 aa  258  8e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  38.26 
 
 
348 aa  258  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  41.59 
 
 
354 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  40.46 
 
 
359 aa  256  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  42.9 
 
 
355 aa  256  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  38.92 
 
 
355 aa  255  6e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1014  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  43.85 
 
 
372 aa  255  7e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.400679  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  40.8 
 
 
389 aa  255  7e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2095  ABC transporter related  52.08 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.876637  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  40.71 
 
 
387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  42.18 
 
 
346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1091  ABC transporter related  53.39 
 
 
257 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  40 
 
 
386 aa  253  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  42.05 
 
 
390 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1091  ABC transporter related  52.49 
 
 
257 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4316  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  52.94 
 
 
257 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.480122  normal  0.408947 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  39.26 
 
 
361 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0728  ABC transporter related  52.94 
 
 
257 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1208  ABC transporter related  52.94 
 
 
257 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324459  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  38.97 
 
 
377 aa  250  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  39.53 
 
 
410 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  43.85 
 
 
356 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18600  ABC transporter ATP-binding protein  42.52 
 
 
360 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0152976 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1181  ABC transporter related  52.04 
 
 
257 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0132418  normal  0.222462 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  39.54 
 
 
358 aa  246  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  39.54 
 
 
358 aa  246  4e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  42.64 
 
 
363 aa  246  4.9999999999999997e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  40.58 
 
 
355 aa  246  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1608  ABC transporter ATP-binding protein  42.52 
 
 
360 aa  245  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.77 
 
 
355 aa  245  9e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  41.28 
 
 
356 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  39.77 
 
 
365 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  43.91 
 
 
360 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0811  ATPase  38.94 
 
 
352 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0326563  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  41.02 
 
 
336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  43.91 
 
 
360 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3041  ABC transporter related  41.82 
 
 
372 aa  242  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383047  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  42.86 
 
 
356 aa  242  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  43.09 
 
 
368 aa  242  7e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6370  ABC transporter related  43.49 
 
 
363 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  40.42 
 
 
336 aa  242  7.999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  42.94 
 
 
358 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  39.18 
 
 
361 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.12 
 
 
352 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  39.94 
 
 
353 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  40.17 
 
 
359 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  43.19 
 
 
357 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  40.46 
 
 
359 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  39.43 
 
 
356 aa  240  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  38.26 
 
 
356 aa  240  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  40.74 
 
 
372 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  43.6 
 
 
344 aa  239  5e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  41.53 
 
 
347 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  40.85 
 
 
368 aa  238  8e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>