More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8128 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 333 aa  646    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  55.49 
 
 		 350 aa  318  9e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  51.05 
 
 		 342 aa  295  6e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  48.18 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3648  ABC transporter related protein  56.89 
 
 		 357 aa  287  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.473782  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1590  ABC transporter related  47.23 
 
 		 384 aa  287  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408037  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4826  ABC transporter related  50 
 
 		 352 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160742  normal  0.0580925 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  49.71 
 
 		 346 aa  281  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  49.85 
 
 		 355 aa  280  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5338  ABC transporter related  51.3 
 
 		 351 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.589237 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06260  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  49.72 
 
 		 387 aa  272  7e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.623028  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1837  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  51.45 
 
 		 352 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332439 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  46.65 
 
 		 345 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2856  ABC transporter related  50.65 
 
 		 359 aa  264  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.469512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7419  ABC transporter related  54.4 
 
 		 345 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5748  ABC transporter related  49.51 
 
 		 364 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3091  ABC transporter-related protein  50.9 
 
 		 364 aa  262  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539266  normal  0.757537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  51.79 
 
 		 352 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  46.65 
 
 		 345 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  50.49 
 
 		 349 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  48.22 
 
 		 396 aa  260  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  50.49 
 
 		 349 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  48.64 
 
 		 352 aa  260  3e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1666  ABC transporter related  49.11 
 
 		 374 aa  260  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.022862  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0734  ABC transporter related  47.42 
 
 		 398 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3948  ABC transporter, ATPase subunit  48.26 
 
 		 349 aa  259  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202107  normal  0.0920868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  50.16 
 
 		 349 aa  258  7e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2519  ABC transporter related  46.8 
 
 		 344 aa  256  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00672274  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  42.66 
 
 		 378 aa  255  9e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  48.96 
 
 		 363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1357  ABC transporter related protein  40.59 
 
 		 346 aa  253  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.157538  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2839  ABC transporter-like  43.02 
 
 		 350 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6134  ABC transporter  44.8 
 
 		 348 aa  252  7e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.210402  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  41.62 
 
 		 355 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3361  ABC transporter related  50.16 
 
 		 364 aa  246  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.322105  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  43.79 
 
 		 341 aa  246  4e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  40.95 
 
 		 366 aa  245  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.46 
 
 		 372 aa  245  6e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47 
 
 		 353 aa  244  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  43.57 
 
 		 377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  42.77 
 
 		 373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2921  ABC transporter related  40.28 
 
 		 356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.912775  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2147  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.77 
 
 		 371 aa  243  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  44.75 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  38.34 
 
 		 367 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5731  ABC transporter-related protein  46.01 
 
 		 343 aa  243  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  45.54 
 
 		 356 aa  242  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.06 
 
 		 359 aa  242  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  40.66 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2002  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.84 
 
 		 341 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  45.75 
 
 		 373 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  45.08 
 
 		 353 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.57 
 
 		 359 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  48.91 
 
 		 366 aa  240  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.55 
 
 		 352 aa  240  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  44.19 
 
 		 369 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  41.11 
 
 		 342 aa  240  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1862  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.29 
 
 		 371 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0542  ABC transporter related  41.91 
 
 		 346 aa  239  4e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.999499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8492  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.01 
 
 		 379 aa  239  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19245  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  43.85 
 
 		 371 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.93 
 
 		 353 aa  239  5.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  55.04 
 
 		 389 aa  239  5.999999999999999e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.21 
 
 		 356 aa  238  9e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1639  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.38 
 
 		 372 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2428  ABC transporter related  48 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0568  ABC transporter related  39.88 
 
 		 363 aa  238  1e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0218426  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1453  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.43 
 
 		 368 aa  237  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  42.01 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2020  ABC transporter related  48.12 
 
 		 353 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194585  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  47.35 
 
 		 352 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1407  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.73 
 
 		 370 aa  237  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.890613  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 353 aa  238  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  44.13 
 
 		 353 aa  237  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5049  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  41.72 
 
 		 386 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  41.72 
 
 		 349 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  42.66 
 
 		 387 aa  236  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.74 
 
 		 372 aa  236  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01124  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.96 
 
 		 378 aa  236  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1304  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.96 
 
 		 378 aa  236  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  46.45 
 
 		 352 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01132  hypothetical protein  41.96 
 
 		 378 aa  236  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.815293  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  41.72 
 
 		 349 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1246  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.96 
 
 		 378 aa  236  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457204  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2477  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.96 
 
 		 378 aa  236  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0899476  normal  0.634641 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.96 
 
 		 378 aa  236  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7192  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.3 
 
 		 361 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.27359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4695  ABC transporter related  46.05 
 
 		 350 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  41.25 
 
 		 349 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.23 
 
 		 373 aa  236  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.71 
 
 		 370 aa  235  6e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  46.52 
 
 		 368 aa  236  6e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  42.77 
 
 		 363 aa  235  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.16 
 
 		 355 aa  235  8e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2521  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.64 
 
 		 378 aa  235  9e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0234665  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  40.18 
 
 		 336 aa  235  9e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1567  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.64 
 
 		 378 aa  235  9e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000366035 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2000  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  41.64 
 
 		 378 aa  235  9e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.767612 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.81 
 
 		 370 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>