More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3781 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  100 
 
 		 345 aa  682    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  94.77 
 
 		 345 aa  648    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6134  ABC transporter  64.06 
 
 		 348 aa  431  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.210402  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2839  ABC transporter-like  56.2 
 
 		 350 aa  362  8e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2519  ABC transporter related  55.33 
 
 		 344 aa  351  1e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00672274  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2536  ABC transporter-related protein  55.52 
 
 		 345 aa  349  3e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1348  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  54.6 
 
 		 349 aa  349  5e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2712  iron(III)-transport ATP-binding protein  54.31 
 
 		 349 aa  348  6e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.103863  normal  0.0760502 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1461  ABC transporter related  54.31 
 
 		 349 aa  348  6e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1357  ABC transporter related protein  51.01 
 
 		 346 aa  334  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.157538  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2921  ABC transporter related  50.85 
 
 		 356 aa  333  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.912775  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0734  ABC transporter related  54.28 
 
 		 398 aa  333  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2428  ABC transporter related  53.91 
 
 		 344 aa  332  6e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  55.94 
 
 		 396 aa  325  5e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2856  ABC transporter related  51.9 
 
 		 359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.469512 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5748  ABC transporter related  50.73 
 
 		 364 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  49 
 
 		 349 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  49 
 
 		 349 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  49 
 
 		 349 aa  302  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1590  ABC transporter related  44.5 
 
 		 384 aa  283  5.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408037  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  48.25 
 
 		 346 aa  269  7e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  46.65 
 
 		 333 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  47.74 
 
 		 342 aa  265  5.999999999999999e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  51.43 
 
 		 350 aa  265  8.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4826  ABC transporter related  44.99 
 
 		 352 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160742  normal  0.0580925 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  45.21 
 
 		 342 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3648  ABC transporter related protein  47.85 
 
 		 357 aa  260  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.473782  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5338  ABC transporter related  46.7 
 
 		 351 aa  260  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.589237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7419  ABC transporter related  49.71 
 
 		 345 aa  255  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3948  ABC transporter, ATPase subunit  50.32 
 
 		 349 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202107  normal  0.0920868 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1837  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  45.27 
 
 		 352 aa  250  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332439 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  43.31 
 
 		 371 aa  245  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06260  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  44.31 
 
 		 387 aa  243  5e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.623028  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  46.13 
 
 		 389 aa  241  1e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  42.36 
 
 		 342 aa  241  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  43.53 
 
 		 387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.91 
 
 		 349 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  43.35 
 
 		 352 aa  239  5.999999999999999e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  41.82 
 
 		 342 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  44.22 
 
 		 366 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  44.57 
 
 		 363 aa  238  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.42 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  45.94 
 
 		 355 aa  237  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2020  ABC transporter related  45.38 
 
 		 353 aa  235  9e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194585  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1017  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.89 
 
 		 388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  44.72 
 
 		 360 aa  232  6e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6092  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (polyamine)  42.24 
 
 		 358 aa  232  8.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196126  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3361  ABC transporter related  48.56 
 
 		 364 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.322105  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  41.46 
 
 		 377 aa  231  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.9 
 
 		 354 aa  230  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  39.81 
 
 		 342 aa  231  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.48 
 
 		 355 aa  230  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.95 
 
 		 356 aa  230  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.2 
 
 		 387 aa  230  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.32 
 
 		 337 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1034  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  41.29 
 
 		 359 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.330861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.54 
 
 		 343 aa  229  5e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6541  ABC transporter related  40.77 
 
 		 359 aa  229  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131089 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  39.88 
 
 		 343 aa  229  7e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.27 
 
 		 381 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  44.37 
 
 		 356 aa  228  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0015  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  42.17 
 
 		 365 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0656  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  44.07 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  41.67 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2918  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 336 aa  228  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  46.98 
 
 		 352 aa  227  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1132  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.89 
 
 		 378 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  42.06 
 
 		 349 aa  226  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0701  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.73 
 
 		 367 aa  226  4e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2539  ABC transporter, ATPase subunit  38.35 
 
 		 378 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.256647  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1597  spermidine/putrescine import ATP-binding protein  45.45 
 
 		 355 aa  226  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0206589  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6246  ABC transporter related  40.44 
 
 		 359 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836052  normal  0.532087 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  45.32 
 
 		 353 aa  226  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1644  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.99 
 
 		 357 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  39.1 
 
 		 349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5592  ABC transporter related  40.22 
 
 		 358 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  40 
 
 		 349 aa  225  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  39.68 
 
 		 343 aa  225  7e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3091  ABC transporter-related protein  47.62 
 
 		 364 aa  226  7e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539266  normal  0.757537 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0947  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.34 
 
 		 378 aa  225  8e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.92 
 
 		 377 aa  225  9e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  43.73 
 
 		 362 aa  225  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  40 
 
 		 349 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  40 
 
 		 349 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1811  ABC transporter, ATP-binding protein  38.54 
 
 		 330 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3737  ABC transporter related  44.37 
 
 		 349 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1198  ABC transporter related  38.35 
 
 		 378 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0576508 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.2 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  38.41 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  39.68 
 
 		 349 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1865  ABC transporter, ATP-binding protein  38.83 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2170  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.48 
 
 		 365 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.051022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1752  ABC transporter, ATP-binding protein  37.86 
 
 		 330 aa  223  4e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  43.75 
 
 		 347 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1208  ABC transporter related  40.85 
 
 		 364 aa  222  6e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  41.08 
 
 		 361 aa  222  6e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  39.01 
 
 		 373 aa  222  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3984  ABC transporter related  42.76 
 
 		 354 aa  222  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  42.75 
 
 		 373 aa  222  8e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  38.44 
 
 		 353 aa  222  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>