More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2586 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 346 aa  716    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  62.28 
 
 		 343 aa  450  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  62.87 
 
 		 343 aa  450  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  61.11 
 
 		 343 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  47.84 
 
 		 349 aa  342  8e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  47.43 
 
 		 349 aa  339  5e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  47.71 
 
 		 349 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  50.71 
 
 		 349 aa  337  9.999999999999999e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  47.95 
 
 		 342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  47.43 
 
 		 349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  48.13 
 
 		 349 aa  335  5e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  47.14 
 
 		 349 aa  335  7e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  47.55 
 
 		 349 aa  333  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  47.84 
 
 		 349 aa  333  3e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  47.55 
 
 		 349 aa  332  4e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  46.92 
 
 		 342 aa  332  6e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  47.83 
 
 		 342 aa  330  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0638  ABC transporter related  47.37 
 
 		 343 aa  324  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  47.97 
 
 		 342 aa  322  8e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0668  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  47.21 
 
 		 341 aa  315  7e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  47.21 
 
 		 369 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  46.63 
 
 		 369 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  48.33 
 
 		 350 aa  301  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  46.04 
 
 		 369 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  44.28 
 
 		 358 aa  294  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  46.27 
 
 		 369 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  44.22 
 
 		 353 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  45.35 
 
 		 366 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  47.15 
 
 		 369 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  42.2 
 
 		 361 aa  290  3e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  44.78 
 
 		 357 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  43.79 
 
 		 357 aa  288  9e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1152  ABC transporter related protein  41.72 
 
 		 361 aa  286  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.523882  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  46.96 
 
 		 368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3126  ABC transporter related  41.42 
 
 		 361 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  44.64 
 
 		 369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  44.02 
 
 		 371 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  42.98 
 
 		 369 aa  281  9e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  41.14 
 
 		 347 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  41.67 
 
 		 377 aa  276  4e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  44.3 
 
 		 389 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  40.95 
 
 		 355 aa  273  3e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  42.95 
 
 		 375 aa  272  6e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  41.54 
 
 		 387 aa  271  9e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  44.13 
 
 		 386 aa  271  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  45.35 
 
 		 360 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  45.35 
 
 		 360 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2833  ABC transporter related  44.12 
 
 		 354 aa  268  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.27535  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0895  ABC-type transport system, ATPase component  42.86 
 
 		 355 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0323383  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  42.72 
 
 		 355 aa  265  8e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  40.85 
 
 		 359 aa  265  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  42.46 
 
 		 378 aa  263  4e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1019  ABC transporter related  41.35 
 
 		 354 aa  262  4.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  41.35 
 
 		 355 aa  263  4.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  42.24 
 
 		 368 aa  262  6.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  43.63 
 
 		 354 aa  262  8e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  42.68 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0871  ABC transporter related  40.05 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.010866  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  39.77 
 
 		 348 aa  258  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3566  ABC transporter related  42.68 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0434077  normal  0.522796 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  41.61 
 
 		 360 aa  257  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.72 
 
 		 352 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000146357  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3737  ABC transporter related  44.75 
 
 		 349 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  40.6 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0810  ABC transporter, ATP-binding protein  44.66 
 
 		 370 aa  250  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  43.17 
 
 		 363 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  41.07 
 
 		 353 aa  249  5e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  43.04 
 
 		 356 aa  248  8e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  42.04 
 
 		 410 aa  248  9e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1595  ABC transporter related  41.08 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.830664  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  42.95 
 
 		 346 aa  248  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  42.31 
 
 		 379 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  40.46 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1508  ABC transporter related  47.62 
 
 		 376 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  37.13 
 
 		 342 aa  246  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3984  ABC transporter related  37.6 
 
 		 354 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.72 
 
 		 356 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  41.72 
 
 		 356 aa  245  8e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18600  ABC transporter ATP-binding protein  42.82 
 
 		 360 aa  245  9e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152976 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08641  ABC transporter ATP-binding protein  42.77 
 
 		 352 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  38.87 
 
 		 390 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  36.93 
 
 		 367 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00164  putative ABC-type transport system, ATPase component  41.82 
 
 		 344 aa  244  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.34 
 
 		 370 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  38.86 
 
 		 378 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  40.66 
 
 		 365 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  41.43 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1608  ABC transporter ATP-binding protein  44.41 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2858  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.95 
 
 		 259 aa  243  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0664638  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.14 
 
 		 359 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1437  ABC transporter, ATP-binding protein  40.9 
 
 		 333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1646  putrescine transporter ATP-binding subunit  41.35 
 
 		 377 aa  243  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.103128 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1788  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.54 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  40.55 
 
 		 352 aa  243  5e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  45.77 
 
 		 352 aa  243  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1412  ABC transporter, ATP-binding protein  41.25 
 
 		 333 aa  242  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1213  ABC transporter, ATP-binding protein  41.25 
 
 		 366 aa  242  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1012  putrescine transporter ATP-binding subunit  40 
 
 		 377 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.35 
 
 		 353 aa  242  6e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  38.24 
 
 		 358 aa  242  6e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>