More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3222 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  100 
 
 
387 aa  784    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1062  ABC transporter related protein  74.47 
 
 
373 aa  520  1e-146  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  59.3 
 
 
377 aa  444  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  64 
 
 
378 aa  437  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  58.89 
 
 
389 aa  429  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1463  ABC transporter related protein  45.82 
 
 
1057 aa  320  3e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  44.32 
 
 
357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  49.11 
 
 
342 aa  307  3e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  46.44 
 
 
347 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  45.18 
 
 
369 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3902  ABC transporter:TOBE  48.39 
 
 
357 aa  299  6e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  43.71 
 
 
358 aa  296  5e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  46.83 
 
 
355 aa  295  7e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  45.87 
 
 
368 aa  293  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  46.22 
 
 
363 aa  291  9e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  43.5 
 
 
359 aa  291  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  42.02 
 
 
378 aa  291  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  43.22 
 
 
369 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  43.38 
 
 
369 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  46.18 
 
 
353 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0988  transport system ATPase  42.54 
 
 
355 aa  288  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  45.29 
 
 
369 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  51.36 
 
 
374 aa  288  2e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  42.94 
 
 
369 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  47.95 
 
 
353 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  43.47 
 
 
361 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1788  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.26 
 
 
370 aa  285  8e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  42.9 
 
 
355 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  46.79 
 
 
342 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  44.29 
 
 
369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0297  ABC transporter related protein  46.59 
 
 
371 aa  282  6.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0131013  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  47.51 
 
 
368 aa  282  8.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  47.37 
 
 
357 aa  278  9e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  46.3 
 
 
342 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0809  ABC transporter related  44.51 
 
 
375 aa  278  1e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43238  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  43.35 
 
 
366 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  43.94 
 
 
369 aa  276  5e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  43.68 
 
 
360 aa  276  5e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  45.16 
 
 
361 aa  275  7e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  45.48 
 
 
352 aa  275  9e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  45.79 
 
 
349 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  41.55 
 
 
349 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00164  putative ABC-type transport system, ATPase component  44.6 
 
 
344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  45.71 
 
 
363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  41.67 
 
 
349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  49.52 
 
 
352 aa  271  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  43.38 
 
 
354 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.54 
 
 
346 aa  271  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  42.12 
 
 
390 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  44.75 
 
 
363 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  41.38 
 
 
349 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  46.97 
 
 
359 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  46.44 
 
 
353 aa  271  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  47.45 
 
 
353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1836  ABC transporter, atp_binding subunit  45.23 
 
 
364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382756 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  40.69 
 
 
343 aa  270  4e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  41.38 
 
 
349 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3947  ABC transporter related  43.86 
 
 
366 aa  270  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0174728  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.77 
 
 
356 aa  269  5.9999999999999995e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0850  ABC transporter related  42.3 
 
 
365 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408681  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  44.08 
 
 
346 aa  268  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  45.48 
 
 
341 aa  268  1e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  46.47 
 
 
360 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  43.21 
 
 
348 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3396  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.41 
 
 
382 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1227  ABC transporter related  41.1 
 
 
379 aa  267  2e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000640126 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  40.52 
 
 
349 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0871  ABC transporter related  42.13 
 
 
405 aa  267  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.010866  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  44.72 
 
 
353 aa  266  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.61 
 
 
384 aa  266  4e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6630  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.05 
 
 
363 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00510446  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17640  polyamine transport protein PotA  43.75 
 
 
363 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0758  ABC transporter related  43.7 
 
 
365 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  52.07 
 
 
352 aa  265  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  42.3 
 
 
360 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  42.3 
 
 
360 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  46.93 
 
 
356 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  49.65 
 
 
362 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4944  ABC transporter related  42.82 
 
 
364 aa  265  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0889  ABC transporter related  43.54 
 
 
368 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  45.32 
 
 
359 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.51 
 
 
352 aa  264  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  41.41 
 
 
348 aa  264  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  42.29 
 
 
386 aa  264  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  40.62 
 
 
342 aa  264  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.75 
 
 
370 aa  263  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  42.42 
 
 
369 aa  263  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 
349 aa  263  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0308  ABC transporter related  44.12 
 
 
356 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1148  ABC transporter related  41.53 
 
 
410 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  40.64 
 
 
352 aa  263  4e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0335  ABC transporter related  40.31 
 
 
329 aa  263  6e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0307284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  42.31 
 
 
342 aa  262  6e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1545  ABC iron transporter, ATPase subunit  45.94 
 
 
415 aa  262  8e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.316971 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  42.9 
 
 
343 aa  261  1e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1726  ABC transporter related  47.13 
 
 
372 aa  261  1e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.350865 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  40.52 
 
 
343 aa  261  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2889  ABC transporter related  42.66 
 
 
358 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.788939  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5058  ABC transporter related  43.84 
 
 
360 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309189  normal  0.0933032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  43.45 
 
 
359 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>