More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1348 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2712  iron(III)-transport ATP-binding protein  99.71 
 
 		 349 aa  708    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.103863  normal  0.0760502 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1348  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 349 aa  709    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1461  ABC transporter related  99.43 
 
 		 349 aa  706    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2536  ABC transporter-related protein  73.64 
 
 		 345 aa  511  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2519  ABC transporter related  68.7 
 
 		 344 aa  478  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00672274  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2428  ABC transporter related  63.98 
 
 		 344 aa  448  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2921  ABC transporter related  58.03 
 
 		 356 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.912775  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1357  ABC transporter related protein  57.64 
 
 		 346 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.157538  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2839  ABC transporter-like  54.11 
 
 		 350 aa  361  8e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  55.46 
 
 		 345 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  54.6 
 
 		 345 aa  349  5e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6134  ABC transporter  51.71 
 
 		 348 aa  330  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.210402  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  47.03 
 
 		 396 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0734  ABC transporter related  46.83 
 
 		 398 aa  302  7.000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  47.99 
 
 		 349 aa  302  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  47.99 
 
 		 349 aa  301  9e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  47.99 
 
 		 349 aa  301  9e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2856  ABC transporter related  47.99 
 
 		 359 aa  301  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.469512 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5748  ABC transporter related  47.41 
 
 		 364 aa  301  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3648  ABC transporter related protein  46.97 
 
 		 357 aa  276  4e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.473782  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1590  ABC transporter related  51.25 
 
 		 384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408037  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5338  ABC transporter related  43.87 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.589237 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4826  ABC transporter related  44.89 
 
 		 352 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160742  normal  0.0580925 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  44.61 
 
 		 342 aa  257  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3948  ABC transporter, ATPase subunit  45.94 
 
 		 349 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.202107  normal  0.0920868 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  43.1 
 
 		 350 aa  252  6e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  41.09 
 
 		 355 aa  249  6e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1837  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  45.2 
 
 		 352 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.332439 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  41.64 
 
 		 346 aa  239  8e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7419  ABC transporter related  47.39 
 
 		 345 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  45.2 
 
 		 342 aa  231  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1666  ABC transporter related  42.86 
 
 		 374 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.022862  normal  0.148234 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  42.16 
 
 		 360 aa  228  8e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  41.14 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  42.16 
 
 		 342 aa  226  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06260  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  43.79 
 
 		 387 aa  226  4e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.623028  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  42.24 
 
 		 375 aa  226  6e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  39.94 
 
 		 352 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  40.68 
 
 		 352 aa  223  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  45.03 
 
 		 363 aa  222  9e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3361  ABC transporter related  42.59 
 
 		 364 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.322105  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4448  ABC transporter related  41.73 
 
 		 373 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1341  ABC transporter related  40.14 
 
 		 362 aa  218  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  39.27 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2002  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.99 
 
 		 341 aa  216  5e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  40 
 
 		 387 aa  215  8e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1984  ABC transporter related  36.53 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775103  normal  0.0813091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 		 370 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  38.81 
 
 		 359 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  37.13 
 
 		 326 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  43.38 
 
 		 373 aa  212  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.75 
 
 		 367 aa  212  7.999999999999999e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  36.26 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3825  ABC transporter related  37.77 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3091  ABC transporter-related protein  46.49 
 
 		 364 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539266  normal  0.757537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  36.84 
 
 		 329 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1234  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  39.33 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0541634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  39.68 
 
 		 344 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6716  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  38.33 
 
 		 356 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3201  ABC transporter component  42.3 
 
 		 359 aa  210  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0081  ABC transporter  36.84 
 
 		 326 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.26 
 
 		 368 aa  209  4e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2020  ABC transporter related  40.97 
 
 		 353 aa  209  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00194585  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  37.5 
 
 		 377 aa  209  7e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  38.69 
 
 		 353 aa  208  9e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  39.13 
 
 		 357 aa  208  9e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  43.1 
 
 		 362 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0197  sulphate transport system permease protein 1  37.1 
 
 		 329 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.96 
 
 		 329 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4770  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.28 
 
 		 395 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0294  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.96 
 
 		 329 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.491051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.72 
 
 		 353 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  39.79 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  41.72 
 
 		 356 aa  206  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  36.89 
 
 		 336 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5075  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.96 
 
 		 329 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207952  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5168  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.96 
 
 		 329 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  37.5 
 
 		 369 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2167  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 		 359 aa  206  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0846  ABC transporter related  38.33 
 
 		 342 aa  206  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  41.81 
 
 		 353 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  39.3 
 
 		 342 aa  206  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  40.14 
 
 		 349 aa  206  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31750  sulfate ABC transporter  36.44 
 
 		 323 aa  206  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  39.23 
 
 		 352 aa  206  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.21 
 
 		 362 aa  205  7e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  44.06 
 
 		 343 aa  205  8e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2136  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.6 
 
 		 372 aa  205  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1370  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.44 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.3 
 
 		 349 aa  205  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0349  ABC transporter, ATPase subunit  38.05 
 
 		 352 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  40.56 
 
 		 349 aa  205  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6271  ABC transporter related  37.93 
 
 		 356 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0482396  normal  0.559983 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3121  ABC transporter related  44.01 
 
 		 353 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3171  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.64 
 
 		 333 aa  205  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.659319  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.07 
 
 		 345 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3091  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.28 
 
 		 330 aa  205  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  39.3 
 
 		 349 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.78 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.15 
 
 		 354 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>