More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3121 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3121  ABC transporter related  100 
 
 		 353 aa  707    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3457  ABC transporter-related protein  70.7 
 
 		 361 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861719 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1262  ABC transporter related  68 
 
 		 353 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0942202  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  52.52 
 
 		 352 aa  330  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  51.69 
 
 		 353 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1270  ABC transporter related  49.44 
 
 		 361 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5851  ABC transporter ATP-binding protein  52.17 
 
 		 351 aa  306  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228594  normal  0.59498 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  51.16 
 
 		 353 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2651  ABC transporter related  51.01 
 
 		 348 aa  305  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220335  normal  0.549326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1465  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  51.61 
 
 		 352 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476678  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4340  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  50.58 
 
 		 343 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3315  ABC transporter related  50.44 
 
 		 342 aa  300  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0775191  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0750  ABC transporter related  50.58 
 
 		 343 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1231  ABC transporter related  50.58 
 
 		 343 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328222  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1205  ABC transporter related  50 
 
 		 343 aa  298  9e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2077  ABC transporter related  50.58 
 
 		 343 aa  296  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1113  ABC transporter related  49.71 
 
 		 343 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1114  ABC transporter related  49.71 
 
 		 343 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0746662  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1504  ABC transporter related  52.11 
 
 		 350 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.310407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4692  ABC transporter  47.16 
 
 		 343 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0489  ABC transporter, ATP-binding protein  47.21 
 
 		 347 aa  288  8e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2834  ABC transporter, ATP-binding protein  51.38 
 
 		 342 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1794  ABC transporter ATP-binding protein  48.27 
 
 		 359 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.507378  normal  0.0198791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1456  ABC transporter related  49.85 
 
 		 353 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0461545 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2149  ABC transporter related  47.98 
 
 		 353 aa  282  8.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1415  ABC transporter related  49.07 
 
 		 353 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2375  ABC transporter related protein  45.96 
 
 		 347 aa  273  3e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3076  ABC transporter, ATP-binding protein  52.6 
 
 		 342 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1540  ABC transporter, ATP-binding protein  52.6 
 
 		 342 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1210  ABC transporter, ATP-binding protein  52.6 
 
 		 382 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.451725  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1406  ABC transporter, ATP-binding protein  52.6 
 
 		 342 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1413  ABC transporter, ATP-binding protein  52.6 
 
 		 342 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11782  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  46.77 
 
 		 341 aa  266  5e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  49.51 
 
 		 342 aa  265  7e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0657  ABC transporter, ATP-binding protein  52.29 
 
 		 342 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0496  ABC transporter, ATP-binding protein  52.29 
 
 		 342 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.607751  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  43.6 
 
 		 356 aa  263  3e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  45.54 
 
 		 350 aa  263  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4913  ABC transporter related  46.36 
 
 		 353 aa  263  4.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.801745 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  48.16 
 
 		 365 aa  262  8e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1474  ABC transporter related protein  46.43 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00799241  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0077  ABC transporter related  47.2 
 
 		 347 aa  260  2e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0473465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6542  ABC transporter related  45.51 
 
 		 362 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0867904 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  44.58 
 
 		 338 aa  259  4e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1048  sulphate transport system permease protein 1  45.91 
 
 		 348 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  48.81 
 
 		 356 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2841  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.34 
 
 		 346 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0714016  normal  0.325359 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1159  sulphate transport system permease protein 1  44.66 
 
 		 348 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.940545 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7050  ABC transporter related  46.98 
 
 		 356 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.55 
 
 		 353 aa  256  4e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  43.82 
 
 		 346 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  43.82 
 
 		 346 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  43.82 
 
 		 346 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5731  ABC transporter-related protein  46.15 
 
 		 343 aa  256  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.99 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.33 
 
 		 352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0869  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.99 
 
 		 371 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0621  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.82 
 
 		 348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0827201  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.75 
 
 		 354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4710  ABC transporter related  45.65 
 
 		 359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0388309 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.75 
 
 		 357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1181  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  45.98 
 
 		 348 aa  253  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0701  sulfate ABC transporter ATP-binding protein  50.18 
 
 		 348 aa  253  3e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1009  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.32 
 
 		 382 aa  253  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.193299 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.26 
 
 		 353 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  47.15 
 
 		 358 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2107  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.91 
 
 		 363 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.02 
 
 		 373 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  42.27 
 
 		 348 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3984  ABC transporter related  43.8 
 
 		 354 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  45.83 
 
 		 359 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0023  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.03 
 
 		 447 aa  252  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.85 
 
 		 353 aa  252  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  45.02 
 
 		 357 aa  252  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  43.27 
 
 		 353 aa  252  7e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  40.51 
 
 		 367 aa  251  9.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1719  ABC transporter related  48.6 
 
 		 364 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4565  ABC transporter related  46.75 
 
 		 361 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.155575 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5390  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.22 
 
 		 345 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5075  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.31 
 
 		 329 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207952  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5168  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.31 
 
 		 329 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.01 
 
 		 329 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  45.28 
 
 		 352 aa  250  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  43.12 
 
 		 349 aa  250  3e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4194  ABC transporter related  47.08 
 
 		 361 aa  250  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.812216  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2606  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.02 
 
 		 388 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.115233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2567  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.02 
 
 		 388 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571516  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5048  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.41 
 
 		 338 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2612  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.02 
 
 		 388 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  39.24 
 
 		 350 aa  249  4e-65  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1170  ABC transporter related  46.37 
 
 		 347 aa  249  4e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257531  normal  0.0522399 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.17 
 
 		 362 aa  249  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  45.87 
 
 		 357 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1196  ABC transporter related  42.53 
 
 		 374 aa  249  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0565539  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.88 
 
 		 423 aa  249  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.94 
 
 		 408 aa  249  5e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.33 
 
 		 378 aa  249  5e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1548  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.2 
 
 		 361 aa  249  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2898  ABC transporter related  44.79 
 
 		 366 aa  249  5e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00959734 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.25 
 
 		 373 aa  249  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>