More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA3076 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA3076  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
342 aa  669    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1540  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
342 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2834  ABC transporter, ATP-binding protein  95.32 
 
 
342 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0496  ABC transporter, ATP-binding protein  99.71 
 
 
342 aa  665    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.607751  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1406  ABC transporter, ATP-binding protein  99.71 
 
 
342 aa  667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1413  ABC transporter, ATP-binding protein  99.71 
 
 
342 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11782  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0657  ABC transporter, ATP-binding protein  99.71 
 
 
342 aa  665    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1210  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
382 aa  673    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.451725  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1113  ABC transporter related  85.96 
 
 
343 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1114  ABC transporter related  85.67 
 
 
343 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0746662  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2077  ABC transporter related  85.04 
 
 
343 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880464  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4340  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  84.75 
 
 
343 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0750  ABC transporter related  83.87 
 
 
343 aa  567  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1231  ABC transporter related  83.87 
 
 
343 aa  567  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328222  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1205  ABC transporter related  83.87 
 
 
343 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226177  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1504  ABC transporter related  76.57 
 
 
350 aa  527  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.310407  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1465  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  75 
 
 
352 aa  514  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476678  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2651  ABC transporter related  75 
 
 
348 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220335  normal  0.549326 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1794  ABC transporter ATP-binding protein  64.37 
 
 
359 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.507378  normal  0.0198791 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1415  ABC transporter related  62.72 
 
 
353 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1456  ABC transporter related  62.14 
 
 
353 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0461545 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.73 
 
 
352 aa  361  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1270  ABC transporter related  56.5 
 
 
361 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  55.89 
 
 
353 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2149  ABC transporter related  57.57 
 
 
353 aa  342  7e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  53.76 
 
 
353 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5851  ABC transporter ATP-binding protein  53.27 
 
 
351 aa  325  8.000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228594  normal  0.59498 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0489  ABC transporter, ATP-binding protein  50.58 
 
 
347 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4692  ABC transporter  50.44 
 
 
343 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3315  ABC transporter related  51.33 
 
 
342 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0775191  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3121  ABC transporter related  52.6 
 
 
353 aa  294  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1262  ABC transporter related  49.42 
 
 
353 aa  285  8e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0942202  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  53.28 
 
 
353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.03 
 
 
352 aa  271  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000146357  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.67 
 
 
370 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.27 
 
 
372 aa  266  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  43.14 
 
 
353 aa  264  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  42.17 
 
 
350 aa  263  2e-69  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.8 
 
 
353 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3457  ABC transporter-related protein  51.26 
 
 
361 aa  263  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.861719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  45.37 
 
 
353 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  43.87 
 
 
356 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.87 
 
 
353 aa  260  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.87 
 
 
353 aa  259  4e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.06 
 
 
359 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.98 
 
 
345 aa  259  6e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  44.83 
 
 
344 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2375  ABC transporter related protein  45.16 
 
 
347 aa  258  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  45.05 
 
 
353 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 
353 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.87 
 
 
356 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  39.87 
 
 
352 aa  256  4e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  52.92 
 
 
373 aa  256  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  44.98 
 
 
349 aa  256  5e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.86 
 
 
352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  47.4 
 
 
353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  46.93 
 
 
347 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5048  ABC transporter related  43.93 
 
 
353 aa  253  3e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6495  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subuni  47.74 
 
 
363 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00108839  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1829  ABC transporter related protein  39.17 
 
 
376 aa  252  6e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000162246  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.83 
 
 
372 aa  252  6e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  44.67 
 
 
341 aa  251  9.000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  52.33 
 
 
363 aa  251  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  43.9 
 
 
366 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  47.74 
 
 
363 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4651  ABC transporter related  46.91 
 
 
367 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0595  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.69 
 
 
347 aa  250  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
349 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  46.79 
 
 
360 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0662  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  39.14 
 
 
347 aa  249  4e-65  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3984  ABC transporter related  41.97 
 
 
354 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  45.85 
 
 
349 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.53 
 
 
348 aa  248  9e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000472739  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31750  sulfate ABC transporter  46.18 
 
 
323 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  49.32 
 
 
362 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.75 
 
 
354 aa  248  1e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4348  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.11 
 
 
332 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  44.9 
 
 
329 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  40.29 
 
 
348 aa  247  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2140  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51 
 
 
378 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0391853 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1327  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51 
 
 
378 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.657677  normal  0.141247 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  47.16 
 
 
352 aa  248  2e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1958  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51 
 
 
378 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1343  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  51 
 
 
378 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.416806 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1305  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  52.3 
 
 
378 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.6 
 
 
368 aa  247  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  44.9 
 
 
329 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4660  ABC transporter related  48.36 
 
 
347 aa  246  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1548  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.14 
 
 
361 aa  246  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3890  ABC transporter-related protein  46.39 
 
 
354 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  44.13 
 
 
373 aa  246  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0079  sulfate/thiosulfate transporter subunit  50.41 
 
 
377 aa  246  4e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.58607  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0584  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.39 
 
 
348 aa  246  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  39.41 
 
 
348 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0559  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.3 
 
 
327 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.387345 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3396  ABC opine/polyamine transporter, ATPase subunit  45.63 
 
 
372 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2995  ABC transporter related protein  45.48 
 
 
384 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.264581  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  39.71 
 
 
348 aa  244  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3337  ABC transporter related  44.95 
 
 
367 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0390  ABC transporter related  47.59 
 
 
352 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.911608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>