More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1719 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1719  ABC transporter related  100 
 
 		 364 aa  719    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.430519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1407  ABC transporter related protein  61.13 
 
 		 358 aa  418  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5875  ABC transporter related protein  60.94 
 
 		 351 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0109503  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2554  ABC transporter related  57.98 
 
 		 369 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.118826 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  44.9 
 
 		 359 aa  301  2e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  45.89 
 
 		 363 aa  295  9e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0669  ABC transporter related protein  48.31 
 
 		 352 aa  293  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.324815 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.28 
 
 		 356 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.28 
 
 		 356 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  46.22 
 
 		 355 aa  293  4e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  47.95 
 
 		 353 aa  292  5e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.28 
 
 		 356 aa  292  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  48.7 
 
 		 357 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0170  ABC transporter related protein  47.49 
 
 		 360 aa  291  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.73 
 
 		 356 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  45.32 
 
 		 355 aa  290  3e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3141  sugar ABC transporter  50.76 
 
 		 352 aa  290  4e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2621  ABC transporter-related protein  49.7 
 
 		 353 aa  289  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.295311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5388  ABC transporter related  47.54 
 
 		 352 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.73 
 
 		 356 aa  288  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4396  ABC transporter related protein  45.99 
 
 		 385 aa  287  2e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.510739  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0094  ABC sorbitol/mannitol transporter, ATPase subunit  44.9 
 
 		 332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2950  ABC transporter related protein  50.83 
 
 		 371 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0785  ABC transporter related  49.19 
 
 		 375 aa  286  4e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0425622  normal  0.0557352 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  46.36 
 
 		 365 aa  286  4e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  45.66 
 
 		 352 aa  285  7e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1416  ABC transporter related  47.81 
 
 		 347 aa  285  7e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  46.22 
 
 		 350 aa  285  8e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  47.81 
 
 		 375 aa  285  8e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1730  ABC transporter related  44.9 
 
 		 332 aa  285  8e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0971  ABC transporter related  46.58 
 
 		 334 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.103941 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4119  ABC transporter related  45.43 
 
 		 338 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.430229  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  45.53 
 
 		 353 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  51.18 
 
 		 374 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  46.47 
 
 		 363 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  44.41 
 
 		 357 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  47.74 
 
 		 371 aa  284  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.43 
 
 		 369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  42.7 
 
 		 370 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  42.15 
 
 		 365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.42 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.88 
 
 		 369 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0428  ABC transporter related  44.67 
 
 		 334 aa  283  5.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.370162  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  45.51 
 
 		 353 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  42.86 
 
 		 363 aa  282  7.000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.63 
 
 		 356 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  43.65 
 
 		 349 aa  282  8.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  50.45 
 
 		 352 aa  281  8.000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4455  ABC transporter related protein  49.69 
 
 		 378 aa  282  8.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  43.92 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.63 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  43.92 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  44.82 
 
 		 360 aa  281  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.92 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  44.19 
 
 		 353 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  44.13 
 
 		 332 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  46.71 
 
 		 393 aa  281  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3778  ABC transporter related  48.51 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.37317  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.92 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12847  sn-glycerol-3-phosphate transport ATP-binding protein ABC transporter ugpC  48.25 
 
 		 360 aa  281  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  44.12 
 
 		 363 aa  281  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2293  ABC transporter-related protein  44.72 
 
 		 359 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.925018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4829  ABC transporter-like  45.51 
 
 		 366 aa  280  2e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0222578 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  43.05 
 
 		 386 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4087  ABC transporter related  49.69 
 
 		 355 aa  280  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  47.52 
 
 		 375 aa  280  2e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  46.78 
 
 		 363 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.92 
 
 		 356 aa  281  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  47.38 
 
 		 374 aa  280  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.92 
 
 		 356 aa  280  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2287  ABC transporter related  51.17 
 
 		 362 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.286788 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2238  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 384 aa  280  3e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  43.63 
 
 		 364 aa  280  3e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  48.45 
 
 		 348 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  43.63 
 
 		 364 aa  280  3e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0903  ABC transporter related  48.45 
 
 		 348 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0892  ABC transporter related  48.45 
 
 		 348 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0655  ABC transporter related  47.45 
 
 		 350 aa  279  4e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.22105 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.13 
 
 		 358 aa  280  4e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0800  ABC transporter related  46.65 
 
 		 357 aa  279  4e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1684  ABC transporter related  44.35 
 
 		 332 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.08 
 
 		 356 aa  279  4e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  43.17 
 
 		 357 aa  279  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1636  ABC transporter related protein  47.72 
 
 		 356 aa  279  5e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0515713  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1044  ABC transporter related protein  46.99 
 
 		 387 aa  279  5e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00270129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  42.49 
 
 		 370 aa  279  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  44.35 
 
 		 332 aa  279  6e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  45.98 
 
 		 364 aa  278  7e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  43.65 
 
 		 356 aa  278  8e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.67 
 
 		 367 aa  278  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  47.92 
 
 		 385 aa  278  8e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  45.14 
 
 		 358 aa  278  8e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0510  ATPase  42.72 
 
 		 392 aa  278  9e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136787  normal  0.272577 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4648  ABC transporter related protein  42.51 
 
 		 377 aa  278  9e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  43.14 
 
 		 360 aa  278  9e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1389  ABC transporter related  43.67 
 
 		 368 aa  278  9e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4505  ABC transporter  43.82 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.615344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.97 
 
 		 369 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.29 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3206  ABC transporter related  46.18 
 
 		 364 aa  278  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268123  normal  0.0421878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>