More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1547 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  100 
 
 		 353 aa  705    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  54.85 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  54.02 
 
 		 355 aa  373  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  53.59 
 
 		 363 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  49.59 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  48.9 
 
 		 366 aa  340  2e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  52.33 
 
 		 365 aa  340  2e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  50.4 
 
 		 367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  50.4 
 
 		 367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  49.19 
 
 		 370 aa  333  3e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  47.86 
 
 		 372 aa  331  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  48.64 
 
 		 370 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  47.53 
 
 		 364 aa  330  2e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1852  ABC transporter related protein  45.68 
 
 		 395 aa  330  2e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  46.67 
 
 		 372 aa  329  5.0000000000000004e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  46.74 
 
 		 369 aa  328  6e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  48.77 
 
 		 370 aa  328  7e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  48.36 
 
 		 380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0669  ABC transporter related protein  55.41 
 
 		 352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.324815 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  46.2 
 
 		 369 aa  326  3e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0010  ABC transporter related protein  45.19 
 
 		 395 aa  325  9e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  48.9 
 
 		 368 aa  324  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  49.46 
 
 		 370 aa  324  1e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  51.83 
 
 		 374 aa  322  6e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2267  ABC transporter related  46.11 
 
 		 393 aa  322  7e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  56.42 
 
 		 362 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  49.17 
 
 		 381 aa  321  9.999999999999999e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4087  ABC transporter related  48.6 
 
 		 355 aa  319  3.9999999999999996e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2640  ABC transporter related  48.59 
 
 		 349 aa  318  6e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268682  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  48.53 
 
 		 374 aa  316  4e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1407  ABC transporter related protein  49.57 
 
 		 358 aa  315  7e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  46.98 
 
 		 367 aa  315  9e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1416  ABC transporter related  48.57 
 
 		 347 aa  314  9.999999999999999e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  49.71 
 
 		 357 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  46.3 
 
 		 367 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2486  ABC transporter related  45.23 
 
 		 375 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.948028 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  47.84 
 
 		 366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  48.23 
 
 		 369 aa  313  2.9999999999999996e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1027  ABC transporter related  47.98 
 
 		 370 aa  313  3.9999999999999997e-84  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0361894 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  46.59 
 
 		 367 aa  313  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.65 
 
 		 357 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  48.61 
 
 		 356 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.65 
 
 		 357 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  45.33 
 
 		 366 aa  312  4.999999999999999e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  45.33 
 
 		 366 aa  312  4.999999999999999e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  45.75 
 
 		 367 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  45.75 
 
 		 367 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  46.96 
 
 		 367 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  46.9 
 
 		 370 aa  311  6.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  44.84 
 
 		 366 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  45.43 
 
 		 370 aa  311  9e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3652  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.37 
 
 		 357 aa  310  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.13 
 
 		 356 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  43.92 
 
 		 363 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3141  sugar ABC transporter  48.18 
 
 		 352 aa  309  4e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  48.39 
 
 		 363 aa  309  5e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 		 375 aa  308  5.9999999999999995e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.58 
 
 		 356 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2142  ABC transporter related  46.94 
 
 		 365 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0488971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.13 
 
 		 356 aa  308  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  49.01 
 
 		 353 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0242  ABC transporter related  45.09 
 
 		 377 aa  308  5.9999999999999995e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  54.98 
 
 		 356 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  46.56 
 
 		 359 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2238  ABC transporter related protein  44.88 
 
 		 384 aa  308  9e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.13 
 
 		 356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  43.99 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.99 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.99 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  43.99 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2833  ABC transporter related  46.75 
 
 		 415 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3840  ABC transporter related  44.44 
 
 		 351 aa  307  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.51 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.99 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2630  ABC transporter related  43.97 
 
 		 372 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  45.58 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  46.96 
 
 		 358 aa  306  3e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4829  ABC transporter-like  45.21 
 
 		 366 aa  306  3e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0222578 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.51 
 
 		 366 aa  306  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  45.3 
 
 		 356 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.51 
 
 		 366 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  45.3 
 
 		 356 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  48.34 
 
 		 348 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.3 
 
 		 356 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0903  ABC transporter related  48.34 
 
 		 348 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.3 
 
 		 356 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1063  ABC transporter related  45.43 
 
 		 360 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.413058  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.58 
 
 		 356 aa  305  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  43.51 
 
 		 366 aa  305  7e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  45.95 
 
 		 384 aa  305  8.000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.3 
 
 		 356 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.58 
 
 		 356 aa  305  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.65 
 
 		 361 aa  305  9.000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.24 
 
 		 366 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  46.67 
 
 		 360 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  46.69 
 
 		 366 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  46.39 
 
 		 358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  45.03 
 
 		 356 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  46.96 
 
 		 402 aa  303  2.0000000000000002e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  43.95 
 
 		 378 aa  303  2.0000000000000002e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>