More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4087 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_4087  ABC transporter related  100 
 
 
355 aa  727    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.356681 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3141  sugar ABC transporter  88.64 
 
 
352 aa  649    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2640  ABC transporter related  60.86 
 
 
349 aa  431  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268682  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4289  ABC transporter related  58.76 
 
 
354 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.385298  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1416  ABC transporter related  59.83 
 
 
347 aa  410  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10901  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  51.91 
 
 
370 aa  358  7e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  49.58 
 
 
352 aa  350  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  50.69 
 
 
363 aa  350  2e-95  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  48.32 
 
 
364 aa  346  3e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.15 
 
 
351 aa  344  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  49.58 
 
 
354 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  48.62 
 
 
369 aa  343  4e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  49.19 
 
 
367 aa  342  5e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  49.19 
 
 
367 aa  342  5e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  47.96 
 
 
367 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  47.96 
 
 
367 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  49.73 
 
 
370 aa  342  8e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  49.73 
 
 
367 aa  341  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  48.23 
 
 
370 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  47.53 
 
 
369 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  48.91 
 
 
367 aa  339  4e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  48.13 
 
 
372 aa  339  5e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  49.45 
 
 
367 aa  338  5.9999999999999996e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  48.37 
 
 
366 aa  338  7e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  48.16 
 
 
352 aa  338  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  47.53 
 
 
369 aa  338  7e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  48.74 
 
 
354 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.55 
 
 
365 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.1 
 
 
366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48.1 
 
 
366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.1 
 
 
366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.1 
 
 
366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  47.68 
 
 
370 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48.1 
 
 
366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  49.19 
 
 
366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  50 
 
 
355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3756  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.6 
 
 
356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.1 
 
 
366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.92 
 
 
366 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.1 
 
 
366 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.8 
 
 
365 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  46.7 
 
 
370 aa  336  2.9999999999999997e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.48 
 
 
365 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  49.18 
 
 
366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  47.54 
 
 
365 aa  336  5e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3928  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.31 
 
 
356 aa  335  5.999999999999999e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  47.15 
 
 
367 aa  335  9e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  48.74 
 
 
356 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.92 
 
 
369 aa  334  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.74 
 
 
356 aa  334  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.74 
 
 
356 aa  334  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2052  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.73 
 
 
367 aa  335  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117618  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  49.19 
 
 
402 aa  334  1e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 
366 aa  335  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  48.74 
 
 
356 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  49.87 
 
 
384 aa  334  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  48.75 
 
 
360 aa  333  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0674  ABC transporter related protein  48.53 
 
 
374 aa  333  2e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.290322  hitchhiker  0.000952795 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  47.35 
 
 
380 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7355  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugars)  48.44 
 
 
350 aa  332  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.216197  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3866  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.03 
 
 
356 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  49.58 
 
 
354 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  48.43 
 
 
361 aa  332  7.000000000000001e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0265  ABC transporter related protein  48.46 
 
 
356 aa  332  8e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  48.25 
 
 
372 aa  332  8e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3823  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.46 
 
 
356 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  49.73 
 
 
374 aa  332  9e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  50.43 
 
 
366 aa  331  1e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  48.6 
 
 
355 aa  331  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  48.03 
 
 
353 aa  331  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  50.41 
 
 
358 aa  331  1e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.42 
 
 
377 aa  330  2e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  50.28 
 
 
356 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  47.67 
 
 
364 aa  330  2e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3745  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.75 
 
 
356 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0800  ABC transporter related  47.78 
 
 
357 aa  331  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  61.45 
 
 
370 aa  330  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3873  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.46 
 
 
356 aa  330  2e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3853  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.19 
 
 
356 aa  330  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.609605 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  47.41 
 
 
364 aa  330  3e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  45.58 
 
 
363 aa  330  3e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3729  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.46 
 
 
356 aa  330  3e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3925  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.75 
 
 
356 aa  329  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  46.35 
 
 
355 aa  329  4e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  48.19 
 
 
374 aa  329  4e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  48.33 
 
 
373 aa  329  4e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  47.14 
 
 
364 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  49.33 
 
 
364 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3959  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.28 
 
 
357 aa  329  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0994665  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4764  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.46 
 
 
356 aa  329  6e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.257443 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0259  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.28 
 
 
357 aa  329  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  47.47 
 
 
353 aa  328  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
345 aa  329  6e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  47.18 
 
 
349 aa  328  9e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  47.11 
 
 
373 aa  328  9e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  46.35 
 
 
355 aa  328  9e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  50.42 
 
 
368 aa  328  9e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  50.29 
 
 
353 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  47.4 
 
 
364 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4721  ABC transporter related  50 
 
 
353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>