More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1716 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1702  ABC transporter related  83.47 
 
 
366 aa  636    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  100 
 
 
365 aa  746    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  52.07 
 
 
367 aa  374  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  52.07 
 
 
367 aa  374  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  50 
 
 
355 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  48.9 
 
 
355 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  49.73 
 
 
369 aa  352  7e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  48.76 
 
 
367 aa  351  1e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.74 
 
 
366 aa  349  4e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  47.01 
 
 
366 aa  349  6e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 
366 aa  349  6e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 
366 aa  349  6e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  47.01 
 
 
366 aa  349  6e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 
366 aa  349  6e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.74 
 
 
366 aa  348  7e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.74 
 
 
366 aa  348  9e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  46.2 
 
 
366 aa  348  9e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  49.18 
 
 
363 aa  348  1e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  48.35 
 
 
363 aa  348  1e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  49.59 
 
 
353 aa  347  2e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.47 
 
 
366 aa  346  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  46.47 
 
 
369 aa  344  1e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  46.88 
 
 
369 aa  344  2e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  45.26 
 
 
386 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  49.31 
 
 
370 aa  343  2e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  46.32 
 
 
366 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  46.72 
 
 
380 aa  342  7e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  48.91 
 
 
366 aa  341  9e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1925  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.4 
 
 
377 aa  340  2e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  44.99 
 
 
386 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  45.95 
 
 
384 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  46.59 
 
 
370 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  44.2 
 
 
389 aa  335  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  45.68 
 
 
384 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  47.5 
 
 
373 aa  335  5.999999999999999e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  44.59 
 
 
384 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0170  ABC transporter related protein  45.33 
 
 
360 aa  335  9e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  45.21 
 
 
364 aa  334  1e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  49.46 
 
 
370 aa  332  6e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  46.59 
 
 
370 aa  332  9e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  44.17 
 
 
384 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  46.22 
 
 
370 aa  330  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  43.13 
 
 
386 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  46.07 
 
 
372 aa  329  5.0000000000000004e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  48.17 
 
 
356 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  43.4 
 
 
386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  47.33 
 
 
372 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  46.52 
 
 
402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  44.6 
 
 
381 aa  326  3e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  45.68 
 
 
361 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  44.54 
 
 
367 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  45.23 
 
 
367 aa  326  5e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  45.23 
 
 
367 aa  325  6e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  45.23 
 
 
370 aa  325  7e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  44.85 
 
 
378 aa  325  8.000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  45.16 
 
 
369 aa  325  9e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  45.88 
 
 
365 aa  323  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  44.68 
 
 
371 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  44.68 
 
 
371 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0242  ABC transporter related  45.72 
 
 
377 aa  323  3e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  46.72 
 
 
366 aa  322  5e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  44.41 
 
 
371 aa  322  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  46.72 
 
 
366 aa  322  5e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  46.03 
 
 
374 aa  322  6e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  47.15 
 
 
426 aa  322  6e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  45.87 
 
 
376 aa  322  7e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  43.75 
 
 
381 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  44.78 
 
 
354 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2640  ABC transporter related  45.18 
 
 
349 aa  320  3.9999999999999996e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268682  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  45.26 
 
 
368 aa  319  6e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3448  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.88 
 
 
371 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130307  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  43.44 
 
 
371 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  45.8 
 
 
363 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  44.86 
 
 
384 aa  317  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2849  ABC transporter-related protein  45.48 
 
 
377 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0912709 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.88 
 
 
360 aa  316  4e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  45.63 
 
 
356 aa  316  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3666  ABC transporter related  44.23 
 
 
365 aa  316  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  48.05 
 
 
366 aa  316  5e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  43.88 
 
 
372 aa  315  6e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.88 
 
 
360 aa  315  6e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  43.88 
 
 
372 aa  315  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  43.88 
 
 
372 aa  315  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3167  ABC transporter related  43.32 
 
 
370 aa  315  9e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  45.6 
 
 
360 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  45.6 
 
 
360 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.35 
 
 
372 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1260  ABC transporter component  44.59 
 
 
372 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  46.88 
 
 
366 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1107  ABC transporter related  45.03 
 
 
357 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0772086  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  45.6 
 
 
360 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  43.62 
 
 
371 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  44.23 
 
 
374 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  44.35 
 
 
353 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  44.63 
 
 
353 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.33 
 
 
360 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7821  ABC transporter ATP-binding protein  45.56 
 
 
363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  44.14 
 
 
360 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 
360 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0077  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.38 
 
 
365 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>