More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0077 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0077  ABC sugar transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 365 aa  743    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  49.33 
 
 		 369 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  49.6 
 
 		 369 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  50.41 
 
 		 370 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  50.28 
 
 		 367 aa  362  6e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  49.44 
 
 		 367 aa  361  1e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  49.44 
 
 		 367 aa  361  1e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  48.9 
 
 		 370 aa  360  2e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  49.58 
 
 		 367 aa  358  8e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  49.45 
 
 		 372 aa  358  9.999999999999999e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  49.03 
 
 		 370 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  50.27 
 
 		 368 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  48.61 
 
 		 369 aa  355  8.999999999999999e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  50.28 
 
 		 402 aa  353  2.9999999999999997e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  49.17 
 
 		 384 aa  352  4e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  47.65 
 
 		 366 aa  353  4e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  49.86 
 
 		 371 aa  352  5e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  47.92 
 
 		 370 aa  351  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  47.06 
 
 		 364 aa  350  2e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  47.21 
 
 		 364 aa  350  2e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  48.9 
 
 		 370 aa  350  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  47.25 
 
 		 372 aa  348  6e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  50.55 
 
 		 374 aa  348  6e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1671  ABC transporter related  48.25 
 
 		 373 aa  347  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  47.06 
 
 		 364 aa  348  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  47.06 
 
 		 364 aa  348  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  48.34 
 
 		 370 aa  348  1e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  50.28 
 
 		 367 aa  347  2e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  47.79 
 
 		 374 aa  344  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  47.43 
 
 		 364 aa  343  2e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  47.86 
 
 		 367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  49.17 
 
 		 365 aa  341  1e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  47.7 
 
 		 376 aa  340  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  48.34 
 
 		 380 aa  340  2.9999999999999998e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.32 
 
 		 360 aa  339  4e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 360 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.34 
 
 		 360 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  47.06 
 
 		 360 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  47.06 
 
 		 360 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  47.06 
 
 		 360 aa  336  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  47.71 
 
 		 363 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  46.17 
 
 		 365 aa  336  3.9999999999999995e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.78 
 
 		 372 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.78 
 
 		 372 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.78 
 
 		 379 aa  335  7e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2126  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.78 
 
 		 372 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  47.63 
 
 		 381 aa  334  1e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.78 
 
 		 372 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  47.7 
 
 		 365 aa  335  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0786  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.78 
 
 		 372 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2618  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  48.78 
 
 		 372 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.654814  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  45.73 
 
 		 367 aa  333  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  44.96 
 
 		 366 aa  333  2e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  44.96 
 
 		 366 aa  333  2e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  45.73 
 
 		 367 aa  333  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  48.51 
 
 		 379 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  47.86 
 
 		 392 aa  333  3e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.78 
 
 		 360 aa  333  4e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  43.99 
 
 		 366 aa  332  5e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  48.77 
 
 		 366 aa  332  6e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  49.04 
 
 		 352 aa  332  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.18 
 
 		 363 aa  331  9e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  48.25 
 
 		 368 aa  331  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  45.03 
 
 		 360 aa  331  1e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2907  ABC transporter related  48.49 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.147416  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  45.69 
 
 		 405 aa  331  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  46.76 
 
 		 585 aa  330  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  45.71 
 
 		 366 aa  330  3e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  45.9 
 
 		 398 aa  330  3e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  47.62 
 
 		 384 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  47.12 
 
 		 369 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0800  ABC transporter related  50.41 
 
 		 357 aa  328  7e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  47.35 
 
 		 384 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.55 
 
 		 370 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  47.55 
 
 		 370 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  47.55 
 
 		 370 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  47.55 
 
 		 370 aa  328  9e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  47.55 
 
 		 370 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  47.55 
 
 		 370 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4074  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.7 
 
 		 372 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.785195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  46.32 
 
 		 371 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  49.45 
 
 		 354 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  47.55 
 
 		 388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0831  ABC transporter related  47.57 
 
 		 371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0843  ABC transporter related  47.57 
 
 		 371 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.811214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  48.63 
 
 		 353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  46.52 
 
 		 389 aa  326  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  45.18 
 
 		 367 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  45.18 
 
 		 366 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  47.35 
 
 		 384 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.66 
 
 		 366 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  46.54 
 
 		 386 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  52.68 
 
 		 406 aa  325  9e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  44.66 
 
 		 366 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.66 
 
 		 366 aa  325  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.66 
 
 		 366 aa  325  1e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.66 
 
 		 366 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  45.11 
 
 		 364 aa  324  1e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  47.7 
 
 		 372 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.66 
 
 		 366 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>