More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3666 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4866  ABC transporter related  95.34 
 
 
365 aa  720    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.112341 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3666  ABC transporter related  100 
 
 
365 aa  751    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  52.75 
 
 
363 aa  378  1e-103  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  51.52 
 
 
364 aa  372  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  50.41 
 
 
367 aa  360  2e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  50.41 
 
 
367 aa  360  2e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  50.68 
 
 
370 aa  355  8.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  50 
 
 
354 aa  354  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  47.79 
 
 
353 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4721  ABC transporter related  51.25 
 
 
353 aa  352  7e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  49.05 
 
 
369 aa  352  8e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  48.34 
 
 
366 aa  351  1e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  48.34 
 
 
366 aa  351  1e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  49.33 
 
 
372 aa  350  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  47.15 
 
 
369 aa  350  2e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  49.59 
 
 
370 aa  349  3e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  50.14 
 
 
365 aa  349  5e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  47.43 
 
 
369 aa  349  5e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  48.78 
 
 
370 aa  348  8e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  48.07 
 
 
353 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  51.41 
 
 
353 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  47.55 
 
 
367 aa  346  4e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  47.97 
 
 
374 aa  346  4e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  49.19 
 
 
384 aa  345  5e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  47.96 
 
 
366 aa  345  8e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6524  ABC transporter related  49.18 
 
 
366 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.113539 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  46.85 
 
 
364 aa  344  1e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.79 
 
 
369 aa  344  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  46.85 
 
 
364 aa  344  2e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2142  ABC transporter related  48.08 
 
 
365 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0488971  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  46.85 
 
 
364 aa  343  4e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  48.23 
 
 
368 aa  342  5e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  46.85 
 
 
364 aa  341  1e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  50 
 
 
402 aa  341  1e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  48.52 
 
 
369 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  50.28 
 
 
355 aa  340  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  46.3 
 
 
371 aa  340  2e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  48.77 
 
 
367 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  47.68 
 
 
380 aa  340  2.9999999999999998e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1671  ABC transporter related  46.69 
 
 
366 aa  339  4e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  47.71 
 
 
372 aa  339  4e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  48.66 
 
 
367 aa  339  5.9999999999999996e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1671  ABC transporter related  48.92 
 
 
373 aa  338  9e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  49.18 
 
 
369 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  49.03 
 
 
355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  46.47 
 
 
365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  49.16 
 
 
353 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  48.49 
 
 
356 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  48.78 
 
 
367 aa  337  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.94 
 
 
351 aa  335  7e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  49.44 
 
 
354 aa  335  9e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  48.74 
 
 
355 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0329  ABC transporter related  46.49 
 
 
379 aa  334  1e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.939732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7821  ABC transporter ATP-binding protein  48.07 
 
 
363 aa  333  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  47.95 
 
 
356 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  47.24 
 
 
381 aa  333  3e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  46.41 
 
 
359 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  48.24 
 
 
370 aa  332  5e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.48 
 
 
363 aa  332  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4120  sn-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  47.54 
 
 
366 aa  332  8e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0441125  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0496  ABC transporter related  48.51 
 
 
371 aa  331  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0408811 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  45.99 
 
 
380 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  47.24 
 
 
374 aa  330  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  47.4 
 
 
360 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  46.81 
 
 
386 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  47.09 
 
 
386 aa  329  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  48.75 
 
 
357 aa  329  6e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1095  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.07 
 
 
365 aa  329  6e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107412  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  48.58 
 
 
380 aa  328  7e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  46.41 
 
 
356 aa  328  7e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.1 
 
 
363 aa  328  9e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  46.96 
 
 
357 aa  328  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  47.38 
 
 
386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  49.31 
 
 
368 aa  328  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  48.6 
 
 
355 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  48.06 
 
 
355 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0662  ABC transporter related  47.43 
 
 
366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  45.38 
 
 
366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  46.77 
 
 
370 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1188  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.49 
 
 
365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.27267  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.38 
 
 
366 aa  326  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  46.28 
 
 
389 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  47.77 
 
 
354 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  47.31 
 
 
370 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  46.99 
 
 
357 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  47.44 
 
 
392 aa  325  5e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  46.58 
 
 
360 aa  325  6e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  47.4 
 
 
356 aa  325  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3141  sugar ABC transporter  46.83 
 
 
352 aa  325  6e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.204703  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  61.26 
 
 
406 aa  325  7e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.28 
 
 
366 aa  325  7e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0408  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.04 
 
 
366 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  47.53 
 
 
357 aa  325  8.000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  44.69 
 
 
404 aa  324  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.28 
 
 
366 aa  324  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  47.53 
 
 
358 aa  325  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.11 
 
 
366 aa  324  1e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  47.06 
 
 
366 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  46.36 
 
 
384 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  44.55 
 
 
410 aa  323  3e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>