More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0903 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0886  ABC transporter related  100 
 
 
348 aa  688    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0903  ABC transporter related  100 
 
 
348 aa  688    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0892  ABC transporter related  99.71 
 
 
348 aa  686    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2417  ABC transporter related  57.67 
 
 
350 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.830263  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2462  ABC transporter related  57.67 
 
 
350 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2456  ABC transporter related  57.67 
 
 
350 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.913422  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2621  ABC transporter-related protein  56.74 
 
 
353 aa  388  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.295311  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3778  ABC transporter related  55.62 
 
 
356 aa  383  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.37317  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3680  ABC transporter related  52.73 
 
 
364 aa  350  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  52.78 
 
 
368 aa  334  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  48.61 
 
 
357 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0859  ABC transporter related  51.3 
 
 
335 aa  330  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0788  ABC transporter related  51.3 
 
 
335 aa  329  4e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  48.62 
 
 
357 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.58 
 
 
351 aa  328  9e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3707  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.83 
 
 
349 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151489  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.86 
 
 
351 aa  326  5e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5207  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  51.71 
 
 
348 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.575313 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  46.96 
 
 
356 aa  324  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  47.54 
 
 
363 aa  323  3e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  48.09 
 
 
371 aa  322  7e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  52.25 
 
 
351 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  46.94 
 
 
355 aa  320  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.64 
 
 
351 aa  319  5e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  49.46 
 
 
374 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  50.14 
 
 
353 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  50 
 
 
357 aa  317  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sorbitol/mannitol)  50.3 
 
 
332 aa  317  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0620  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.64 
 
 
351 aa  317  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6262  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.29 
 
 
344 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.543134 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  44.62 
 
 
367 aa  316  4e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3672  ABC transporter related protein  47.53 
 
 
363 aa  315  6e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0183  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  49.86 
 
 
364 aa  315  7e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65025  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0377  ABC transporter related protein  50.54 
 
 
375 aa  315  7e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101699  normal  0.0235705 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1287  ABC transporter related  48.82 
 
 
338 aa  315  9e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0918  putative ABC transporter, ATP-binding protein  50.6 
 
 
335 aa  315  9e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574216  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06399  hypothetical protein  47.65 
 
 
385 aa  315  9e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0650  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  50.42 
 
 
364 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  48.32 
 
 
351 aa  315  9.999999999999999e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  48.62 
 
 
353 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1284  ABC transporter related  49.43 
 
 
345 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.28 
 
 
362 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1821  ABC transporter related  47.59 
 
 
382 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3447  ABC transporter related  49.55 
 
 
332 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3512  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  47.55 
 
 
362 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362101  normal  0.0791586 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3523  ABC transporter related  47.24 
 
 
363 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  45.09 
 
 
372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2078  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  48.03 
 
 
349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  47.91 
 
 
356 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  47.01 
 
 
405 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  47.01 
 
 
405 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2293  ABC transporter-related protein  46.03 
 
 
359 aa  312  6.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.925018  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  48.88 
 
 
353 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3749  ABC transporter related  50 
 
 
332 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  48.06 
 
 
388 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  46.69 
 
 
354 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0633  ABC transporter related  46.26 
 
 
379 aa  311  1e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5254  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  47.74 
 
 
370 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  45.31 
 
 
367 aa  311  1e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  45.31 
 
 
367 aa  311  1e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  48.84 
 
 
393 aa  311  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  45.16 
 
 
369 aa  311  1e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  47.92 
 
 
352 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  46.75 
 
 
405 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  45.84 
 
 
381 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0068  ABC transporter, ATP-binding protein  46.72 
 
 
375 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0372334 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.01 
 
 
366 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3780  ABC transporter related  50.89 
 
 
332 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.567955  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3653  ABC transporter-related protein  49.01 
 
 
338 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0855337  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  48.89 
 
 
355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.01 
 
 
366 aa  309  4e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  46.7 
 
 
354 aa  309  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0854  ABC transporter related  48.55 
 
 
340 aa  309  5e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  45.28 
 
 
366 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.28 
 
 
366 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.28 
 
 
366 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2049  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.13 
 
 
369 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  45.28 
 
 
366 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.28 
 
 
366 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  46.09 
 
 
353 aa  308  6.999999999999999e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.47 
 
 
366 aa  308  8e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5360  ABC transporter related  47.65 
 
 
368 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0987368  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  44.47 
 
 
366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2765  ABC transporter related  44.81 
 
 
373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  46.59 
 
 
360 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  43.49 
 
 
355 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4137  ABC transporter related  49.13 
 
 
335 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4396  ABC transporter related protein  44.5 
 
 
385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.510739  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7821  ABC transporter ATP-binding protein  45.65 
 
 
363 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  47.71 
 
 
381 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.47 
 
 
366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  44.05 
 
 
365 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0655  ABC transporter related  48.01 
 
 
350 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.22105 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  43.72 
 
 
393 aa  307  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  45.31 
 
 
382 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  45.81 
 
 
373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.425612 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  46.13 
 
 
356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3000  ABC transporter related  46.98 
 
 
356 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2523  ABC transporter related  44.2 
 
 
383 aa  306  3e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.299517 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  46.72 
 
 
375 aa  306  3e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>